More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0625 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0625  DnaK-related protein  100 
 
 
961 aa  1959    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0152  Heat shock protein 70  39.36 
 
 
987 aa  606  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0343  DnaK-related protein  39.74 
 
 
971 aa  591  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.87364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5541  DnaK-related protein  37.86 
 
 
949 aa  582  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0176695 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1753  putative chaperone heat-shock protein  37.59 
 
 
926 aa  581  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277549  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2135  putative chaperone protein, HscA/DnaK  37.94 
 
 
961 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2544  molecular chaperone-like  38.17 
 
 
914 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.374028  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3575  molecular chaperone-like protein  37.91 
 
 
918 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0471148  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3945  molecular chaperone-like protein  37.81 
 
 
918 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2123  putative chaperone protein, HscA/DnaK  36.67 
 
 
986 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3032  DnaK-related protein  39.09 
 
 
925 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192124  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3676  putative chaperone protein, HscA/DnaK  36.35 
 
 
966 aa  553  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.771726  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3231  DnaK-related protein  37.99 
 
 
929 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.717764  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1458  DnaK-related protein  37.67 
 
 
935 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.103212  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1546  DnaK-related protein  37.46 
 
 
935 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0047  heat shock protein 70  37.56 
 
 
935 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0986  hypothetical protein  35.82 
 
 
948 aa  546  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5309  molecular chaperone-like protein  37.5 
 
 
918 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3490  molecular chaperone-like protein  36.93 
 
 
918 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0310238 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003559  DnaK-related protein  35.61 
 
 
936 aa  548  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5107  molecular chaperone-like protein  36.92 
 
 
918 aa  544  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3130  DnaK-related protein  37.78 
 
 
929 aa  542  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02520  hypothetical protein  35.25 
 
 
941 aa  542  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1319  DnaK-related protein  37.49 
 
 
931 aa  535  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3740  putative chaperone heat-shock protein  36.69 
 
 
952 aa  531  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.207113 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0059  DnaK-related protein  38.17 
 
 
942 aa  530  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1827  putative chaperone heat-shock protein  33.71 
 
 
938 aa  532  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.276059  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3012  DnaK-related protein  38.81 
 
 
936 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.791103  normal  0.506034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1233  chaperone DnaK-related protein  34.57 
 
 
939 aa  526  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0953918 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3698  DnaK-related protein  36.08 
 
 
956 aa  525  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.900724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0495  DnaK-related protein  35.96 
 
 
951 aa  522  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0799575  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1306  DnaK-related protein  36.61 
 
 
951 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5719  DnaK-related protein  35.25 
 
 
951 aa  496  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.376499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0151  molecular chaperone  42.2 
 
 
622 aa  461  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1826  putative heat-shock chaperone protein  40.61 
 
 
606 aa  453  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143123  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3677  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  42.22 
 
 
637 aa  451  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786071  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2545  molecular chaperone-like  43.91 
 
 
613 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173516  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5720  putative heat-shock chaperone protein  42.42 
 
 
621 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.531884 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5308  molecular chaperone-like protein  44.07 
 
 
613 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3574  molecular chaperone-like protein  44.23 
 
 
613 aa  452  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0682429  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3946  molecular chaperone-like protein  44.07 
 
 
613 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537274  normal  0.958876 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3489  molecular chaperone-like protein  43.91 
 
 
613 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00629635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0497  putative heat-shock chaperone protein  42.83 
 
 
636 aa  449  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271462  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3696  putative heat-shock chaperone protein  42.83 
 
 
636 aa  449  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.297588  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1752  putative heat-shock chaperone protein  43.7 
 
 
614 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02519  molecular chaperone  40.63 
 
 
654 aa  445  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5108  molecular chaperone-like protein  43.25 
 
 
613 aa  446  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.968057  normal  0.0457936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2124  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  43.11 
 
 
622 aa  446  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5540  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  42.83 
 
 
619 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218183  normal  0.0196967 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1320  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  43.13 
 
 
615 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1232  chaperone DnaK-related protein  40.49 
 
 
643 aa  442  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003558  DnaK-related protein  40.35 
 
 
651 aa  439  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00228279  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0058  DnaK-related protein  43.36 
 
 
615 aa  439  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1457  putative chaperone protein  42.52 
 
 
615 aa  435  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0045  heat shock protein 70  42.58 
 
 
615 aa  436  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1545  putative chaperone protein  42.42 
 
 
615 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166713  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3739  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  41.14 
 
 
610 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676013  normal  0.253359 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2134  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  43.02 
 
 
619 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.660367  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1305  DnaK-related protein  39.49 
 
 
658 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2055  molecular chaperone  31.61 
 
 
906 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.421939  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3013  putative heat-shock chaperone protein  41.48 
 
 
620 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3131  putative heat-shock chaperone protein  40.51 
 
 
627 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3232  putative heat-shock chaperone protein  39.84 
 
 
627 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.838749  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3922  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  39.1 
 
 
596 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3033  putative heat-shock chaperone protein  39.55 
 
 
631 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0987  hypothetical protein  40.12 
 
 
513 aa  361  5e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2054  heat shock protein 70  35.51 
 
 
592 aa  350  7e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.462167  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1242  Fe-S protein assembly chaperone HscA  28.07 
 
 
622 aa  89  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2139  chaperone protein HscA  28.78 
 
 
622 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0988  heat shock protein 70  42.72 
 
 
105 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0440  chaperone protein DnaK  31.99 
 
 
618 aa  85.9  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5955  chaperone protein HscA  28.36 
 
 
622 aa  86.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2122  chaperone protein HscA  28.36 
 
 
622 aa  86.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5428  chaperone protein HscA  29.36 
 
 
622 aa  85.5  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266474  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0481  molecular chaperone DnaK  27.13 
 
 
632 aa  84  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.995968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2159  chaperone protein HscA  27.35 
 
 
622 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.265898  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1148  chaperone protein HscA  28.19 
 
 
622 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.505415  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3623  chaperone protein HscA  29.15 
 
 
616 aa  82  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1454  chaperone protein HscA  28.32 
 
 
623 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0406  heat shock protein Hsp70  25 
 
 
618 aa  81.3  0.00000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0490  chaperone protein DnaK  29.68 
 
 
623 aa  81.3  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000032469  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0431  chaperone protein HscA  27.37 
 
 
638 aa  80.9  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2032  chaperone protein HscA  27.19 
 
 
622 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2689  Heat shock protein 70  26.71 
 
 
562 aa  80.9  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3023  chaperone protein HscA  27.67 
 
 
616 aa  80.5  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.168254  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1280  chaperone protein HscA  27.37 
 
 
638 aa  80.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1600  molecular chaperone DnaK  27 
 
 
641 aa  80.1  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.56491  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0004  molecular chaperone DnaK  26.61 
 
 
631 aa  80.1  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0827361  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1633  chaperone protein HscA  26.71 
 
 
650 aa  80.1  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.898669  hitchhiker  0.000131814 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1172  chaperone protein HscA  27.08 
 
 
644 aa  79.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1282  chaperone protein DnaK  28.88 
 
 
627 aa  79.7  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3094  chaperone DnaK  27.59 
 
 
644 aa  79.3  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0408879  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1660  chaperone protein HscA  26.51 
 
 
625 aa  79.3  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072963 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0864  molecular chaperone DnaK  27.24 
 
 
640 aa  79.3  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.873902  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1856  dnaK protein  27.03 
 
 
641 aa  79  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26903  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3072  chaperone protein DnaK  25.91 
 
 
636 aa  78.6  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0257567  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3231  Fe-S protein assembly chaperone HscA  27.39 
 
 
628 aa  78.6  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.124104 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2333  Heat shock protein 70  27.56 
 
 
571 aa  79  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0102909  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0943  hypothetical protein  26.91 
 
 
621 aa  79  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0513981  normal  0.126736 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2156  molecular chaperone DnaK  25.67 
 
 
640 aa  78.6  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>