More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1282 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00014  molecular chaperone DnaK  54.22 
 
 		 638 aa  644    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3583  chaperone protein DnaK  54.22 
 
 		 638 aa  644    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766663  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0675  molecular chaperone DnaK  55 
 
 		 658 aa  647    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.549648  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1399  molecular chaperone DnaK  56.94 
 
 		 637 aa  683    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0033  molecular chaperone DnaK  58.49 
 
 		 636 aa  717    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4727  molecular chaperone DnaK  55.31 
 
 		 641 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_002950  PG1208  molecular chaperone DnaK  55.75 
 
 		 640 aa  671    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.48647 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0628  molecular chaperone DnaK  54.89 
 
 		 646 aa  673    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0264746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1148  molecular chaperone DnaK  61 
 
 		 609 aa  695    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1856  dnaK protein  55.47 
 
 		 641 aa  676    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26903  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0928  molecular chaperone DnaK  53.75 
 
 		 640 aa  651    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.689493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2635  molecular chaperone DnaK  54.5 
 
 		 688 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0170334  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4395  molecular chaperone DnaK  59.78 
 
 		 611 aa  692    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00031537  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0850  molecular chaperone DnaK  56.34 
 
 		 623 aa  654    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.561749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0097  molecular chaperone DnaK  58.25 
 
 		 609 aa  650    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2125  molecular chaperone DnaK  55.02 
 
 		 637 aa  657    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.864242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4213  molecular chaperone DnaK  59.13 
 
 		 611 aa  683    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000284516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4051  molecular chaperone DnaK  59.13 
 
 		 611 aa  683    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4061  molecular chaperone DnaK  59.13 
 
 		 611 aa  683    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000542106  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2326  molecular chaperone DnaK  55.41 
 
 		 650 aa  638    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4195  molecular chaperone DnaK  54.06 
 
 		 638 aa  638    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.697831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0196  molecular chaperone DnaK  69.38 
 
 		 613 aa  873    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1313  molecular chaperone DnaK  56.47 
 
 		 630 aa  690    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.634921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2785  molecular chaperone DnaK  55.23 
 
 		 647 aa  661    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134796  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3433  molecular chaperone DnaK  57.53 
 
 		 620 aa  692    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0457031  normal  0.0513788 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1538  molecular chaperone protein DnaK  53.99 
 
 		 639 aa  642    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.163821 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0197  molecular chaperone DnaK  56.81 
 
 		 630 aa  667    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0141  molecular chaperone DnaK  54.67 
 
 		 629 aa  674    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0295  molecular chaperone DnaK  57.72 
 
 		 633 aa  688    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3322  molecular chaperone DnaK  55.41 
 
 		 650 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0763  molecular chaperone DnaK  54.67 
 
 		 638 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.240702  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1173  molecular chaperone DnaK  54.43 
 
 		 636 aa  649    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0107  molecular chaperone DnaK  56.68 
 
 		 634 aa  702    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0126383  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0621  molecular chaperone DnaK  53.95 
 
 		 637 aa  647    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2303  molecular chaperone DnaK  57.38 
 
 		 639 aa  677    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1893  molecular chaperone DnaK  54.5 
 
 		 637 aa  661    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.457552  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2674  molecular chaperone DnaK  56.3 
 
 		 637 aa  673    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3532  molecular chaperone DnaK  58.4 
 
 		 638 aa  714    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00119444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1023  molecular chaperone DnaK  56.92 
 
 		 637 aa  684    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0870  heat shock protein Hsp70  55.32 
 
 		 638 aa  643    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100089  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4539  molecular chaperone DnaK  59.13 
 
 		 611 aa  683    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000969384  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1644  molecular chaperone DnaK  55.69 
 
 		 628 aa  683    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000171491  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1797  molecular chaperone DnaK  56.07 
 
 		 645 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0693908  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2468  molecular chaperone DnaK  59.87 
 
 		 634 aa  729    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.501675  hitchhiker  0.000000000338371 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2239  molecular chaperone DnaK  52.84 
 
 		 644 aa  653    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0425957  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3555  molecular chaperone DnaK  55.56 
 
 		 639 aa  657    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0866908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  59.39 
 
 		 612 aa  706    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1580  chaperone DnaK  57.52 
 
 		 632 aa  674    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308505  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4328  molecular chaperone DnaK  54.8 
 
 		 609 aa  665    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.977158  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4352  molecular chaperone DnaK  68.9 
 
 		 616 aa  796    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0429  molecular chaperone DnaK  54.77 
 
 		 633 aa  667    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2054  molecular chaperone DnaK  54.62 
 
 		 635 aa  647    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0128  chaperone DnaK  56.98 
 
 		 610 aa  664    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.438221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1969  molecular chaperone DnaK  54.32 
 
 		 651 aa  657    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00608101  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0329  molecular chaperone DnaK  55.67 
 
 		 632 aa  653    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3126  molecular chaperone DnaK  54.5 
 
 		 647 aa  653    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00776768  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1312  molecular chaperone DnaK  56.23 
 
 		 620 aa  676    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.975938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0391  molecular chaperone DnaK  54.15 
 
 		 633 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3094  chaperone DnaK  54.17 
 
 		 644 aa  665    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0408879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0155  molecular chaperone DnaK  56.65 
 
 		 632 aa  666    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2922  molecular chaperone DnaK  54.38 
 
 		 648 aa  655    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0982  molecular chaperone DnaK  53.85 
 
 		 644 aa  659    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000339197  unclonable  0.0000180058 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0010  molecular chaperone DnaK  55.81 
 
 		 642 aa  662    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0949466  normal  0.47597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0402  molecular chaperone DnaK  53.75 
 
 		 643 aa  651    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.362768  normal  0.130805 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2058  molecular chaperone DnaK  54.4 
 
 		 634 aa  653    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0462  molecular chaperone DnaK  68.82 
 
 		 622 aa  833    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0589911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0784  chaperone DnaK  59.83 
 
 		 636 aa  712    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0679  molecular chaperone DnaK  55.56 
 
 		 636 aa  674    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470568  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3101  molecular chaperone DnaK  54.02 
 
 		 632 aa  659    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2290  molecular chaperone DnaK  59.49 
 
 		 619 aa  708    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  59.65 
 
 		 619 aa  716    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1306  molecular chaperone DnaK  57.3 
 
 		 638 aa  689    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1900  molecular chaperone DnaK  54.73 
 
 		 671 aa  671    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.393588  normal  0.969601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0490  chaperone protein DnaK  55.57 
 
 		 623 aa  650    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000032469  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  59.23 
 
 		 610 aa  701    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62970  molecular chaperone DnaK  53.76 
 
 		 637 aa  651    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0423823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1027  molecular chaperone DnaK  60.7 
 
 		 607 aa  678    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0288585  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1309  molecular chaperone  57.56 
 
 		 617 aa  668    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0486876  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0822  molecular chaperone DnaK  60.21 
 
 		 623 aa  687    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.762106 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1347  molecular chaperone DnaK  57.26 
 
 		 615 aa  653    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.730753  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0163  molecular chaperone DnaK  60.65 
 
 		 607 aa  656    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3808  molecular chaperone DnaK  73.56 
 
 		 622 aa  942    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0731  molecular chaperone DnaK  53.28 
 
 		 615 aa  647    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1036  chaperone protein DnaK  54.98 
 
 		 641 aa  684    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000619516  hitchhiker  0.000149965 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0510  chaperone protein DnaK  55.76 
 
 		 653 aa  660    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0638299  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2115  molecular chaperone DnaK  69.57 
 
 		 618 aa  843    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0501961 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1089  molecular chaperone DnaK  56.85 
 
 		 626 aa  680    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000419438  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1404  molecular chaperone DnaK  56.09 
 
 		 636 aa  687    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00594741  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0864  molecular chaperone DnaK  54.16 
 
 		 640 aa  642    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.873902  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2302  molecular chaperone DnaK  56.59 
 
 		 638 aa  678    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679983  normal  0.117002 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4363  chaperone protein DnaK  66.99 
 
 		 621 aa  813    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.62994  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0473  molecular chaperone DnaK  68.82 
 
 		 622 aa  833    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0634  molecular chaperone DnaK  66.77 
 
 		 622 aa  839    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2166  molecular chaperone DnaK  56.68 
 
 		 636 aa  687    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0684659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1226  molecular chaperone DnaK  57 
 
 		 654 aa  656    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0562315  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1526  molecular chaperone DnaK  53.57 
 
 		 647 aa  643    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3218  molecular chaperone DnaK  56.61 
 
 		 646 aa  656    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1328  molecular chaperone DnaK  54.63 
 
 		 631 aa  654    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0500  molecular chaperone DnaK  55.41 
 
 		 650 aa  638    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0979  molecular chaperone DnaK  55.85 
 
 		 653 aa  652    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911256  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>