More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2076 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00014  molecular chaperone DnaK  52.99 
 
 
638 aa  636    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3583  chaperone protein DnaK  52.99 
 
 
638 aa  636    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766663  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0675  molecular chaperone DnaK  55.15 
 
 
658 aa  643    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.549648  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1399  molecular chaperone DnaK  52.5 
 
 
637 aa  644    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0033  molecular chaperone DnaK  53.64 
 
 
636 aa  661    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2835  molecular chaperone DnaK  54.03 
 
 
636 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195786  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1208  molecular chaperone DnaK  52.42 
 
 
640 aa  642    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.48647 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0628  molecular chaperone DnaK  53.12 
 
 
646 aa  636    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0264746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3460  chaperone protein DnaK  54.23 
 
 
612 aa  641    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3142  chaperone protein DnaK  53.99 
 
 
639 aa  649    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.105889  normal  0.238129 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1406  chaperone protein DnaK  53.33 
 
 
642 aa  637    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.343406 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2041  molecular chaperone DnaK  53.38 
 
 
637 aa  639    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2971  molecular chaperone DnaK  51.81 
 
 
639 aa  636    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0014  molecular chaperone DnaK  52.99 
 
 
638 aa  636    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18951  molecular chaperone DnaK  56.27 
 
 
635 aa  688    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2125  molecular chaperone DnaK  53.38 
 
 
637 aa  639    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.864242  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1126  molecular chaperone DnaK  52.36 
 
 
639 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30041  molecular chaperone DnaK  58.22 
 
 
637 aa  684    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.417292 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21861  molecular chaperone DnaK  56.98 
 
 
630 aa  701    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.357564  normal  0.686332 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18951  molecular chaperone DnaK  56.71 
 
 
634 aa  693    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1569  chaperone protein DnaK  58.73 
 
 
663 aa  647    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.349851  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3642  molecular chaperone DnaK  52.99 
 
 
638 aa  636    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297376  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19141  molecular chaperone DnaK  56.32 
 
 
635 aa  686    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0196  molecular chaperone DnaK  53.82 
 
 
613 aa  648    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1313  molecular chaperone DnaK  56.98 
 
 
630 aa  701    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.634921  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0014  molecular chaperone DnaK  52.99 
 
 
638 aa  636    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.720404  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0336  molecular chaperone DnaK  53.26 
 
 
631 aa  641    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0107713  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0197  molecular chaperone DnaK  54.97 
 
 
630 aa  640    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432012  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0141  molecular chaperone DnaK  58.32 
 
 
629 aa  727    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0295  molecular chaperone DnaK  58.99 
 
 
633 aa  730    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2156  molecular chaperone DnaK  52.5 
 
 
640 aa  647    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0919  molecular chaperone DnaK  57.19 
 
 
688 aa  678    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.628241  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0211  molecular chaperone DnaK  53.77 
 
 
635 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000228003  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1173  molecular chaperone DnaK  54.03 
 
 
636 aa  659    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0107  molecular chaperone DnaK  52.13 
 
 
634 aa  647    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0126383  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0621  molecular chaperone DnaK  52.25 
 
 
637 aa  641    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0070  chaperone protein DnaK  53.25 
 
 
642 aa  661    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113032  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2303  molecular chaperone DnaK  58.33 
 
 
639 aa  696    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1893  molecular chaperone DnaK  55.04 
 
 
637 aa  652    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.457552  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1403  molecular chaperone DnaK  55.7 
 
 
625 aa  653    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000203004  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2674  molecular chaperone DnaK  58.59 
 
 
637 aa  703    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3532  molecular chaperone DnaK  53.94 
 
 
638 aa  662    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00119444  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2960  chaperone protein DnaK  54.15 
 
 
639 aa  655    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1747 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0017  molecular chaperone DnaK  52.99 
 
 
638 aa  636    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00276008  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1797  molecular chaperone DnaK  56.49 
 
 
645 aa  687    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0693908  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2468  molecular chaperone DnaK  59.06 
 
 
634 aa  727    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.501675  hitchhiker  0.000000000338371 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2580  molecular chaperone DnaK  54.22 
 
 
749 aa  656    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0761  molecular chaperone DnaK  52.39 
 
 
639 aa  637    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3555  molecular chaperone DnaK  53.61 
 
 
639 aa  640    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0866908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  52.38 
 
 
612 aa  637    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2829  molecular chaperone DnaK  53.13 
 
 
639 aa  652    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000221772  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2173  molecular chaperone DnaK  56.61 
 
 
641 aa  691    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.232061  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3389  molecular chaperone DnaK  51.96 
 
 
641 aa  635    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0429  molecular chaperone DnaK  52.94 
 
 
633 aa  640    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4045  chaperone protein DnaK  58.22 
 
 
635 aa  709    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2052  chaperone protein DnaK  57.02 
 
 
633 aa  649    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0755  molecular chaperone DnaK  52.44 
 
 
640 aa  637    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.197988  normal  0.199452 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0012  molecular chaperone DnaK  52.99 
 
 
638 aa  636    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0790  molecular chaperone DnaK  54.08 
 
 
636 aa  652    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0357423  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3919  chaperone protein DnaK  54.02 
 
 
638 aa  650    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0531667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1601  molecular chaperone DnaK  57.19 
 
 
729 aa  652    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000716898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0391  molecular chaperone DnaK  52.78 
 
 
633 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4730  chaperone protein DnaK  56.86 
 
 
682 aa  674    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0155  molecular chaperone DnaK  54.97 
 
 
632 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48839  Heat Shock Protein 70, chloroplast  56.62 
 
 
695 aa  691    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0562766  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0982  molecular chaperone DnaK  54.58 
 
 
644 aa  642    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000339197  unclonable  0.0000180058 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2076  molecular chaperone DnaK  100 
 
 
629 aa  1258    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000834222  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0010  molecular chaperone DnaK  52.8 
 
 
642 aa  656    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0949466  normal  0.47597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0402  molecular chaperone DnaK  55.69 
 
 
643 aa  645    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.362768  normal  0.130805 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2058  molecular chaperone DnaK  53.31 
 
 
634 aa  653    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0350  molecular chaperone DnaK  52.88 
 
 
631 aa  638    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.759772 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0784  chaperone DnaK  56.03 
 
 
636 aa  668    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0191  molecular chaperone DnaK  54.97 
 
 
631 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.837679  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0679  molecular chaperone DnaK  53.9 
 
 
636 aa  655    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470568  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1208  molecular chaperone DnaK  51.72 
 
 
636 aa  639    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2955  chaperone protein DnaK  53.49 
 
 
634 aa  642    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3505  molecular chaperone DnaK  52.83 
 
 
640 aa  652    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00228392  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0128  chaperone protein DnaK  53.13 
 
 
632 aa  640    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860677  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1306  molecular chaperone DnaK  56.96 
 
 
638 aa  708    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35463  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4012  molecular chaperone DnaK  54.52 
 
 
670 aa  649    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0957  molecular chaperone DnaK  52.36 
 
 
639 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0995  molecular chaperone DnaK  52.36 
 
 
639 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0204392  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3574  chaperone protein DnaK  52.7 
 
 
639 aa  635    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.662017  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  53.41 
 
 
612 aa  656    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0490  chaperone protein DnaK  64.94 
 
 
623 aa  704    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000032469  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3571  molecular chaperone DnaK  52.92 
 
 
639 aa  655    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7790  chaperone protein dnaK  55.95 
 
 
629 aa  651    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0528  molecular chaperone DnaK  52.03 
 
 
635 aa  643    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0260  chaperone protein DnaK  59.08 
 
 
631 aa  691    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000679049  normal  0.867364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1036  chaperone protein DnaK  52.57 
 
 
641 aa  651    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000619516  hitchhiker  0.000149965 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0313  chaperone protein DnaK  54.39 
 
 
626 aa  654    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000265757  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0959  molecular chaperone DnaK  52.36 
 
 
639 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0334727  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2766  molecular chaperone DnaK  53.87 
 
 
636 aa  658    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1404  molecular chaperone DnaK  52.9 
 
 
636 aa  647    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00594741  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0983  molecular chaperone DnaK  53.24 
 
 
730 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2302  molecular chaperone DnaK  54.36 
 
 
638 aa  668    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679983  normal  0.117002 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4392  chaperone protein DnaK  55.17 
 
 
615 aa  644    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.253837  normal  0.258584 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18401  molecular chaperone DnaK  56.78 
 
 
634 aa  699    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.188042  normal  0.971493 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3734  chaperone protein DnaK  58.13 
 
 
622 aa  693    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3246  chaperone protein DnaK  59.2 
 
 
624 aa  694    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102286  hitchhiker  0.000258743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>