More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0832 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1606  chaperone protein DnaK  59.47 
 
 
629 aa  713    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0465496  normal  0.395903 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1348  chaperone protein DnaK  56.77 
 
 
614 aa  675    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1615  chaperone protein DnaK  55.02 
 
 
633 aa  712    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.393444 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0832  heat shock protein 70  100 
 
 
633 aa  1283    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.901264  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0731  molecular chaperone DnaK  58.83 
 
 
615 aa  711    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46166  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0607  chaperone protein DnaK  55.28 
 
 
605 aa  646    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0100  chaperone protein DnaK  55.8 
 
 
619 aa  696    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.843776  normal  0.187258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  49.52 
 
 
608 aa  619  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0096  chaperone protein DnaK  52.92 
 
 
636 aa  618  1e-175  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0207175 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1996  chaperone protein DnaK  52.43 
 
 
616 aa  612  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278133  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1551  chaperone protein DnaK  51.56 
 
 
607 aa  611  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15099  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0141  molecular chaperone DnaK  49.84 
 
 
629 aa  606  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2468  molecular chaperone DnaK  49.39 
 
 
634 aa  606  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.501675  hitchhiker  0.000000000338371 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  49.08 
 
 
612 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12800  chaperone protein DnaK  52.08 
 
 
617 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0339068  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18951  molecular chaperone DnaK  48.55 
 
 
634 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  51.74 
 
 
612 aa  598  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3373  chaperone protein DnaK  48.47 
 
 
633 aa  601  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0334464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4127  molecular chaperone DnaK  48.78 
 
 
630 aa  598  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  48.25 
 
 
607 aa  594  1e-168  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2058  molecular chaperone DnaK  51.07 
 
 
634 aa  592  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2057  chaperone protein DnaK  51.28 
 
 
607 aa  590  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3433  molecular chaperone DnaK  51.9 
 
 
620 aa  590  1e-167  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0457031  normal  0.0513788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1306  molecular chaperone DnaK  48.31 
 
 
638 aa  589  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35463  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2048  chaperone protein DnaK  49.09 
 
 
622 aa  591  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00388714  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3460  chaperone protein DnaK  50.16 
 
 
612 aa  587  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0295  molecular chaperone DnaK  49.58 
 
 
633 aa  585  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2183  chaperone protein DnaK  50.66 
 
 
640 aa  588  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137108  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1312  molecular chaperone DnaK  49.25 
 
 
620 aa  586  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.975938  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30041  molecular chaperone DnaK  50.42 
 
 
637 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.417292 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18951  molecular chaperone DnaK  47.09 
 
 
635 aa  584  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0233  molecular chaperone DnaK  51.74 
 
 
612 aa  584  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0417702  normal  0.306693 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1960  chaperone protein DnaK  52.67 
 
 
613 aa  585  1.0000000000000001e-165  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.638258  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1313  molecular chaperone DnaK  49.35 
 
 
630 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.634921  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21861  molecular chaperone DnaK  49.19 
 
 
630 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.357564  normal  0.686332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0366  chaperone protein DnaK  50.26 
 
 
617 aa  582  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3246  chaperone protein DnaK  49.75 
 
 
624 aa  582  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102286  hitchhiker  0.000258743 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1797  molecular chaperone DnaK  47.01 
 
 
645 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0693908  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19141  molecular chaperone DnaK  46.78 
 
 
635 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  49.15 
 
 
619 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1798  molecular chaperone DnaK  46.33 
 
 
616 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  48.08 
 
 
610 aa  584  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3734  chaperone protein DnaK  50.08 
 
 
622 aa  584  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103994 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18401  molecular chaperone DnaK  48.16 
 
 
634 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.188042  normal  0.971493 
 
 
-
 
NC_002950  PG1208  molecular chaperone DnaK  48.09 
 
 
640 aa  580  1e-164  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.48647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4392  chaperone protein DnaK  50.08 
 
 
615 aa  578  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.253837  normal  0.258584 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2303  molecular chaperone DnaK  49.59 
 
 
639 aa  578  1e-164  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2959  molecular chaperone DnaK  49.67 
 
 
638 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.548743 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2674  molecular chaperone DnaK  49.75 
 
 
637 aa  579  1e-164  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  48.08 
 
 
621 aa  579  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0238  chaperone protein DnaK  50.95 
 
 
617 aa  579  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2956  chaperone protein DnaK  48.62 
 
 
626 aa  581  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000146518  hitchhiker  0.00000122718 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0113  molecular chaperone DnaK  48.15 
 
 
613 aa  578  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2290  molecular chaperone DnaK  49.74 
 
 
619 aa  578  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1036  chaperone protein DnaK  47.66 
 
 
641 aa  579  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000619516  hitchhiker  0.000149965 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2437  molecular chaperone DnaK  51.39 
 
 
609 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177515  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0622  chaperone protein DnaK  50.09 
 
 
600 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0182249  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0107  molecular chaperone DnaK  48.92 
 
 
634 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0126383  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4807  chaperone protein DnaK  51.65 
 
 
627 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1181  molecular chaperone, DnaK family  47.83 
 
 
636 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0502129  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0112  molecular chaperone DnaK  49.48 
 
 
611 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000334679 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0247  chaperone protein DnaK  49.91 
 
 
621 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00650  chaperone protein DnaK  48.1 
 
 
642 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0257003  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0196  molecular chaperone DnaK  49.83 
 
 
613 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1013  molecular chaperone DnaK  49.28 
 
 
607 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3555  molecular chaperone DnaK  47.63 
 
 
639 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0866908  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4045  chaperone protein DnaK  46.86 
 
 
635 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3221  chaperone protein DnaK  49.66 
 
 
613 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000155222  hitchhiker  0.000112809 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1750  chaperone protein DnaK  49.34 
 
 
637 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4082  chaperone protein DnaK  46.86 
 
 
635 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1399  molecular chaperone DnaK  47.66 
 
 
637 aa  572  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01160  chaperone protein DnaK  45.23 
 
 
636 aa  570  1e-161  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.548876  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0529  class I heat-shock protein (chaperonin)  49.41 
 
 
623 aa  570  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1208  molecular chaperone DnaK  47.33 
 
 
636 aa  570  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1166  chaperone protein DnaK  48.98 
 
 
605 aa  572  1e-161  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3532  molecular chaperone DnaK  46.65 
 
 
638 aa  568  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00119444  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2694  chaperone protein DnaK  49.33 
 
 
613 aa  569  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52908  normal  0.770302 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0481  molecular chaperone DnaK  49.57 
 
 
632 aa  570  1e-161  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.995968 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0128  chaperone DnaK  47.3 
 
 
610 aa  570  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.438221  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2496  molecular chaperone DnaK  49.74 
 
 
615 aa  571  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612679  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0094  chaperone protein DnaK  48.36 
 
 
634 aa  571  1e-161  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.512015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0440  chaperone protein DnaK  51.05 
 
 
618 aa  567  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00195865  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0633  chaperone protein DnaK  46.7 
 
 
639 aa  566  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.840068 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1207  chaperone protein DnaK  45.85 
 
 
620 aa  567  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.558053  normal  0.0128499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7790  chaperone protein dnaK  50.17 
 
 
629 aa  566  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0402  molecular chaperone DnaK  50.17 
 
 
643 aa  568  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.362768  normal  0.130805 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1707  molecular chaperone DnaK  45.9 
 
 
642 aa  567  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0108281  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0313  chaperone protein DnaK  48.75 
 
 
626 aa  566  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000265757  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2115  molecular chaperone DnaK  52.13 
 
 
618 aa  565  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0501961 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0864  molecular chaperone DnaK  45.67 
 
 
640 aa  566  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.873902  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5471  chaperone protein DnaK  49.14 
 
 
616 aa  568  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2631  molecular chaperone DnaK  47.63 
 
 
627 aa  565  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0494047  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3072  chaperone protein DnaK  48.24 
 
 
636 aa  562  1.0000000000000001e-159  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0257567  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0155  molecular chaperone DnaK  48.26 
 
 
632 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0982  molecular chaperone DnaK  48.59 
 
 
644 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000339197  unclonable  0.0000180058 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0784  chaperone DnaK  49.33 
 
 
636 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0490  chaperone protein DnaK  46.62 
 
 
623 aa  564  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000032469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6430  chaperone protein DnaK  45.94 
 
 
634 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0661319  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1128  molecular chaperone DnaK  47.26 
 
 
596 aa  560  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0350  molecular chaperone DnaK  50.33 
 
 
631 aa  561  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.759772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>