280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3448 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3386  hypothetical protein  100 
 
 
568 aa  1068    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732691  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3397  molecular chaperone-like  100 
 
 
568 aa  1068    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166974  normal  0.969377 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3448  hypothetical protein  100 
 
 
568 aa  1068    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12291  proline rich protein  50.21 
 
 
592 aa  332  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.852412  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0621  hypothetical protein  42.58 
 
 
610 aa  311  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.515489  normal  0.106222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0276  hypothetical protein  43.64 
 
 
608 aa  298  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0431  hypothetical protein  45.45 
 
 
601 aa  294  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100055  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0444  hypothetical protein  45.45 
 
 
601 aa  294  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0454  hypothetical protein  45.45 
 
 
601 aa  294  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.23785  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0389  hypothetical protein  48.4 
 
 
594 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0961812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0401  hypothetical protein  48.16 
 
 
594 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0410  hypothetical protein  48.16 
 
 
594 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0436  hypothetical protein  47.22 
 
 
613 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0449  hypothetical protein  46.76 
 
 
611 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00263959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0459  hypothetical protein  46.76 
 
 
611 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0872017  normal  0.526818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0433  hypothetical protein  43.29 
 
 
582 aa  265  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.142496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0308  hypothetical protein  40.28 
 
 
598 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10317  proline and threonine rich protein  40.56 
 
 
620 aa  247  4e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0626  hypothetical protein  44.5 
 
 
609 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.379396  normal  0.0958699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0271  hypothetical protein  40.68 
 
 
617 aa  232  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3800  heat shock protein 70  31.07 
 
 
880 aa  90.9  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122258  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1651  heat shock protein 70  31 
 
 
631 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.660116  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1636  heat shock protein 70  28.33 
 
 
632 aa  84  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.674919  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1946  heat shock protein 70  28.68 
 
 
957 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253458  normal  0.635918 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1415  Heat shock protein 70  30.82 
 
 
657 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3550  Heat shock protein 70  30.11 
 
 
632 aa  67.8  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.149708  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27840  molecular chaperone  30.8 
 
 
658 aa  64.7  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0363632 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04390  molecular chaperone  29.79 
 
 
665 aa  64.3  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48656  normal  0.554672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6569  Heat shock protein 70  31.31 
 
 
643 aa  64.3  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0241  dnaK family protein  26.12 
 
 
575 aa  63.9  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215943  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0238  dnaK family protein  26.12 
 
 
575 aa  63.9  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.878692  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0892  chaperone protein HscA  25.27 
 
 
582 aa  62.4  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2693  Heat shock protein 70  30.52 
 
 
597 aa  61.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122033  normal  0.114387 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4165  molecular chaperone DnaK  30.91 
 
 
611 aa  61.2  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0072304  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3027  Heat shock protein 70  24.37 
 
 
584 aa  61.2  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0803  molecular chaperone DnaK  28.83 
 
 
611 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000557012  hitchhiker  1.18258e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4213  molecular chaperone DnaK  28.83 
 
 
611 aa  60.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000284516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4051  molecular chaperone DnaK  28.83 
 
 
611 aa  60.8  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4061  molecular chaperone DnaK  28.83 
 
 
611 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000542106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4433  molecular chaperone DnaK  28.83 
 
 
611 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000173012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4539  molecular chaperone DnaK  28.83 
 
 
611 aa  60.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000969384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5965  Molecular chaperone-like protein  28 
 
 
861 aa  60.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000466156  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4336  molecular chaperone DnaK  28.83 
 
 
611 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67993e-38 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0107  molecular chaperone DnaK  27.17 
 
 
634 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0126383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6358  heat shock protein 70  31.51 
 
 
380 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0096  chaperone protein DnaK  26.32 
 
 
636 aa  58.5  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0207175 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1403  molecular chaperone DnaK  22.63 
 
 
625 aa  58.2  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000203004  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0406  heat shock protein Hsp70  22.83 
 
 
618 aa  57.8  0.0000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38489  Molecular chaperones HSP70/HSC70, HSP70 superfamily Heat-shock protein 70 (HSP72)  28.26 
 
 
612 aa  57.8  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.839157  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6054  Heat shock protein 70  30.41 
 
 
793 aa  57.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929269  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28757  heat shock protein 70  25.46 
 
 
946 aa  57.8  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0849325  normal  0.596472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3003  heat shock protein 70  27.4 
 
 
935 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376537  normal  0.234156 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0935  molecular chaperone DnaK  22.83 
 
 
622 aa  57.4  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.550928  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0982  molecular chaperone DnaK  27.71 
 
 
644 aa  57  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000339197  unclonable  0.0000180058 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3040  molecular chaperone DnaK  27.61 
 
 
611 aa  57  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00371725  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1258  molecular chaperone DnaK  23.37 
 
 
623 aa  56.2  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.757771  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4392  chaperone protein DnaK  27.4 
 
 
615 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.253837  normal  0.258584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2183  chaperone protein DnaK  24.59 
 
 
640 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137108  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1119  molecular chaperone DnaK  22.75 
 
 
634 aa  55.8  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.828103  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2464  molecular chaperone DnaK  24.88 
 
 
651 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4447  molecular chaperone DnaK  27.61 
 
 
611 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000527769  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2870  molecular chaperone DnaK  24.88 
 
 
650 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0558  molecular chaperone-like protein  28.7 
 
 
439 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2635  molecular chaperone DnaK  24.4 
 
 
688 aa  55.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0170334  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0850  molecular chaperone DnaK  22.83 
 
 
623 aa  55.5  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.561749  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0004  chaperone protein DnaK  27.37 
 
 
638 aa  55.5  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0408404  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1358  chaperone protein DnaK  21.74 
 
 
626 aa  55.5  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00416973  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1462  chaperone protein HscA  28.27 
 
 
619 aa  55.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0476336  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0775  molecular chaperone DnaK  22.83 
 
 
623 aa  55.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.175007  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1208  molecular chaperone DnaK  24.73 
 
 
636 aa  54.7  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1128  molecular chaperone DnaK  26 
 
 
596 aa  54.7  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4395  molecular chaperone DnaK  27.61 
 
 
611 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00031537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14780  chaperone protein HscA  28.39 
 
 
619 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36840  hypothetical protein  31.25 
 
 
446 aa  54.3  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0323397 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0163  molecular chaperone DnaK  27.61 
 
 
607 aa  54.3  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2053  2-alkenal reductase  25.48 
 
 
540 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28169  Heat Shock Protein 70, cytosolic  24.32 
 
 
650 aa  53.9  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158488  hitchhiker  0.00292579 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2123  2-alkenal reductase  25.48 
 
 
540 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1753  putative chaperone heat-shock protein  39.2 
 
 
926 aa  53.9  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1807  heat shock protein 70  25.48 
 
 
540 aa  53.9  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.264877  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06010  Heat shock 70 kDa protein Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0C0]  24.37 
 
 
666 aa  53.5  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2046  molecular chaperone DnaK  23.37 
 
 
623 aa  53.5  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000592664  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1399  molecular chaperone DnaK  25 
 
 
637 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1303  chaperone protein HscA  29.36 
 
 
619 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323166  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1181  molecular chaperone, DnaK family  24.73 
 
 
636 aa  53.5  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0502129  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0352  Heat shock protein 70  32.93 
 
 
858 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0633  chaperone protein HscA  21.74 
 
 
617 aa  53.1  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.672596  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1427  chaperone protein HscA  29.67 
 
 
620 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0889  molecular chaperone DnaK  21.51 
 
 
617 aa  52.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4608  chaperone protein HscA  30.22 
 
 
621 aa  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317931  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3945  molecular chaperone-like protein  37.9 
 
 
918 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5309  molecular chaperone-like protein  38.71 
 
 
918 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3575  molecular chaperone-like protein  37.9 
 
 
918 aa  52.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0471148  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3460  chaperone protein DnaK  26.74 
 
 
612 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87680  Nuclear-encoded mitochondrial protein member of the heat shock protein 70 (HSP70) family  24.86 
 
 
650 aa  51.6  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.227121  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79362  heat shock protein of the HSP70 family (SSB1) (HSP75)  25.97 
 
 
613 aa  52  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00367292 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2135  putative chaperone protein, HscA/DnaK  32.81 
 
 
961 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0097  molecular chaperone DnaK  26.99 
 
 
609 aa  51.2  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3202  chaperone protein hscC  25.4 
 
 
566 aa  51.2  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617528  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0346  molecular chaperone DnaK  25.15 
 
 
600 aa  51.2  0.00005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.000727385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>