More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1242 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02418  chaperone protein HscA  68.81 
 
 		 616 aa  810    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89877  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1142  Fe-S protein assembly chaperone HscA  68.97 
 
 		 616 aa  811    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1303  chaperone protein HscA  60.45 
 
 		 619 aa  713    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323166  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2313  chaperone protein HscA  64.95 
 
 		 620 aa  788    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.677318  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0846  chaperone protein HscA  59.71 
 
 		 620 aa  707    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1780  chaperone protein HscA  66.56 
 
 		 620 aa  777    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166205 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0252  chaperone protein HscA  57.97 
 
 		 619 aa  666    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1172  chaperone protein HscA  64.77 
 
 		 644 aa  791    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1248  chaperone protein HscA  65.92 
 
 		 616 aa  777    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.873456  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1024  chaperone protein HscA  59.62 
 
 		 621 aa  689    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.662352  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1136  chaperone protein HscA  64.54 
 
 		 620 aa  790    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14780  chaperone protein HscA  60.61 
 
 		 619 aa  715    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2678  chaperone protein HscA  68.33 
 
 		 616 aa  812    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3507  chaperone protein HscA  61.76 
 
 		 621 aa  728    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2268  chaperone protein HscA  65.44 
 
 		 620 aa  785    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1427  chaperone protein HscA  59.87 
 
 		 620 aa  706    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1704  chaperone protein HscA  58.88 
 
 		 622 aa  692    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.366095  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2498  chaperone protein HscA  64.9 
 
 		 620 aa  776    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184268  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3027  chaperone protein HscA  65.92 
 
 		 616 aa  781    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1241  chaperone protein HscA  59.87 
 
 		 620 aa  710    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2055  2-alkenal reductase  63.18 
 
 		 623 aa  749    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.223423  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1492  chaperone protein HscA  66.08 
 
 		 620 aa  808    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1954  chaperone protein HscA  58.12 
 
 		 629 aa  662    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.296275  normal  0.863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0889  chaperone protein HscA  59.87 
 
 		 620 aa  708    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000727661 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1063  chaperone protein HscA  58.33 
 
 		 621 aa  689    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1565  Fe-S protein assembly chaperone HscA  57.74 
 
 		 625 aa  668    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1108  chaperone protein HscA  66.88 
 
 		 616 aa  807    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473858  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1454  chaperone protein HscA  57.35 
 
 		 623 aa  677    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1168  chaperone protein HscA  58.75 
 
 		 620 aa  680    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2694  chaperone protein HscA  67.85 
 
 		 616 aa  820    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1642  chaperone protein HscA  56.06 
 
 		 622 aa  646    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.393087  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2728  chaperone protein HscA  58.88 
 
 		 622 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3757  chaperone protein HscA  68.97 
 
 		 616 aa  811    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0170788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0281  chaperone protein HscA  66.08 
 
 		 616 aa  800    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00307418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4608  chaperone protein HscA  60.67 
 
 		 621 aa  715    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2382  chaperone protein HscA  65.06 
 
 		 620 aa  778    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000622111  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3995  chaperone protein HscA  55.34 
 
 		 622 aa  642    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300549 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2276  chaperone protein HscA  65.27 
 
 		 620 aa  790    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000669317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5428  chaperone protein HscA  57.44 
 
 		 622 aa  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2677  chaperone protein HscA  68.97 
 
 		 616 aa  811    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2801  chaperone protein HscA  68.17 
 
 		 616 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2213  chaperone protein HscA  58.88 
 
 		 622 aa  692    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01059  chaperone protein HscA  65.59 
 
 		 617 aa  803    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2139  chaperone protein HscA  57.96 
 
 		 622 aa  680    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1485  chaperone protein HscA  58.88 
 
 		 622 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2651  chaperone protein HscA  58.88 
 
 		 622 aa  678    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1489  chaperone protein HscA  55.61 
 
 		 621 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1280  chaperone protein HscA  65.37 
 
 		 638 aa  795    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2145  chaperone protein HscA  64.74 
 
 		 620 aa  778    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000851094  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1879  chaperone protein HscA  58.24 
 
 		 622 aa  685    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737508  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0834  Fe-S protein assembly chaperone HscA  58.94 
 
 		 627 aa  690    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.255655 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3023  chaperone protein HscA  68.01 
 
 		 616 aa  806    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.168254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1328  Fe-S protein assembly chaperone HscA  63.38 
 
 		 623 aa  735    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2032  chaperone protein HscA  58.24 
 
 		 622 aa  686    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0889  chaperone protein HscA  59.13 
 
 		 621 aa  689    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0490665 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2901  chaperone protein HscA  68.81 
 
 		 616 aa  808    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.87079  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1965  chaperone protein HscA  64.9 
 
 		 620 aa  778    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0206747  hitchhiker  0.000657718 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1151  chaperone protein HscA  68.97 
 
 		 616 aa  811    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2575  chaperone protein HscA  57.51 
 
 		 623 aa  671    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240484 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0473  chaperone protein HscA  55.68 
 
 		 621 aa  637    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0804  Fe-S protein assembly chaperone HscA  58.91 
 
 		 622 aa  695    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.428496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1440  Fe-S protein assembly chaperone HscA  56.71 
 
 		 624 aa  664    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.241862  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2913  chaperone protein HscA  68.01 
 
 		 616 aa  822    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1462  chaperone protein HscA  65.43 
 
 		 619 aa  788    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0476336  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4332  chaperone protein HscA  60.03 
 
 		 620 aa  710    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000366602 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02382  hypothetical protein  68.81 
 
 		 616 aa  810    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0721  chaperone protein HscA  65.76 
 
 		 617 aa  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40360  chaperone protein HscA  60.74 
 
 		 621 aa  714    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3107  chaperone protein HscA  58.88 
 
 		 622 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.594657  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1029  chaperone protein HscA  58.01 
 
 		 621 aa  680    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.175393  normal  0.210751 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2201  chaperone protein HscA  58.31 
 
 		 622 aa  664    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112267  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1297  chaperone protein HscA  65.76 
 
 		 619 aa  790    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0167807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2393  chaperone protein HscA  65.06 
 
 		 620 aa  778    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000110447  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1148  chaperone protein HscA  58.72 
 
 		 622 aa  687    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.505415  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2595  chaperone protein HscA  58.88 
 
 		 622 aa  678    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.899432  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0431  chaperone protein HscA  65.06 
 
 		 638 aa  790    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0876  chaperone protein HscA  59.71 
 
 		 620 aa  707    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70427  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5955  chaperone protein HscA  57.76 
 
 		 622 aa  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1242  Fe-S protein assembly chaperone HscA  100 
 
 		 622 aa  1254    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2738  chaperone protein HscA  68.17 
 
 		 616 aa  822    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0954  chaperone protein HscA  59.62 
 
 		 621 aa  693    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282439 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0285  chaperone protein HscA  63.5 
 
 		 616 aa  779    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2140  chaperone protein HscA  56.06 
 
 		 622 aa  646    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0156468 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2747  chaperone protein HscA  67.52 
 
 		 616 aa  809    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2122  chaperone protein HscA  57.76 
 
 		 622 aa  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2810  chaperone protein HscA  68.81 
 
 		 616 aa  808    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.648326  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1743  chaperone protein HscA  65.43 
 
 		 620 aa  790    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000392017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2867  chaperone protein HscA  66.72 
 
 		 620 aa  766    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000418416 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1823  chaperone protein HscA  65.43 
 
 		 620 aa  790    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.582459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3623  chaperone protein HscA  67.85 
 
 		 616 aa  822    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1043  chaperone protein HscA  56 
 
 		 621 aa  639    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2420  chaperone protein HscA  64.74 
 
 		 619 aa  769    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.643944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2779  chaperone protein HscA  68.17 
 
 		 616 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.346282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004356  chaperone protein HscA  66.88 
 
 		 617 aa  817    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2159  chaperone protein HscA  58.08 
 
 		 622 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.265898  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2377  chaperone protein HscA  55.4 
 
 		 622 aa  634  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.750622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2447  chaperone protein HscA  55.41 
 
 		 620 aa  632  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2182  chaperone protein HscA  54.95 
 
 		 620 aa  634  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0873671  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1557  chaperone protein HscA  57.14 
 
 		 613 aa  634  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218099  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2181  chaperone protein HscA  54.57 
 
 		 618 aa  629  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.174221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>