More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0558 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0558  molecular chaperone-like protein  100 
 
 
439 aa  833    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3087  Heat shock protein 70  34.93 
 
 
683 aa  163  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1636  heat shock protein 70  37.46 
 
 
632 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.674919  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36840  hypothetical protein  35.07 
 
 
446 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0323397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1651  heat shock protein 70  36.25 
 
 
631 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.660116  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3800  heat shock protein 70  31.83 
 
 
880 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122258  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1348  chaperone protein DnaK  25.21 
 
 
614 aa  103  8e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0100  chaperone protein DnaK  25.9 
 
 
619 aa  100  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.843776  normal  0.187258 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0607  chaperone protein DnaK  27.82 
 
 
605 aa  98.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3003  heat shock protein 70  28.88 
 
 
935 aa  96.7  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376537  normal  0.234156 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1946  heat shock protein 70  29.91 
 
 
957 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253458  normal  0.635918 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27840  molecular chaperone  35.86 
 
 
658 aa  94.4  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0363632 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1615  chaperone protein DnaK  24.19 
 
 
633 aa  92.8  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.393444 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0145  heat shock protein 70  29.84 
 
 
577 aa  92.4  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0832  heat shock protein 70  25.98 
 
 
633 aa  90.1  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.901264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  27.1 
 
 
612 aa  89  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1606  chaperone protein DnaK  23.72 
 
 
629 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0465496  normal  0.395903 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3040  molecular chaperone DnaK  26.02 
 
 
611 aa  87.8  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00371725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12800  chaperone protein DnaK  26.26 
 
 
617 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0339068  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1638  molecular chaperone DnaK  25.27 
 
 
610 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1672  molecular chaperone DnaK  25.27 
 
 
610 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0554333  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0433  hypothetical protein  33.45 
 
 
582 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.142496 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2693  Heat shock protein 70  30.85 
 
 
597 aa  86.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122033  normal  0.114387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2420  Heat shock protein 70  26.3 
 
 
649 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2974  Heat shock protein 70  27.46 
 
 
473 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458744  normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4395  molecular chaperone DnaK  24.52 
 
 
611 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00031537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0803  molecular chaperone DnaK  25.07 
 
 
611 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000557012  hitchhiker  1.18258e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4213  molecular chaperone DnaK  25.07 
 
 
611 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000284516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4051  molecular chaperone DnaK  25.07 
 
 
611 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4061  molecular chaperone DnaK  25.07 
 
 
611 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000542106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4336  molecular chaperone DnaK  25.07 
 
 
611 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67993e-38 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4539  molecular chaperone DnaK  25.07 
 
 
611 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000969384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4447  molecular chaperone DnaK  24.52 
 
 
611 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000527769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4433  molecular chaperone DnaK  25.07 
 
 
611 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000173012  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2290  molecular chaperone DnaK  24.44 
 
 
619 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4165  molecular chaperone DnaK  24.8 
 
 
611 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0072304  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  26.11 
 
 
608 aa  84  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1061  chaperone protein DnaK  26.72 
 
 
609 aa  84  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00544599  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  24.44 
 
 
619 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2057  chaperone protein DnaK  26.85 
 
 
607 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1013  molecular chaperone DnaK  25.89 
 
 
607 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0097  molecular chaperone DnaK  23.58 
 
 
609 aa  80.5  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1148  molecular chaperone DnaK  23.42 
 
 
609 aa  80.1  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2437  molecular chaperone DnaK  25.89 
 
 
609 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177515  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0179  heat shock protein 70  26.45 
 
 
571 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.633289  normal  0.123381 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0163  molecular chaperone DnaK  23.85 
 
 
607 aa  79  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2496  molecular chaperone DnaK  25.2 
 
 
615 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612679  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0308  hypothetical protein  30.77 
 
 
598 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3221  chaperone protein DnaK  25.95 
 
 
613 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000155222  hitchhiker  0.000112809 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2311  chaperone protein DnaK  25.2 
 
 
620 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000072076  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0622  chaperone protein DnaK  24.52 
 
 
600 aa  77.4  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0182249  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3550  Heat shock protein 70  29.51 
 
 
632 aa  77.4  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.149708  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  22.87 
 
 
621 aa  77  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0352  Heat shock protein 70  29.95 
 
 
858 aa  76.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1142  dnak protein, truncation  24.23 
 
 
505 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  26.27 
 
 
612 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0731  molecular chaperone DnaK  26.12 
 
 
615 aa  76.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46166  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0096  chaperone protein DnaK  22.28 
 
 
636 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0207175 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1551  chaperone protein DnaK  24.51 
 
 
607 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15099  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4180  molecular chaperone DnaK  24.28 
 
 
723 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.612258 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1873  Heat shock protein 70  28.12 
 
 
527 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0915077  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1128  molecular chaperone DnaK  23.61 
 
 
596 aa  74.7  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6358  heat shock protein 70  28.96 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2183  chaperone protein DnaK  24.68 
 
 
640 aa  73.2  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137108  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0378  molecular chaperone DnaK  24.52 
 
 
653 aa  73.2  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0682  molecular chaperone DnaK  24.59 
 
 
644 aa  73.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00979445  normal  0.319162 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1996  chaperone protein DnaK  26.43 
 
 
616 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278133  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1027  molecular chaperone DnaK  24.4 
 
 
607 aa  72.8  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0288585  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1798  molecular chaperone DnaK  23.2 
 
 
616 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2073  molecular chaperone DnaK  24.35 
 
 
655 aa  72  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4299  chaperone protein DnaK  26.22 
 
 
614 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0571  chaperone protein DnaK  24.66 
 
 
651 aa  71.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1312  molecular chaperone DnaK  24.18 
 
 
620 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.975938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6998  2-alkenal reductase  29.04 
 
 
546 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0128  chaperone DnaK  24.65 
 
 
610 aa  70.9  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.438221  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1975  chaperone protein DnaK  24.18 
 
 
662 aa  71.2  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.156866  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1209  molecular chaperone DnaK  24.57 
 
 
596 aa  70.1  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000215559  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1750  molecular chaperone DnaK  23.04 
 
 
690 aa  70.1  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190119  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2419  Heat shock protein 70  24.16 
 
 
640 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87680  Nuclear-encoded mitochondrial protein member of the heat shock protein 70 (HSP70) family  22.19 
 
 
650 aa  69.7  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.227121  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1415  Heat shock protein 70  31.73 
 
 
657 aa  69.7  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3101  molecular chaperone DnaK  23.51 
 
 
632 aa  69.3  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  26.05 
 
 
610 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0544  molecular chaperone DnaK  24.19 
 
 
596 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0558  molecular chaperone DnaK  24.19 
 
 
596 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000712029  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1166  chaperone protein DnaK  22.7 
 
 
605 aa  68.6  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0431  hypothetical protein  28.22 
 
 
601 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100055  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6569  Heat shock protein 70  33.42 
 
 
643 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1644  molecular chaperone DnaK  24.62 
 
 
628 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000171491  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03160  heat shock protein sks2 (heat shock cognate protein hsc1), putative  26.97 
 
 
614 aa  67.8  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.3043  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2580  molecular chaperone DnaK  24.81 
 
 
749 aa  67.4  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2689  heat shock protein 70  28.06 
 
 
620 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.362421  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0440  chaperone protein DnaK  23.78 
 
 
618 aa  67.8  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0641  chaperone protein HscA  31.32 
 
 
628 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.110178  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0310  molecular chaperone DnaK  24.73 
 
 
644 aa  67.4  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  26.19 
 
 
607 aa  67.4  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0444  hypothetical protein  27.63 
 
 
601 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0454  hypothetical protein  27.63 
 
 
601 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.23785  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4693  molecular chaperone DnaK  24.3 
 
 
643 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2875  2-alkenal reductase  29.63 
 
 
620 aa  67  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>