More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0196 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00014  molecular chaperone DnaK  54.27 
 
 
638 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3583  chaperone protein DnaK  54.27 
 
 
638 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766663  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0675  molecular chaperone DnaK  56.75 
 
 
658 aa  674    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.549648  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1399  molecular chaperone DnaK  57.23 
 
 
637 aa  707    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0033  molecular chaperone DnaK  60.1 
 
 
636 aa  751    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1208  molecular chaperone DnaK  57.21 
 
 
640 aa  678    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.48647 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0628  molecular chaperone DnaK  58.21 
 
 
646 aa  700    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0264746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1148  molecular chaperone DnaK  60.52 
 
 
609 aa  722    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1856  dnaK protein  53.94 
 
 
641 aa  655    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26903  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0928  molecular chaperone DnaK  57.19 
 
 
640 aa  707    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.689493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2635  molecular chaperone DnaK  55.17 
 
 
688 aa  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0170334  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4395  molecular chaperone DnaK  62.85 
 
 
611 aa  714    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00031537  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0850  molecular chaperone DnaK  56.29 
 
 
623 aa  649    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.561749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0097  molecular chaperone DnaK  61.11 
 
 
609 aa  681    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2125  molecular chaperone DnaK  60.27 
 
 
637 aa  702    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.864242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4213  molecular chaperone DnaK  62.85 
 
 
611 aa  713    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000284516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4051  molecular chaperone DnaK  62.85 
 
 
611 aa  713    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4061  molecular chaperone DnaK  62.85 
 
 
611 aa  713    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000542106  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2007  molecular chaperone DnaK  54.17 
 
 
644 aa  656    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2002  molecular chaperone DnaK  53.95 
 
 
644 aa  654    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0196  molecular chaperone DnaK  100 
 
 
613 aa  1232    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1313  molecular chaperone DnaK  57.23 
 
 
630 aa  697    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.634921  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0554  molecular chaperone DnaK  56.86 
 
 
634 aa  660    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3433  molecular chaperone DnaK  59.74 
 
 
620 aa  715    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0457031  normal  0.0513788 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1538  molecular chaperone protein DnaK  53.86 
 
 
639 aa  645    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.163821 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0197  molecular chaperone DnaK  59.9 
 
 
630 aa  712    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432012  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0141  molecular chaperone DnaK  56.51 
 
 
629 aa  707    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0295  molecular chaperone DnaK  61.87 
 
 
633 aa  714    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0378  molecular chaperone DnaK  59.78 
 
 
653 aa  665    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1173  molecular chaperone DnaK  56.01 
 
 
636 aa  676    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0107  molecular chaperone DnaK  58.9 
 
 
634 aa  743    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0126383  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0621  molecular chaperone DnaK  54.16 
 
 
637 aa  668    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2303  molecular chaperone DnaK  58.27 
 
 
639 aa  696    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1893  molecular chaperone DnaK  55.63 
 
 
637 aa  670    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.457552  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2674  molecular chaperone DnaK  58.33 
 
 
637 aa  692    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3532  molecular chaperone DnaK  59.59 
 
 
638 aa  753    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00119444  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1023  molecular chaperone DnaK  58.76 
 
 
637 aa  705    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4539  molecular chaperone DnaK  62.85 
 
 
611 aa  713    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000969384  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1644  molecular chaperone DnaK  55.82 
 
 
628 aa  674    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000171491  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1797  molecular chaperone DnaK  57.1 
 
 
645 aa  699    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0693908  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2468  molecular chaperone DnaK  60 
 
 
634 aa  724    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.501675  hitchhiker  0.000000000338371 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2239  molecular chaperone DnaK  52.51 
 
 
644 aa  644    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0425957  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3555  molecular chaperone DnaK  57.46 
 
 
639 aa  699    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0866908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  62.96 
 
 
612 aa  744    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1580  chaperone DnaK  58.63 
 
 
632 aa  674    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308505  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4328  molecular chaperone DnaK  56.79 
 
 
609 aa  682    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.977158  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2173  molecular chaperone DnaK  61.23 
 
 
641 aa  669    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.232061  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4352  molecular chaperone DnaK  78.82 
 
 
616 aa  898    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0429  molecular chaperone DnaK  56.48 
 
 
633 aa  703    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2054  molecular chaperone DnaK  59.06 
 
 
635 aa  707    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0128  chaperone DnaK  59.9 
 
 
610 aa  716    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.438221  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0019  chaperone protein DnaK  56.6 
 
 
636 aa  653    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0471  molecular chaperone DnaK  55.45 
 
 
635 aa  664    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0555822  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0212  molecular chaperone DnaK  58.83 
 
 
639 aa  679    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0329  molecular chaperone DnaK  57.03 
 
 
632 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813132  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0751  chaperone DnaK  56.08 
 
 
640 aa  656    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.805739  normal  0.219742 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1312  molecular chaperone DnaK  58.66 
 
 
620 aa  704    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.975938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0391  molecular chaperone DnaK  55.84 
 
 
633 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0155  molecular chaperone DnaK  59.4 
 
 
632 aa  708    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0982  molecular chaperone DnaK  58.67 
 
 
644 aa  705    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000339197  unclonable  0.0000180058 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0010  molecular chaperone DnaK  56.58 
 
 
642 aa  679    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0949466  normal  0.47597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0402  molecular chaperone DnaK  57.23 
 
 
643 aa  704    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.362768  normal  0.130805 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2058  molecular chaperone DnaK  59.65 
 
 
634 aa  723    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0462  molecular chaperone DnaK  75.94 
 
 
622 aa  893    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0589911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0784  chaperone DnaK  64.7 
 
 
636 aa  784    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0679  molecular chaperone DnaK  58.11 
 
 
636 aa  712    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470568  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3101  molecular chaperone DnaK  56.32 
 
 
632 aa  676    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2290  molecular chaperone DnaK  64.06 
 
 
619 aa  750    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  64.04 
 
 
619 aa  757    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1306  molecular chaperone DnaK  60.56 
 
 
638 aa  699    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35463  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1900  molecular chaperone DnaK  56.09 
 
 
671 aa  666    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.393588  normal  0.969601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0490  chaperone protein DnaK  59.33 
 
 
623 aa  701    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000032469  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  62.09 
 
 
610 aa  762    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3001  chaperone protein DnaK  56.92 
 
 
636 aa  674    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1027  molecular chaperone DnaK  60.89 
 
 
607 aa  707    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0288585  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1309  molecular chaperone  57.75 
 
 
617 aa  661    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0486876  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0822  molecular chaperone DnaK  59.97 
 
 
623 aa  707    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.762106 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1347  molecular chaperone DnaK  56.56 
 
 
615 aa  674    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.730753  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0163  molecular chaperone DnaK  62.67 
 
 
607 aa  691    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3808  molecular chaperone DnaK  69.34 
 
 
622 aa  863    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0731  molecular chaperone DnaK  58.12 
 
 
615 aa  692    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0260  chaperone protein DnaK  57.17 
 
 
631 aa  655    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000679049  normal  0.867364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1036  chaperone protein DnaK  55.82 
 
 
641 aa  707    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000619516  hitchhiker  0.000149965 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0510  chaperone protein DnaK  57.99 
 
 
653 aa  703    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0638299  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2115  molecular chaperone DnaK  77.4 
 
 
618 aa  932    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0501961 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1089  molecular chaperone DnaK  56.46 
 
 
626 aa  663    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000419438  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1404  molecular chaperone DnaK  58.53 
 
 
636 aa  736    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00594741  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0864  molecular chaperone DnaK  53.55 
 
 
640 aa  665    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.873902  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2302  molecular chaperone DnaK  56.22 
 
 
638 aa  679    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679983  normal  0.117002 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4363  chaperone protein DnaK  74.88 
 
 
621 aa  902    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.62994  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0473  molecular chaperone DnaK  75.94 
 
 
622 aa  893    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518143  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0634  molecular chaperone DnaK  72.19 
 
 
622 aa  894    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2166  molecular chaperone DnaK  57.44 
 
 
636 aa  698    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0684659  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1328  molecular chaperone DnaK  57.35 
 
 
631 aa  696    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0775  molecular chaperone DnaK  56.13 
 
 
623 aa  648    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.175007  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1476  molecular chaperone DnaK  54.48 
 
 
647 aa  652    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19141  molecular chaperone DnaK  57.26 
 
 
635 aa  699    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18951  molecular chaperone DnaK  57.1 
 
 
634 aa  699    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21861  molecular chaperone DnaK  57.39 
 
 
630 aa  699    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.357564  normal  0.686332 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30041  molecular chaperone DnaK  58.5 
 
 
637 aa  696    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.417292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>