63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0449 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0436  hypothetical protein  96.57 
 
 
613 aa  907    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0459  hypothetical protein  100 
 
 
611 aa  1154    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0872017  normal  0.526818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0449  hypothetical protein  100 
 
 
611 aa  1154    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00263959  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0271  hypothetical protein  58.56 
 
 
617 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0626  hypothetical protein  60.28 
 
 
609 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.379396  normal  0.0958699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0276  hypothetical protein  43.23 
 
 
608 aa  280  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0431  hypothetical protein  44.13 
 
 
601 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100055  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0454  hypothetical protein  44.13 
 
 
601 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.23785  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0444  hypothetical protein  44.13 
 
 
601 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0621  hypothetical protein  42.86 
 
 
610 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.515489  normal  0.106222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0433  hypothetical protein  45.82 
 
 
582 aa  256  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.142496 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0410  hypothetical protein  49.07 
 
 
594 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0401  hypothetical protein  49.07 
 
 
594 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0389  hypothetical protein  49.07 
 
 
594 aa  250  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0961812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3386  hypothetical protein  45.24 
 
 
568 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732691  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3448  hypothetical protein  45.24 
 
 
568 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3397  molecular chaperone-like  45.24 
 
 
568 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166974  normal  0.969377 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0308  hypothetical protein  44.59 
 
 
598 aa  244  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10317  proline and threonine rich protein  37.8 
 
 
620 aa  210  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12291  proline rich protein  39.04 
 
 
592 aa  208  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.852412  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3087  Heat shock protein 70  29.67 
 
 
683 aa  85.9  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1415  Heat shock protein 70  33.33 
 
 
657 aa  67.4  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1946  heat shock protein 70  28.57 
 
 
957 aa  67  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253458  normal  0.635918 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27840  molecular chaperone  30.09 
 
 
658 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0363632 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6358  heat shock protein 70  28.83 
 
 
380 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5965  Molecular chaperone-like protein  28 
 
 
861 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000466156  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  25.81 
 
 
1888 aa  59.7  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3550  Heat shock protein 70  29.79 
 
 
632 aa  57.4  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.149708  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04390  molecular chaperone  30.39 
 
 
665 aa  57.4  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48656  normal  0.554672 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05490  chaperone protein DnaK  24.9 
 
 
631 aa  57.4  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6569  Heat shock protein 70  31.09 
 
 
643 aa  57  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  26.04 
 
 
3521 aa  57.4  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0982  molecular chaperone DnaK  24.44 
 
 
644 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000339197  unclonable  0.0000180058 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1208  molecular chaperone DnaK  24.66 
 
 
636 aa  56.2  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1636  heat shock protein 70  27.04 
 
 
632 aa  55.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.674919  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1651  heat shock protein 70  27.54 
 
 
631 aa  55.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.660116  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1181  molecular chaperone, DnaK family  25.55 
 
 
636 aa  55.1  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0502129  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4213  molecular chaperone DnaK  29.1 
 
 
611 aa  54.3  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000284516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4433  molecular chaperone DnaK  29.1 
 
 
611 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000173012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4336  molecular chaperone DnaK  29.1 
 
 
611 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67993e-38 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4539  molecular chaperone DnaK  29.1 
 
 
611 aa  54.3  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000969384  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4061  molecular chaperone DnaK  29.1 
 
 
611 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000542106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4051  molecular chaperone DnaK  29.1 
 
 
611 aa  54.3  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0803  molecular chaperone DnaK  29.1 
 
 
611 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000557012  hitchhiker  1.18258e-19 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3800  heat shock protein 70  25.8 
 
 
880 aa  53.9  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122258  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3003  heat shock protein 70  28.27 
 
 
935 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376537  normal  0.234156 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4165  molecular chaperone DnaK  28.57 
 
 
611 aa  52.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0072304  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6931  chaperone protein DnaK  26.15 
 
 
637 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.524879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6054  Heat shock protein 70  29.45 
 
 
793 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929269  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4793  chaperone protein DnaK  23.87 
 
 
637 aa  51.2  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126797  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6270  chaperone protein DnaK  25.58 
 
 
639 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0832  heat shock protein 70  24.93 
 
 
633 aa  47.8  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.901264  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  40.48 
 
 
2353 aa  47.8  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0191  molecular chaperone DnaK  23.86 
 
 
631 aa  47.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.837679  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1996  chaperone protein DnaK  22.75 
 
 
616 aa  47.4  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278133  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0352  Heat shock protein 70  31.58 
 
 
858 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  52.17 
 
 
453 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  31.37 
 
 
444 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  34.44 
 
 
484 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  53.42 
 
 
268 aa  45.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  33.33 
 
 
489 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  45.9 
 
 
1281 aa  44.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2693  Heat shock protein 70  28.08 
 
 
597 aa  43.9  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122033  normal  0.114387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>