184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10317 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10317  proline and threonine rich protein  100 
 
 
620 aa  1226    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0389  hypothetical protein  47.41 
 
 
594 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0961812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0401  hypothetical protein  47.53 
 
 
594 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0410  hypothetical protein  47.53 
 
 
594 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0621  hypothetical protein  46.54 
 
 
610 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.515489  normal  0.106222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0431  hypothetical protein  46.82 
 
 
601 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100055  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0444  hypothetical protein  46.82 
 
 
601 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0454  hypothetical protein  46.82 
 
 
601 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.23785  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0433  hypothetical protein  44.66 
 
 
582 aa  297  4e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.142496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0276  hypothetical protein  43.91 
 
 
608 aa  279  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0308  hypothetical protein  41.12 
 
 
598 aa  278  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3386  hypothetical protein  41.79 
 
 
568 aa  224  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732691  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3448  hypothetical protein  41.79 
 
 
568 aa  224  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3397  molecular chaperone-like  41.79 
 
 
568 aa  224  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166974  normal  0.969377 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12291  proline rich protein  43.59 
 
 
592 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.852412  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0436  hypothetical protein  42.02 
 
 
613 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0449  hypothetical protein  41.46 
 
 
611 aa  211  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00263959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0459  hypothetical protein  41.46 
 
 
611 aa  211  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0872017  normal  0.526818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0626  hypothetical protein  42.62 
 
 
609 aa  190  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.379396  normal  0.0958699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0271  hypothetical protein  39.84 
 
 
617 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3087  Heat shock protein 70  29.01 
 
 
683 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1946  heat shock protein 70  28.19 
 
 
957 aa  81.3  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253458  normal  0.635918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1651  heat shock protein 70  25.76 
 
 
631 aa  74.3  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.660116  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1636  heat shock protein 70  25.07 
 
 
632 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.674919  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3800  heat shock protein 70  24.1 
 
 
880 aa  70.1  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122258  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38489  Molecular chaperones HSP70/HSC70, HSP70 superfamily Heat-shock protein 70 (HSP72)  28.98 
 
 
612 aa  66.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.839157  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3114  WD-40 repeat protein  29.49 
 
 
816 aa  61.2  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122668  normal  0.0357376 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0627  Heat shock protein 70  28.63 
 
 
524 aa  61.2  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.802976  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0238  dnaK family protein  23.31 
 
 
575 aa  60.5  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.878692  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0241  dnaK family protein  23.31 
 
 
575 aa  60.1  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215943  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3003  heat shock protein 70  24.48 
 
 
935 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376537  normal  0.234156 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2053  2-alkenal reductase  25.18 
 
 
540 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2123  2-alkenal reductase  25.18 
 
 
540 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6569  Heat shock protein 70  28.68 
 
 
643 aa  58.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1807  heat shock protein 70  25.18 
 
 
540 aa  57.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.264877  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04390  molecular chaperone  29.26 
 
 
665 aa  57.8  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48656  normal  0.554672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4233  chaperone protein DnaK  26.1 
 
 
623 aa  57.4  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1606  chaperone protein DnaK  26.22 
 
 
629 aa  56.6  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0465496  normal  0.395903 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02062  hypothetical protein similar to bipA (Eurofung)  25.62 
 
 
674 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.209534  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0004  chaperone protein DnaK  22.05 
 
 
638 aa  55.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0408404  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0889  molecular chaperone DnaK  25.65 
 
 
617 aa  55.1  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000150558  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05129  Heat shock 70 kDa protein (HSP70) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B2V1]  23.16 
 
 
644 aa  54.7  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0096  chaperone protein DnaK  24 
 
 
636 aa  54.7  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0207175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3675  Heat shock protein 70  29.3 
 
 
698 aa  54.3  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.201192  normal  0.0422878 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84662  heat shock protein 70, Hsp70 family (SSA2)  23.15 
 
 
643 aa  54.3  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.793939  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0349  chaperone protein DnaK  25.78 
 
 
619 aa  54.3  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.760609 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01680  heat shock protein, putative  24.07 
 
 
798 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0982  molecular chaperone DnaK  24.26 
 
 
644 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000339197  unclonable  0.0000180058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0558  molecular chaperone-like protein  23.47 
 
 
439 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3550  Heat shock protein 70  25.9 
 
 
632 aa  52.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.149708  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1403  molecular chaperone DnaK  24.42 
 
 
625 aa  52.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000203004  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05101  HSP70 family molecular chaperone  30.45 
 
 
541 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4387  2-alkenal reductase  22.57 
 
 
578 aa  52.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1142  dnak protein, truncation  23.58 
 
 
505 aa  52  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3409  molecular chaperone DnaK  24.91 
 
 
640 aa  51.6  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0543718  hitchhiker  0.00118284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1415  Heat shock protein 70  26.72 
 
 
657 aa  51.2  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0013  molecular chaperone DnaK  24.21 
 
 
638 aa  51.2  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0013  molecular chaperone DnaK  24.21 
 
 
638 aa  51.2  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.767779  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0013  molecular chaperone DnaK  24.21 
 
 
638 aa  51.2  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.693638  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0012  molecular chaperone DnaK  24.21 
 
 
638 aa  51.2  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.276722  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0013  molecular chaperone DnaK  24.21 
 
 
638 aa  51.2  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0578  molecular chaperone DnaK  23.81 
 
 
640 aa  50.8  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.171198  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3583  molecular chaperone DnaK  24.57 
 
 
640 aa  51.2  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.281206  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0440  chaperone protein DnaK  24.91 
 
 
618 aa  51.2  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02520  chaperone, putative  24.09 
 
 
644 aa  50.8  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07165  molecular chaperone DnaK  22.99 
 
 
636 aa  50.8  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.703004  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1472  chaperone protein DnaK  24.11 
 
 
634 aa  50.4  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0182845  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0995  molecular chaperone DnaK  25.43 
 
 
639 aa  50.4  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0204392  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2166  molecular chaperone DnaK  25.09 
 
 
636 aa  50.4  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0684659  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2844  molecular chaperone DnaK  24.57 
 
 
637 aa  50.4  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.282883  normal  0.0786224 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1208  molecular chaperone DnaK  24.02 
 
 
636 aa  50.4  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0201  chaperone protein DnaK  26.03 
 
 
621 aa  50.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00131999  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0633  chaperone protein HscA  23.02 
 
 
617 aa  50.1  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.672596  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2290  molecular chaperone DnaK  23.39 
 
 
619 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1615  chaperone protein DnaK  26.07 
 
 
633 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.393444 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0959  molecular chaperone DnaK  25.43 
 
 
639 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0334727  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2233  chaperone protein DnaK  25.45 
 
 
629 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.1601  hitchhiker  0.0019124 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2835  molecular chaperone DnaK  23.69 
 
 
639 aa  50.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0015  molecular chaperone DnaK  24.11 
 
 
638 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12160  chaperone protein DnaK  26.53 
 
 
620 aa  50.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511461  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3080  molecular chaperone DnaK  24.48 
 
 
638 aa  50.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.312275  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00014  molecular chaperone DnaK  24.11 
 
 
638 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3583  chaperone protein DnaK  24.11 
 
 
638 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766663  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0012  molecular chaperone DnaK  24.11 
 
 
638 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1126  molecular chaperone DnaK  25.09 
 
 
639 aa  49.3  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2785  molecular chaperone DnaK  22.22 
 
 
647 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134796  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4299  chaperone protein DnaK  24.09 
 
 
614 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1023  molecular chaperone DnaK  23.33 
 
 
637 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0552  chaperone protein DnaK  24.8 
 
 
631 aa  49.3  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2464  molecular chaperone DnaK  23.28 
 
 
651 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0352  Heat shock protein 70  26.46 
 
 
858 aa  49.7  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1194  molecular chaperone DnaK  24.71 
 
 
635 aa  48.9  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00921212  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0957  molecular chaperone DnaK  25.09 
 
 
639 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3642  molecular chaperone DnaK  24.11 
 
 
638 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297376  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1476  molecular chaperone DnaK  24.57 
 
 
647 aa  49.3  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0014  molecular chaperone DnaK  24.11 
 
 
638 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2971  molecular chaperone DnaK  25.43 
 
 
639 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00014  hypothetical protein  24.11 
 
 
638 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1358  chaperone protein DnaK  22.54 
 
 
626 aa  49.3  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00416973  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0017  molecular chaperone DnaK  24.11 
 
 
638 aa  49.7  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00276008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>