More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4352 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00014  molecular chaperone DnaK  53.83 
 
 
638 aa  659    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3583  chaperone protein DnaK  53.83 
 
 
638 aa  659    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766663  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0675  molecular chaperone DnaK  57.24 
 
 
658 aa  665    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.549648  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1399  molecular chaperone DnaK  57.8 
 
 
637 aa  712    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0033  molecular chaperone DnaK  60.44 
 
 
636 aa  754    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1208  molecular chaperone DnaK  56.47 
 
 
640 aa  674    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.48647 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0628  molecular chaperone DnaK  56.88 
 
 
646 aa  705    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0264746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1148  molecular chaperone DnaK  59.97 
 
 
609 aa  721    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1856  dnaK protein  55.42 
 
 
641 aa  684    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26903  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0928  molecular chaperone DnaK  53.44 
 
 
640 aa  674    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.689493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2635  molecular chaperone DnaK  54.95 
 
 
688 aa  674    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0170334  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4395  molecular chaperone DnaK  59.93 
 
 
611 aa  712    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00031537  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0097  molecular chaperone DnaK  57.35 
 
 
609 aa  669    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2125  molecular chaperone DnaK  58.81 
 
 
637 aa  710    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.864242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4213  molecular chaperone DnaK  60.42 
 
 
611 aa  712    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000284516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4051  molecular chaperone DnaK  60.42 
 
 
611 aa  712    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4061  molecular chaperone DnaK  60.42 
 
 
611 aa  712    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000542106  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2326  molecular chaperone DnaK  56.74 
 
 
650 aa  664    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0196  molecular chaperone DnaK  77.54 
 
 
613 aa  967    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1313  molecular chaperone DnaK  58.73 
 
 
630 aa  729    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.634921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2785  molecular chaperone DnaK  55.56 
 
 
647 aa  672    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134796  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3433  molecular chaperone DnaK  60.39 
 
 
620 aa  731    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0457031  normal  0.0513788 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1538  molecular chaperone protein DnaK  55.47 
 
 
639 aa  673    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.163821 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0197  molecular chaperone DnaK  59.17 
 
 
630 aa  706    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432012  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0141  molecular chaperone DnaK  57.69 
 
 
629 aa  712    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0295  molecular chaperone DnaK  60.66 
 
 
633 aa  729    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0378  molecular chaperone DnaK  55.46 
 
 
653 aa  662    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3322  molecular chaperone DnaK  56.74 
 
 
650 aa  663    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2811  heat shock protein Hsp70  54.95 
 
 
640 aa  667    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0535458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0763  molecular chaperone DnaK  54.77 
 
 
638 aa  659    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.240702  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1173  molecular chaperone DnaK  56.65 
 
 
636 aa  686    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0107  molecular chaperone DnaK  59.97 
 
 
634 aa  746    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0126383  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0621  molecular chaperone DnaK  55.35 
 
 
637 aa  690    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2303  molecular chaperone DnaK  60.03 
 
 
639 aa  722    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1893  molecular chaperone DnaK  57.73 
 
 
637 aa  698    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.457552  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2674  molecular chaperone DnaK  59.57 
 
 
637 aa  714    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3532  molecular chaperone DnaK  60.16 
 
 
638 aa  746    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00119444  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1023  molecular chaperone DnaK  56.67 
 
 
637 aa  693    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0870  heat shock protein Hsp70  55.49 
 
 
638 aa  662    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100089  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4539  molecular chaperone DnaK  60.42 
 
 
611 aa  712    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000969384  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1644  molecular chaperone DnaK  54.99 
 
 
628 aa  662    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000171491  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1797  molecular chaperone DnaK  57.17 
 
 
645 aa  725    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0693908  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2468  molecular chaperone DnaK  61.45 
 
 
634 aa  750    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.501675  hitchhiker  0.000000000338371 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2239  molecular chaperone DnaK  53.33 
 
 
644 aa  665    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0425957  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3555  molecular chaperone DnaK  57.03 
 
 
639 aa  695    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0866908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  64.24 
 
 
612 aa  751    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1308  molecular chaperone DnaK  56.41 
 
 
650 aa  661    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.395339  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1580  chaperone DnaK  58.7 
 
 
632 aa  673    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308505  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4328  molecular chaperone DnaK  55.79 
 
 
609 aa  671    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.977158  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2173  molecular chaperone DnaK  59.45 
 
 
641 aa  657    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.232061  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4352  molecular chaperone DnaK  100 
 
 
616 aa  1243    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0429  molecular chaperone DnaK  57.82 
 
 
633 aa  710    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2054  molecular chaperone DnaK  58.4 
 
 
635 aa  699    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0128  chaperone DnaK  58.69 
 
 
610 aa  710    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.438221  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0212  molecular chaperone DnaK  57.48 
 
 
639 aa  679    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1969  molecular chaperone DnaK  55.57 
 
 
651 aa  673    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00608101  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0329  molecular chaperone DnaK  59.17 
 
 
632 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813132  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0751  chaperone DnaK  56.78 
 
 
640 aa  679    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.805739  normal  0.219742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3961  molecular chaperone DnaK  56.09 
 
 
653 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727521  normal  0.0784984 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1312  molecular chaperone DnaK  59.46 
 
 
620 aa  714    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.975938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0391  molecular chaperone DnaK  57.66 
 
 
633 aa  709    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0155  molecular chaperone DnaK  59.83 
 
 
632 aa  711    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2922  molecular chaperone DnaK  55.16 
 
 
648 aa  676    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797914  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0982  molecular chaperone DnaK  56.97 
 
 
644 aa  703    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000339197  unclonable  0.0000180058 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0010  molecular chaperone DnaK  57.76 
 
 
642 aa  698    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0949466  normal  0.47597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0402  molecular chaperone DnaK  56.61 
 
 
643 aa  696    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.362768  normal  0.130805 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2058  molecular chaperone DnaK  59.84 
 
 
634 aa  746    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0462  molecular chaperone DnaK  75.43 
 
 
622 aa  892    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0589911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0784  chaperone DnaK  62.94 
 
 
636 aa  771    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0679  molecular chaperone DnaK  58.96 
 
 
636 aa  719    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470568  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3101  molecular chaperone DnaK  55.34 
 
 
632 aa  664    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2290  molecular chaperone DnaK  62.67 
 
 
619 aa  743    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  60.1 
 
 
619 aa  749    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1306  molecular chaperone DnaK  58.16 
 
 
638 aa  709    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35463  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1900  molecular chaperone DnaK  55.3 
 
 
671 aa  683    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.393588  normal  0.969601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0490  chaperone protein DnaK  59.27 
 
 
623 aa  705    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000032469  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  60.49 
 
 
610 aa  741    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3001  chaperone protein DnaK  57.55 
 
 
636 aa  673    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0646  molecular chaperone DnaK  56.25 
 
 
650 aa  658    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62970  molecular chaperone DnaK  55.33 
 
 
637 aa  677    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0423823  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1027  molecular chaperone DnaK  60.67 
 
 
607 aa  694    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0288585  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1309  molecular chaperone  57.38 
 
 
617 aa  673    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0486876  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0822  molecular chaperone DnaK  59.79 
 
 
623 aa  705    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.762106 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1347  molecular chaperone DnaK  56.91 
 
 
615 aa  672    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.730753  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0163  molecular chaperone DnaK  60.07 
 
 
607 aa  673    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3808  molecular chaperone DnaK  69.39 
 
 
622 aa  872    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0731  molecular chaperone DnaK  59.66 
 
 
615 aa  708    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0260  chaperone protein DnaK  56.1 
 
 
631 aa  657    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000679049  normal  0.867364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1036  chaperone protein DnaK  58.48 
 
 
641 aa  736    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000619516  hitchhiker  0.000149965 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0510  chaperone protein DnaK  58.64 
 
 
653 aa  696    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0638299  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2115  molecular chaperone DnaK  78.8 
 
 
618 aa  953    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0501961 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1089  molecular chaperone DnaK  56.58 
 
 
626 aa  664    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000419438  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1404  molecular chaperone DnaK  59.84 
 
 
636 aa  753    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00594741  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0864  molecular chaperone DnaK  56.95 
 
 
640 aa  684    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.873902  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2302  molecular chaperone DnaK  58.13 
 
 
638 aa  698    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679983  normal  0.117002 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4363  chaperone protein DnaK  75.25 
 
 
621 aa  891    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.62994  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0473  molecular chaperone DnaK  75.43 
 
 
622 aa  892    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518143  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0634  molecular chaperone DnaK  73.75 
 
 
622 aa  908    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2166  molecular chaperone DnaK  57.35 
 
 
636 aa  699    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0684659  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1226  molecular chaperone DnaK  57.19 
 
 
654 aa  667    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0562315  normal  0.0186533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>