More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00616 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00616  Hsp70 family chaperone Hsc62, binds to RpoD and inhibits transcription  100 
 
 
556 aa  1145    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2976  2-alkenal reductase  99.28 
 
 
556 aa  1139    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4190  Heat shock protein 70  58.41 
 
 
563 aa  657    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00605  hypothetical protein  100 
 
 
556 aa  1145    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0671  DnaK family protein HscC  97.12 
 
 
556 aa  1113    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2995  2-alkenal reductase  99.1 
 
 
556 aa  1137    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4475  Heat shock protein 70  58.33 
 
 
563 aa  653    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0776  chaperone protein HscC  82.91 
 
 
559 aa  964    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.445694  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0741  DnaK family protein HscC  98.92 
 
 
556 aa  1134    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0702  chaperone protein HscC  82.73 
 
 
559 aa  962    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0599  DnaK family protein HscC  98.74 
 
 
556 aa  1134    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0678  DnaK family protein HscC  98.92 
 
 
556 aa  1130    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0716  chaperone protein HscC  82.73 
 
 
559 aa  962    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0763  chaperone protein HscC  82.73 
 
 
559 aa  962    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.976238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1886  heat shock protein Hsp70  57.04 
 
 
563 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3774  2-alkenal reductase  48.15 
 
 
572 aa  492  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576175  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2904  heat shock protein DnaK  46.97 
 
 
566 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.660148  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0521  chaperone transmembrane protein  44.93 
 
 
593 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362159  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2977  chaperone protein hscC  46.42 
 
 
566 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4769  heat shock protein Hsp70  46.52 
 
 
565 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3202  chaperone protein hscC  46.42 
 
 
566 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617528  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4294  chaperone protein HscC  46.01 
 
 
564 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4256  heat shock protein 70  46.95 
 
 
572 aa  477  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal  0.890975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3997  heat shock protein Hsp70  46.38 
 
 
564 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.76093  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7074  2-alkenal reductase  45.55 
 
 
569 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0192  putative DnaK chaperone protein  44.91 
 
 
569 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2505  2-alkenal reductase  44.42 
 
 
565 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104768  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2958  Heat shock protein 70  43.14 
 
 
566 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1393  2-alkenal reductase  41.3 
 
 
552 aa  444  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.703416  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1433  2-alkenal reductase  42.22 
 
 
572 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3314  heat shock protein Hsp70  43.59 
 
 
568 aa  402  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3027  Heat shock protein 70  41.74 
 
 
584 aa  387  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  38.51 
 
 
607 aa  332  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12800  chaperone protein DnaK  34.94 
 
 
617 aa  326  7e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0339068  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2057  chaperone protein DnaK  35.92 
 
 
607 aa  325  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0765  chaperone protein DnaK  34.92 
 
 
607 aa  324  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.752703  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  38.57 
 
 
621 aa  324  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1128  molecular chaperone DnaK  34.58 
 
 
596 aa  324  3e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0784  chaperone DnaK  34.35 
 
 
636 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0247  chaperone protein DnaK  36.51 
 
 
621 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4387  2-alkenal reductase  35.02 
 
 
578 aa  320  5e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2047  chaperone protein DnaK  37.32 
 
 
630 aa  319  6e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0607  chaperone protein DnaK  34.42 
 
 
605 aa  319  9e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1996  chaperone protein DnaK  37.53 
 
 
616 aa  318  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  34.59 
 
 
610 aa  318  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  35.16 
 
 
612 aa  317  5e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  37.17 
 
 
608 aa  316  9e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4270  chaperone protein DnaK  35.83 
 
 
613 aa  315  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4807  chaperone protein DnaK  35.95 
 
 
627 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2956  chaperone protein DnaK  33.72 
 
 
626 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000146518  hitchhiker  0.00000122718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10355  molecular chaperone DnaK  38.79 
 
 
625 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5471  chaperone protein DnaK  34.73 
 
 
616 aa  312  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0033  molecular chaperone DnaK  33.16 
 
 
636 aa  311  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1209  molecular chaperone DnaK  40 
 
 
596 aa  311  2e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000215559  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  33.99 
 
 
612 aa  311  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4299  chaperone protein DnaK  36.07 
 
 
614 aa  310  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0238  chaperone protein DnaK  35.5 
 
 
617 aa  310  4e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38580  molecular chaperone DnaK  39.19 
 
 
619 aa  310  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0449  molecular chaperone DnaK  37.93 
 
 
622 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0462  molecular chaperone DnaK  37.93 
 
 
622 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0589911  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2496  molecular chaperone DnaK  33.81 
 
 
615 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612679  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0473  molecular chaperone DnaK  37.93 
 
 
622 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518143  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2437  molecular chaperone DnaK  35.63 
 
 
609 aa  309  8e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177515  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0634  molecular chaperone DnaK  37.93 
 
 
622 aa  309  8e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2048  chaperone protein DnaK  37.4 
 
 
622 aa  308  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00388714  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1649  molecular chaperone DnaK  38.56 
 
 
600 aa  308  1.0000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000228474  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1358  chaperone protein DnaK  34.19 
 
 
602 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0486  chaperone protein DnaK  35.31 
 
 
613 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403398  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0731  molecular chaperone DnaK  35.11 
 
 
615 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46166  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4363  chaperone protein DnaK  38.44 
 
 
621 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.62994  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0112  molecular chaperone DnaK  38 
 
 
611 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000334679 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0260  molecular chaperone DnaK  37.5 
 
 
622 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0242137  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3246  chaperone protein DnaK  35.81 
 
 
624 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102286  hitchhiker  0.000258743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0366  chaperone protein DnaK  37.79 
 
 
617 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0529  class I heat-shock protein (chaperonin)  38.59 
 
 
623 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2468  molecular chaperone DnaK  35.03 
 
 
634 aa  307  3e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.501675  hitchhiker  0.000000000338371 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3001  chaperone protein DnaK  38.64 
 
 
636 aa  307  3e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30041  molecular chaperone DnaK  37.5 
 
 
637 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.417292 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1013  molecular chaperone DnaK  34.72 
 
 
607 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0313  chaperone protein DnaK  36.99 
 
 
626 aa  307  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000265757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0113  molecular chaperone DnaK  38.48 
 
 
613 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1551  chaperone protein DnaK  34.15 
 
 
607 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15099  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18810  chaperone protein DnaK  38.72 
 
 
619 aa  306  5.0000000000000004e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000228841  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3221  chaperone protein DnaK  35.54 
 
 
613 aa  306  9.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000155222  hitchhiker  0.000112809 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0935  molecular chaperone DnaK  33.51 
 
 
622 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.550928  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3734  chaperone protein DnaK  35.43 
 
 
622 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103994 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0544  molecular chaperone DnaK  39.7 
 
 
596 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0558  molecular chaperone DnaK  39.7 
 
 
596 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000712029  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0070  chaperone protein DnaK  37.19 
 
 
642 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3505  molecular chaperone DnaK  33.61 
 
 
640 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00228392  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2115  molecular chaperone DnaK  37.71 
 
 
618 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0501961 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18951  molecular chaperone DnaK  37.5 
 
 
634 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1166  chaperone protein DnaK  33.04 
 
 
605 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0004  molecular chaperone DnaK  36.69 
 
 
631 aa  304  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0827361  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1250  molecular chaperone DnaK  33.04 
 
 
630 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0622  chaperone protein DnaK  36.53 
 
 
600 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0182249  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18401  molecular chaperone DnaK  37.11 
 
 
634 aa  303  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.188042  normal  0.971493 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5218  chaperone protein DnaK  38.68 
 
 
616 aa  303  5.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0141  molecular chaperone DnaK  34.19 
 
 
629 aa  303  6.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1960  chaperone protein DnaK  37.21 
 
 
613 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.638258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>