More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3231 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3231  Fe-S protein assembly chaperone HscA  100 
 
 
628 aa  1278    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.124104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0480  heat shock protein 70  47.41 
 
 
634 aa  533  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.742328  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0285  chaperone protein HscA  46.03 
 
 
616 aa  509  1e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1136  chaperone protein HscA  44.01 
 
 
620 aa  507  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0804  Fe-S protein assembly chaperone HscA  46.04 
 
 
622 aa  501  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.428496  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0790  molecular chaperone DnaK  44.44 
 
 
636 aa  496  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0357423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0641  chaperone protein HscA  45.26 
 
 
628 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.110178  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3058  Fe-S protein assembly chaperone HscA  43.46 
 
 
625 aa  496  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.156857  unclonable  0.00000109357 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1297  chaperone protein HscA  44.57 
 
 
619 aa  498  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0167807 
 
 
-
 
NC_004310  BR2125  molecular chaperone DnaK  44.72 
 
 
637 aa  492  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.864242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1023  molecular chaperone DnaK  45.24 
 
 
637 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0004  chaperone protein DnaK  45.25 
 
 
638 aa  492  9.999999999999999e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0408404  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004356  chaperone protein HscA  44.86 
 
 
617 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1108  chaperone protein HscA  44.57 
 
 
616 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473858  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3389  molecular chaperone DnaK  44.3 
 
 
641 aa  494  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02418  chaperone protein HscA  45.22 
 
 
616 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89877  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0252  chaperone protein HscA  44.12 
 
 
619 aa  490  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01059  chaperone protein HscA  44.41 
 
 
617 aa  490  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1954  chaperone protein HscA  44.73 
 
 
629 aa  491  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.296275  normal  0.863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2960  chaperone protein DnaK  43.68 
 
 
639 aa  489  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1747 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1328  molecular chaperone DnaK  44.15 
 
 
631 aa  489  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02382  hypothetical protein  45.22 
 
 
616 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3186  chaperone protein DnaK  43.68 
 
 
639 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0889  chaperone protein HscA  43.82 
 
 
621 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0490665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3142  chaperone protein DnaK  44.02 
 
 
639 aa  488  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.105889  normal  0.238129 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0303  molecular chaperone DnaK  44.22 
 
 
637 aa  491  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2041  molecular chaperone DnaK  44.56 
 
 
637 aa  491  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1142  Fe-S protein assembly chaperone HscA  45.06 
 
 
616 aa  487  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3757  chaperone protein HscA  45.06 
 
 
616 aa  487  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0170788  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3623  chaperone protein HscA  44.34 
 
 
616 aa  487  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0846  chaperone protein HscA  43.71 
 
 
620 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2810  chaperone protein HscA  45.06 
 
 
616 aa  487  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.648326  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3023  chaperone protein HscA  44.89 
 
 
616 aa  488  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.168254  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2901  chaperone protein HscA  45.06 
 
 
616 aa  488  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.87079  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2678  chaperone protein HscA  45.06 
 
 
616 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0876  chaperone protein HscA  43.71 
 
 
620 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70427  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2055  2-alkenal reductase  43.78 
 
 
623 aa  488  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.223423  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4416  molecular chaperone DnaK  44.44 
 
 
638 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0597  chaperone protein HscA  45.02 
 
 
626 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0889  chaperone protein HscA  43.94 
 
 
620 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000727661 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0004  molecular chaperone DnaK  46.02 
 
 
631 aa  487  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0827361  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1151  chaperone protein HscA  45.06 
 
 
616 aa  487  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172764  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4793  chaperone protein DnaK  46.81 
 
 
637 aa  486  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126797  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0350  molecular chaperone DnaK  45.69 
 
 
631 aa  487  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.759772 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2677  chaperone protein HscA  45.06 
 
 
616 aa  487  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3995  chaperone protein HscA  43.69 
 
 
622 aa  484  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0300549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1024  chaperone protein HscA  43.5 
 
 
621 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.662352  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0631  chaperone protein HscA  45.02 
 
 
625 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3555  molecular chaperone DnaK  43.7 
 
 
639 aa  484  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0866908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0622  chaperone protein HscA  44.86 
 
 
625 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0281  chaperone protein HscA  44.89 
 
 
616 aa  485  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00307418  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0954  chaperone protein HscA  43.34 
 
 
621 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0282439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3919  chaperone protein DnaK  44.66 
 
 
638 aa  483  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0531667 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1492  chaperone protein HscA  42.88 
 
 
620 aa  483  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0402  molecular chaperone DnaK  43.97 
 
 
643 aa  483  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.362768  normal  0.130805 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0679  molecular chaperone DnaK  43.32 
 
 
636 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470568  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2047  chaperone protein DnaK  43.82 
 
 
630 aa  482  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17633  predicted protein  46.24 
 
 
673 aa  483  1e-135  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2955  chaperone protein DnaK  43.23 
 
 
634 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0510  chaperone protein DnaK  43.95 
 
 
653 aa  483  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0638299  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1454  chaperone protein HscA  44.12 
 
 
623 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4096  molecular chaperone DnaK  44.5 
 
 
639 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2213  chaperone protein HscA  44.19 
 
 
622 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2268  chaperone protein HscA  43.76 
 
 
620 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1427  chaperone protein HscA  43.62 
 
 
620 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1704  chaperone protein HscA  44.19 
 
 
622 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.366095  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1485  chaperone protein HscA  44.19 
 
 
622 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715947  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0834  Fe-S protein assembly chaperone HscA  44.26 
 
 
627 aa  480  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.255655 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1168  chaperone protein HscA  44.01 
 
 
620 aa  480  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3107  chaperone protein HscA  44.19 
 
 
622 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.594657  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4608  chaperone protein HscA  43.62 
 
 
621 aa  480  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317931  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4332  chaperone protein HscA  43.62 
 
 
620 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000366602 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0107  molecular chaperone DnaK  43.21 
 
 
634 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0126383  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5428  chaperone protein HscA  43.5 
 
 
622 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266474  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1879  chaperone protein HscA  43.5 
 
 
622 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737508  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0128  chaperone protein DnaK  43.23 
 
 
632 aa  479  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860677  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1148  chaperone protein HscA  43.5 
 
 
622 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.505415  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2313  chaperone protein HscA  43.2 
 
 
620 aa  480  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.677318  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0010  molecular chaperone DnaK  45.39 
 
 
642 aa  480  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0949466  normal  0.47597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0306  molecular chaperone DnaK  43.62 
 
 
638 aa  481  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3574  chaperone protein DnaK  43.79 
 
 
639 aa  479  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.662017  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3571  molecular chaperone DnaK  44.27 
 
 
639 aa  481  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0972  molecular chaperone DnaK  44.41 
 
 
641 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.760598  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2166  molecular chaperone DnaK  44.5 
 
 
636 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0684659  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0431  chaperone protein HscA  43.08 
 
 
638 aa  481  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2002  molecular chaperone DnaK  44.57 
 
 
644 aa  477  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04260  heat shock protein, putative  43.73 
 
 
667 aa  477  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1241  chaperone protein HscA  42.97 
 
 
620 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2651  chaperone protein HscA  44.19 
 
 
622 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0197  molecular chaperone DnaK  44.3 
 
 
630 aa  475  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432012  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7790  chaperone protein dnaK  44.93 
 
 
629 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2595  chaperone protein HscA  44.19 
 
 
622 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.899432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2575  chaperone protein HscA  45.18 
 
 
623 aa  478  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1280  chaperone protein HscA  42.83 
 
 
638 aa  478  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0191  molecular chaperone DnaK  44.3 
 
 
631 aa  478  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.837679  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0015  molecular chaperone DnaK  42.93 
 
 
638 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2139  chaperone protein HscA  43.34 
 
 
622 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14780  chaperone protein HscA  43.27 
 
 
619 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3460  chaperone protein DnaK  45.55 
 
 
612 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1303  chaperone protein HscA  42.79 
 
 
619 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>