More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3489 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5108  molecular chaperone-like protein  95.11 
 
 
613 aa  1151    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.968057  normal  0.0457936 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1305  DnaK-related protein  63.61 
 
 
658 aa  795    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3696  putative heat-shock chaperone protein  71.36 
 
 
636 aa  865    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.297588  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3946  molecular chaperone-like protein  96.9 
 
 
613 aa  1147    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537274  normal  0.958876 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003558  DnaK-related protein  59.87 
 
 
651 aa  751    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00228279  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1752  putative heat-shock chaperone protein  84.67 
 
 
614 aa  1018    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3013  putative heat-shock chaperone protein  57.87 
 
 
620 aa  664    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0045  heat shock protein 70  83.85 
 
 
615 aa  1001    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02519  molecular chaperone  60.22 
 
 
654 aa  754    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0497  putative heat-shock chaperone protein  71.03 
 
 
636 aa  865    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271462  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2545  molecular chaperone-like  96.9 
 
 
613 aa  1148    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173516  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1545  putative chaperone protein  83.69 
 
 
615 aa  999    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166713  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3677  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  75.33 
 
 
637 aa  929    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786071  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1320  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  86.3 
 
 
615 aa  1025    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1457  putative chaperone protein  83.69 
 
 
615 aa  998    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3033  putative heat-shock chaperone protein  57.62 
 
 
631 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3489  molecular chaperone-like protein  100 
 
 
613 aa  1224    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00629635 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2124  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  85.41 
 
 
622 aa  1033    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5720  putative heat-shock chaperone protein  71.97 
 
 
621 aa  900    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.531884 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3131  putative heat-shock chaperone protein  58.97 
 
 
627 aa  673    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2134  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  84.44 
 
 
619 aa  981    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.660367  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0058  DnaK-related protein  76.22 
 
 
615 aa  912    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1826  putative heat-shock chaperone protein  60.2 
 
 
606 aa  766    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143123  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5308  molecular chaperone-like protein  99.18 
 
 
613 aa  1216    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3574  molecular chaperone-like protein  96.9 
 
 
613 aa  1147    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0682429  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3232  putative heat-shock chaperone protein  58.32 
 
 
627 aa  666    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.838749  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1232  chaperone DnaK-related protein  58.32 
 
 
643 aa  746    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5540  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  86.06 
 
 
619 aa  1055    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218183  normal  0.0196967 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3739  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  72.03 
 
 
610 aa  874    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676013  normal  0.253359 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0987  hypothetical protein  60.08 
 
 
513 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0151  molecular chaperone  52.73 
 
 
622 aa  597  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3922  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  47.8 
 
 
596 aa  539  9.999999999999999e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2054  heat shock protein 70  45.68 
 
 
592 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.462167  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0625  DnaK-related protein  43.91 
 
 
961 aa  461  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0152  Heat shock protein 70  45.27 
 
 
987 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3231  DnaK-related protein  44.32 
 
 
929 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.717764  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3032  DnaK-related protein  44.81 
 
 
925 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192124  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3130  DnaK-related protein  44.48 
 
 
929 aa  425  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0343  DnaK-related protein  42.83 
 
 
971 aa  424  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.87364 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3740  putative chaperone heat-shock protein  44.3 
 
 
952 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.207113 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5541  DnaK-related protein  42 
 
 
949 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0176695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2135  putative chaperone protein, HscA/DnaK  41.01 
 
 
961 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3575  molecular chaperone-like protein  42.97 
 
 
918 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0471148  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0986  hypothetical protein  40.85 
 
 
948 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2123  putative chaperone protein, HscA/DnaK  39.48 
 
 
986 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3945  molecular chaperone-like protein  42.08 
 
 
918 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1753  putative chaperone heat-shock protein  41.17 
 
 
926 aa  411  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277549  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2544  molecular chaperone-like  41.55 
 
 
914 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.374028  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5107  molecular chaperone-like protein  41.51 
 
 
918 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3012  DnaK-related protein  43.62 
 
 
936 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.791103  normal  0.506034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3490  molecular chaperone-like protein  41.83 
 
 
918 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0310238 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5309  molecular chaperone-like protein  41.99 
 
 
918 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1233  chaperone DnaK-related protein  40.61 
 
 
939 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0953918 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003559  DnaK-related protein  39.49 
 
 
936 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1319  DnaK-related protein  41.09 
 
 
931 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981392  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02520  hypothetical protein  39.47 
 
 
941 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0059  DnaK-related protein  40.69 
 
 
942 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3676  putative chaperone protein, HscA/DnaK  40.57 
 
 
966 aa  389  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.771726  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1458  DnaK-related protein  39.97 
 
 
935 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.103212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0047  heat shock protein 70  39.81 
 
 
935 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1546  DnaK-related protein  39.97 
 
 
935 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1306  DnaK-related protein  41.98 
 
 
951 aa  382  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3698  DnaK-related protein  40.67 
 
 
956 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.900724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0495  DnaK-related protein  41.01 
 
 
951 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0799575  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1827  putative chaperone heat-shock protein  37.36 
 
 
938 aa  382  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.276059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5719  DnaK-related protein  40.88 
 
 
951 aa  353  5.9999999999999994e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.376499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2055  molecular chaperone  36.85 
 
 
906 aa  322  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.421939  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0988  heat shock protein 70  50 
 
 
105 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1633  chaperone protein HscA  31.37 
 
 
650 aa  93.2  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.898669  hitchhiker  0.000131814 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1481  chaperone protein HscA  29.7 
 
 
625 aa  92  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0290356 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2689  Heat shock protein 70  25.33 
 
 
562 aa  91.7  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1660  chaperone protein HscA  30 
 
 
625 aa  90.1  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072963 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0622  chaperone protein HscA  28.75 
 
 
625 aa  84.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2047  chaperone protein DnaK  27.99 
 
 
630 aa  83.6  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0631  chaperone protein HscA  29.55 
 
 
625 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0597  chaperone protein HscA  28.5 
 
 
626 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0440  chaperone protein DnaK  28.24 
 
 
618 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00195865  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1565  Fe-S protein assembly chaperone HscA  32.42 
 
 
625 aa  80.1  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0641  chaperone protein HscA  27.99 
 
 
628 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.110178  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2333  Heat shock protein 70  25.97 
 
 
571 aa  79.3  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0102909  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2182  chaperone protein HscA  30.56 
 
 
620 aa  78.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0873671  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1029  2-alkenal reductase  26.18 
 
 
527 aa  78.6  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.777286  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2055  2-alkenal reductase  27.94 
 
 
623 aa  78.2  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.223423  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0892  chaperone protein HscA  25.14 
 
 
582 aa  77.4  0.0000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1378  molecular chaperone DnaK  26.98 
 
 
656 aa  77  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1439  molecular chaperone DnaK  26.98 
 
 
656 aa  77  0.0000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01185  molecular chaperone DnaK  25.39 
 
 
641 aa  77  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0550021  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2007  molecular chaperone DnaK  24.87 
 
 
644 aa  76.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2002  molecular chaperone DnaK  24.87 
 
 
644 aa  76.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1557  chaperone protein HscA  27.98 
 
 
613 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218099  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0826  chaperone protein HscA  29.97 
 
 
621 aa  75.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.353391  normal  0.61281 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2575  chaperone protein HscA  29.43 
 
 
623 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240484 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0677  chaperone protein HscA  29.97 
 
 
621 aa  75.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0834  Fe-S protein assembly chaperone HscA  28.37 
 
 
627 aa  75.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.255655 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2139  chaperone protein HscA  30.06 
 
 
622 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0179  heat shock protein 70  24.92 
 
 
571 aa  75.1  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.633289  normal  0.123381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0692  molecular chaperone DnaK  25.3 
 
 
637 aa  74.3  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00232011  hitchhiker  0.00343274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0876  chaperone protein HscA  30.48 
 
 
620 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70427  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1454  chaperone protein HscA  29.88 
 
 
623 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0846  chaperone protein HscA  30.45 
 
 
620 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.879338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>