More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3575 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0986  hypothetical protein  45.83 
 
 
948 aa  808    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02520  hypothetical protein  45.57 
 
 
941 aa  834    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0495  DnaK-related protein  51.71 
 
 
951 aa  851    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0799575  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1306  DnaK-related protein  53.36 
 
 
951 aa  872    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1827  putative chaperone heat-shock protein  44.08 
 
 
938 aa  813    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.276059  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2135  putative chaperone protein, HscA/DnaK  67.61 
 
 
961 aa  1229    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3698  DnaK-related protein  51.45 
 
 
956 aa  849    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.900724 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1458  DnaK-related protein  70.41 
 
 
935 aa  1245    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.103212  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1753  putative chaperone heat-shock protein  67.1 
 
 
926 aa  1216    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277549  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0047  heat shock protein 70  70.09 
 
 
935 aa  1238    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1546  DnaK-related protein  70.3 
 
 
935 aa  1242    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3130  DnaK-related protein  47.3 
 
 
929 aa  661    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2544  molecular chaperone-like  95.52 
 
 
914 aa  1664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.374028  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1319  DnaK-related protein  69.95 
 
 
931 aa  1206    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981392  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3945  molecular chaperone-like protein  98.58 
 
 
918 aa  1786    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3490  molecular chaperone-like protein  91.96 
 
 
918 aa  1599    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0310238 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3032  DnaK-related protein  48.05 
 
 
925 aa  682    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192124  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003559  DnaK-related protein  45.86 
 
 
936 aa  832    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3740  putative chaperone heat-shock protein  52.33 
 
 
952 aa  857    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.207113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5719  DnaK-related protein  52.07 
 
 
951 aa  836    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.376499 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5107  molecular chaperone-like protein  88.67 
 
 
918 aa  1548    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2123  putative chaperone protein, HscA/DnaK  66.29 
 
 
986 aa  1226    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1233  chaperone DnaK-related protein  48.94 
 
 
939 aa  885    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0953918 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3231  DnaK-related protein  47.78 
 
 
929 aa  667    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.717764  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3012  DnaK-related protein  46.85 
 
 
936 aa  653    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.791103  normal  0.506034 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3676  putative chaperone protein, HscA/DnaK  57.74 
 
 
966 aa  994    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.771726  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5309  molecular chaperone-like protein  92.49 
 
 
918 aa  1603    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5541  DnaK-related protein  67.72 
 
 
949 aa  1251    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0176695 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3575  molecular chaperone-like protein  100 
 
 
918 aa  1808    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0471148  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0059  DnaK-related protein  59.58 
 
 
942 aa  997    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0152  Heat shock protein 70  41.03 
 
 
987 aa  617  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0625  DnaK-related protein  38.02 
 
 
961 aa  570  1e-161  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0343  DnaK-related protein  39.11 
 
 
971 aa  569  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.87364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2055  molecular chaperone  35.78 
 
 
906 aa  526  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.421939  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3013  putative heat-shock chaperone protein  46.86 
 
 
620 aa  446  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0151  molecular chaperone  43.6 
 
 
622 aa  435  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1305  DnaK-related protein  42.07 
 
 
658 aa  425  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1752  putative heat-shock chaperone protein  43.68 
 
 
614 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3232  putative heat-shock chaperone protein  46.13 
 
 
627 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.838749  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3131  putative heat-shock chaperone protein  46.13 
 
 
627 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3922  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  42.35 
 
 
596 aa  417  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5720  putative heat-shock chaperone protein  42.15 
 
 
621 aa  418  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.531884 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0058  DnaK-related protein  43.82 
 
 
615 aa  419  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3696  putative heat-shock chaperone protein  43.41 
 
 
636 aa  414  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.297588  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2124  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  42.2 
 
 
622 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3033  putative heat-shock chaperone protein  45.91 
 
 
631 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0497  putative heat-shock chaperone protein  43.25 
 
 
636 aa  412  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271462  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1457  putative chaperone protein  42.58 
 
 
615 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02519  molecular chaperone  38.52 
 
 
654 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2545  molecular chaperone-like  42.63 
 
 
613 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173516  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1320  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  42.79 
 
 
615 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5108  molecular chaperone-like protein  42.33 
 
 
613 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.968057  normal  0.0457936 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003558  DnaK-related protein  38.75 
 
 
651 aa  405  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00228279  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5540  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  41.59 
 
 
619 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218183  normal  0.0196967 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0045  heat shock protein 70  42.4 
 
 
615 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1826  putative heat-shock chaperone protein  38.7 
 
 
606 aa  405  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143123  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3489  molecular chaperone-like protein  42.81 
 
 
613 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00629635 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1545  putative chaperone protein  42.4 
 
 
615 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166713  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3739  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  41.75 
 
 
610 aa  406  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676013  normal  0.253359 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3574  molecular chaperone-like protein  42.31 
 
 
613 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0682429  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3946  molecular chaperone-like protein  42.15 
 
 
613 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537274  normal  0.958876 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5308  molecular chaperone-like protein  42.65 
 
 
613 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3677  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  40.38 
 
 
637 aa  398  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786071  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1232  chaperone DnaK-related protein  38.02 
 
 
643 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2134  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  41.56 
 
 
619 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.660367  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2054  heat shock protein 70  38.24 
 
 
592 aa  357  5e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.462167  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0987  hypothetical protein  40.28 
 
 
513 aa  340  5e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1633  chaperone protein HscA  33.45 
 
 
650 aa  97.1  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.898669  hitchhiker  0.000131814 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1024  chaperone protein HscA  32.02 
 
 
621 aa  94.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.662352  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1481  chaperone protein HscA  30.06 
 
 
625 aa  91.3  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0290356 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2689  Heat shock protein 70  26.27 
 
 
562 aa  90.5  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0633  chaperone protein HscA  30.15 
 
 
617 aa  87.8  7e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.672596  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1660  chaperone protein HscA  28.89 
 
 
625 aa  88.2  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072963 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1454  chaperone protein HscA  32.42 
 
 
623 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0597  chaperone protein HscA  30.43 
 
 
626 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0631  chaperone protein HscA  30.43 
 
 
625 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0622  chaperone protein HscA  30.43 
 
 
625 aa  85.9  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199695  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1557  chaperone protein HscA  32.33 
 
 
613 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218099  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1241  chaperone protein HscA  32.86 
 
 
620 aa  84.7  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1565  Fe-S protein assembly chaperone HscA  32.14 
 
 
625 aa  84  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2575  chaperone protein HscA  33.33 
 
 
623 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3507  chaperone protein HscA  32.86 
 
 
621 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0954  chaperone protein HscA  30.34 
 
 
621 aa  82.4  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0282439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14780  chaperone protein HscA  32.18 
 
 
619 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0406  heat shock protein Hsp70  26.72 
 
 
618 aa  82  0.00000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1364  Fe-S protein assembly chaperone HscA  34.19 
 
 
636 aa  81.6  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1089  molecular chaperone DnaK  27.39 
 
 
626 aa  81.3  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000419438  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0889  chaperone protein HscA  30.34 
 
 
621 aa  81.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0490665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1427  chaperone protein HscA  32.74 
 
 
620 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4608  chaperone protein HscA  31.58 
 
 
621 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317931  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2046  molecular chaperone DnaK  28.29 
 
 
623 aa  80.1  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000592664  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1148  chaperone protein HscA  31.08 
 
 
622 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.505415  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1954  chaperone protein HscA  31.69 
 
 
629 aa  79.7  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.296275  normal  0.863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0889  chaperone protein HscA  31.23 
 
 
620 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000727661 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2651  chaperone protein HscA  32 
 
 
622 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2595  chaperone protein HscA  32 
 
 
622 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.899432  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1029  2-alkenal reductase  23.69 
 
 
527 aa  80.1  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.777286  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0490  chaperone protein DnaK  28.25 
 
 
623 aa  79.7  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000032469  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4332  chaperone protein HscA  30.91 
 
 
620 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000366602 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2139  chaperone protein HscA  30.98 
 
 
622 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>