More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0454 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0444  hypothetical protein  100 
 
 
601 aa  1147    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491565  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0431  hypothetical protein  99.33 
 
 
601 aa  1135    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100055  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0454  hypothetical protein  100 
 
 
601 aa  1147    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.23785  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0621  hypothetical protein  74 
 
 
610 aa  637    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.515489  normal  0.106222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0276  hypothetical protein  68.64 
 
 
608 aa  610  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0401  hypothetical protein  55.04 
 
 
594 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0410  hypothetical protein  55.04 
 
 
594 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0389  hypothetical protein  55.33 
 
 
594 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0961812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0433  hypothetical protein  49.88 
 
 
582 aa  350  5e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.142496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10317  proline and threonine rich protein  42.89 
 
 
620 aa  316  9e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0308  hypothetical protein  46.19 
 
 
598 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3386  hypothetical protein  45.97 
 
 
568 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732691  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3397  molecular chaperone-like  45.97 
 
 
568 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166974  normal  0.969377 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3448  hypothetical protein  45.97 
 
 
568 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0626  hypothetical protein  42.44 
 
 
609 aa  262  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.379396  normal  0.0958699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0436  hypothetical protein  43.8 
 
 
613 aa  259  9e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12291  proline rich protein  41.94 
 
 
592 aa  258  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.852412  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0271  hypothetical protein  43.07 
 
 
617 aa  257  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3087  Heat shock protein 70  31.53 
 
 
683 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1636  heat shock protein 70  30.27 
 
 
632 aa  93.2  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.674919  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1651  heat shock protein 70  29.71 
 
 
631 aa  91.7  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.660116  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3800  heat shock protein 70  26.67 
 
 
880 aa  80.5  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122258  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6569  Heat shock protein 70  33.33 
 
 
643 aa  74.7  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05129  Heat shock 70 kDa protein (HSP70) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B2V1]  25.26 
 
 
644 aa  73.9  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84662  heat shock protein 70, Hsp70 family (SSA2)  25.41 
 
 
643 aa  71.6  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.793939  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02520  chaperone, putative  27.13 
 
 
644 aa  70.9  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02320  heat shock protein 70, putative  27.13 
 
 
640 aa  70.5  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0558  molecular chaperone-like protein  30.22 
 
 
439 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1946  heat shock protein 70  28.45 
 
 
957 aa  68.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253458  normal  0.635918 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28169  Heat Shock Protein 70, cytosolic  29.01 
 
 
650 aa  67.8  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158488  hitchhiker  0.00292579 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80761  heat shock protein 70  26.06 
 
 
652 aa  67.4  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0298  putative chaperone protein HscA  24.44 
 
 
593 aa  67.4  0.0000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54019  protein heat shock protein Hsp70  27.12 
 
 
653 aa  66.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03160  heat shock protein sks2 (heat shock cognate protein hsc1), putative  28.28 
 
 
614 aa  65.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.3043  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04390  molecular chaperone  30.91 
 
 
665 aa  66.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48656  normal  0.554672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3003  heat shock protein 70  30.77 
 
 
935 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376537  normal  0.234156 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79362  heat shock protein of the HSP70 family (SSB1) (HSP75)  30.65 
 
 
613 aa  65.9  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00367292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4233  chaperone protein DnaK  28.06 
 
 
623 aa  65.1  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27840  molecular chaperone  28.74 
 
 
658 aa  64.3  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0363632 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2693  Heat shock protein 70  30.7 
 
 
597 aa  63.9  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122033  normal  0.114387 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1358  chaperone protein DnaK  23.94 
 
 
626 aa  60.5  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00416973  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05490  chaperone protein DnaK  24.65 
 
 
631 aa  60.5  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2047  chaperone protein DnaK  28.19 
 
 
630 aa  60.1  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0303  molecular chaperone DnaK  25.66 
 
 
637 aa  60.1  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11227  heat shock 70 kDa protein (Eurofung)  27.16 
 
 
372 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.8332  hitchhiker  0.0000148889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1415  Heat shock protein 70  27.93 
 
 
657 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0128  chaperone DnaK  26.61 
 
 
610 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.438221  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2183  chaperone protein DnaK  25.51 
 
 
640 aa  58.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137108  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0349  chaperone protein DnaK  25.32 
 
 
619 aa  58.2  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.760609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5965  Molecular chaperone-like protein  26.22 
 
 
861 aa  58.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000466156  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0440  chaperone protein DnaK  25.75 
 
 
618 aa  57.4  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1136  chaperone protein HscA  28.18 
 
 
620 aa  57  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3550  Heat shock protein 70  28.87 
 
 
632 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.149708  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1857  chaperone protein DnaK  25.26 
 
 
634 aa  56.6  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.48681  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3808  molecular chaperone DnaK  25.88 
 
 
622 aa  57  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38489  Molecular chaperones HSP70/HSC70, HSP70 superfamily Heat-shock protein 70 (HSP72)  28.31 
 
 
612 aa  57  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.839157  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3821  chaperone protein DnaK  26.41 
 
 
638 aa  56.2  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.486891  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0096  chaperone protein DnaK  23.89 
 
 
636 aa  56.2  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0207175 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1403  Heat shock protein 70  25.83 
 
 
538 aa  55.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0310  molecular chaperone DnaK  25.44 
 
 
644 aa  55.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0864  molecular chaperone DnaK  24.41 
 
 
640 aa  55.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.873902  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0201  chaperone protein DnaK  23.57 
 
 
621 aa  55.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00131999  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02062  hypothetical protein similar to bipA (Eurofung)  22.64 
 
 
674 aa  54.7  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.209534  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02070  heat shock protein, putative  25.62 
 
 
773 aa  54.7  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45857  heat shock protein 70  27.22 
 
 
593 aa  54.7  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0406  heat shock protein Hsp70  23.75 
 
 
618 aa  54.3  0.000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2835  molecular chaperone DnaK  24.48 
 
 
639 aa  54.3  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1403  molecular chaperone DnaK  23.98 
 
 
625 aa  53.5  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000203004  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0324  Molecular chaperone-like protein  27.3 
 
 
350 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02253  molecular chaperone DnaK  25.89 
 
 
642 aa  53.5  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.402968  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1023  molecular chaperone DnaK  23.81 
 
 
637 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0382  molecular chaperone DnaK  26.76 
 
 
635 aa  53.5  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04420  chaperone protein DnaK  24 
 
 
619 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4352  molecular chaperone DnaK  24.87 
 
 
616 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0982  molecular chaperone DnaK  24.36 
 
 
644 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000339197  unclonable  0.0000180058 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0682  molecular chaperone DnaK  27.02 
 
 
644 aa  53.5  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00979445  normal  0.319162 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0352  Heat shock protein 70  30.53 
 
 
858 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2166  molecular chaperone DnaK  26.42 
 
 
636 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0684659  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2123  2-alkenal reductase  25.39 
 
 
540 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00014  molecular chaperone DnaK  26.67 
 
 
638 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3583  chaperone protein DnaK  26.67 
 
 
638 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766663  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1399  molecular chaperone DnaK  25 
 
 
637 aa  52.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1148  molecular chaperone DnaK  25.2 
 
 
609 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0014  molecular chaperone DnaK  26.67 
 
 
638 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.720404  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1181  molecular chaperone, DnaK family  25 
 
 
636 aa  52.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0502129  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0346  molecular chaperone DnaK  26.32 
 
 
600 aa  52.8  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.000727385  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1807  heat shock protein 70  25.39 
 
 
540 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.264877  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00014  hypothetical protein  26.67 
 
 
638 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0014  molecular chaperone DnaK  26.67 
 
 
638 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2053  2-alkenal reductase  25.39 
 
 
540 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3642  molecular chaperone DnaK  26.67 
 
 
638 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297376  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0012  molecular chaperone DnaK  26.67 
 
 
638 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4793  chaperone protein DnaK  26.87 
 
 
637 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126797  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0017  molecular chaperone DnaK  26.67 
 
 
638 aa  52.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00276008  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0015  molecular chaperone DnaK  26.67 
 
 
638 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1207  chaperone protein DnaK  26.74 
 
 
620 aa  52.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.558053  normal  0.0128499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4187  molecular chaperone DnaK  27.08 
 
 
691 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.793765  normal  0.583998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0113  molecular chaperone DnaK  26.8 
 
 
613 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1166  chaperone protein DnaK  25.61 
 
 
605 aa  52.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0107  molecular chaperone DnaK  26.56 
 
 
634 aa  52.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0126383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>