More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3490 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2135  putative chaperone protein, HscA/DnaK  67.5 
 
 		 961 aa  1232    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1306  DnaK-related protein  52.93 
 
 		 951 aa  861    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1546  DnaK-related protein  70.32 
 
 		 935 aa  1250    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3945  molecular chaperone-like protein  92.07 
 
 		 918 aa  1612    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1753  putative chaperone heat-shock protein  67.91 
 
 		 926 aa  1219    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277549  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3130  DnaK-related protein  47.4 
 
 		 929 aa  662    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0047  heat shock protein 70  70.11 
 
 		 935 aa  1247    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2544  molecular chaperone-like  92.71 
 
 		 914 aa  1610    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.374028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1319  DnaK-related protein  70.66 
 
 		 931 aa  1209    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981392  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0495  DnaK-related protein  51.86 
 
 		 951 aa  855    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0799575  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0059  DnaK-related protein  60 
 
 		 942 aa  993    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3032  DnaK-related protein  48.21 
 
 		 925 aa  677    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192124  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1827  putative chaperone heat-shock protein  43.87 
 
 		 938 aa  814    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.276059  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5541  DnaK-related protein  67.76 
 
 		 949 aa  1246    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0176695 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2123  putative chaperone protein, HscA/DnaK  65.96 
 
 		 986 aa  1228    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003559  DnaK-related protein  45.92 
 
 		 936 aa  830    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3698  DnaK-related protein  51.28 
 
 		 956 aa  851    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.900724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3740  putative chaperone heat-shock protein  51.86 
 
 		 952 aa  852    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207113 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1458  DnaK-related protein  70.43 
 
 		 935 aa  1254    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.103212  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3012  DnaK-related protein  47.37 
 
 		 936 aa  659    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.791103  normal  0.506034 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02520  hypothetical protein  45.63 
 
 		 941 aa  832    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5107  molecular chaperone-like protein  89.89 
 
 		 918 aa  1570    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3490  molecular chaperone-like protein  100 
 
 		 918 aa  1804    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0310238 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1233  chaperone DnaK-related protein  48.41 
 
 		 939 aa  888    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0953918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5309  molecular chaperone-like protein  98.14 
 
 		 918 aa  1771    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3676  putative chaperone protein, HscA/DnaK  57.34 
 
 		 966 aa  985    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.771726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0986  hypothetical protein  45.3 
 
 		 948 aa  798    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3575  molecular chaperone-like protein  92.5 
 
 		 918 aa  1623    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0471148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5719  DnaK-related protein  51.69 
 
 		 951 aa  831    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376499 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3231  DnaK-related protein  47.36 
 
 		 929 aa  672    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.717764  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0152  Heat shock protein 70  41.11 
 
 		 987 aa  610  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0625  DnaK-related protein  37.2 
 
 		 961 aa  559  1e-158  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0343  DnaK-related protein  39.24 
 
 		 971 aa  562  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.87364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2055  molecular chaperone  36.89 
 
 		 906 aa  536  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.421939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3013  putative heat-shock chaperone protein  46.66 
 
 		 620 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0151  molecular chaperone  43.4 
 
 		 622 aa  430  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3232  putative heat-shock chaperone protein  46.37 
 
 		 627 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.838749  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3131  putative heat-shock chaperone protein  46.37 
 
 		 627 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3033  putative heat-shock chaperone protein  47.16 
 
 		 631 aa  416  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0058  DnaK-related protein  43.2 
 
 		 615 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3922  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  42.81 
 
 		 596 aa  410  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5720  putative heat-shock chaperone protein  41.03 
 
 		 621 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531884 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3696  putative heat-shock chaperone protein  41.95 
 
 		 636 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.297588  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1305  DnaK-related protein  41.92 
 
 		 658 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1752  putative heat-shock chaperone protein  42.56 
 
 		 614 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0497  putative heat-shock chaperone protein  41.95 
 
 		 636 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271462  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2124  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  42.04 
 
 		 622 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1232  chaperone DnaK-related protein  38.18 
 
 		 643 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2545  molecular chaperone-like  41.99 
 
 		 613 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173516  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1826  putative heat-shock chaperone protein  38.87 
 
 		 606 aa  397  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143123  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02519  molecular chaperone  38.16 
 
 		 654 aa  395  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5108  molecular chaperone-like protein  41.35 
 
 		 613 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.968057  normal  0.0457936 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1457  putative chaperone protein  41.76 
 
 		 615 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003558  DnaK-related protein  37.87 
 
 		 651 aa  392  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00228279  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1545  putative chaperone protein  41.63 
 
 		 615 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166713  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0045  heat shock protein 70  41.63 
 
 		 615 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3677  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  40.35 
 
 		 637 aa  392  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1320  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  41.69 
 
 		 615 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3946  molecular chaperone-like protein  41.19 
 
 		 613 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537274  normal  0.958876 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3489  molecular chaperone-like protein  41.83 
 
 		 613 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00629635 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5308  molecular chaperone-like protein  41.83 
 
 		 613 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3574  molecular chaperone-like protein  41.35 
 
 		 613 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0682429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5540  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  40.61 
 
 		 619 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218183  normal  0.0196967 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3739  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  39.97 
 
 		 610 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676013  normal  0.253359 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2134  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  41.72 
 
 		 619 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.660367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2054  heat shock protein 70  38.13 
 
 		 592 aa  362  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.462167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0987  hypothetical protein  40.75 
 
 		 513 aa  340  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1633  chaperone protein HscA  31.97 
 
 		 650 aa  94  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.898669  hitchhiker  0.000131814 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1024  chaperone protein HscA  30.28 
 
 		 621 aa  93.6  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.662352  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2689  Heat shock protein 70  25.16 
 
 		 562 aa  90.9  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1481  chaperone protein HscA  28.94 
 
 		 625 aa  89.7  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0290356 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0597  chaperone protein HscA  29.74 
 
 		 626 aa  88.2  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0631  chaperone protein HscA  29.47 
 
 		 625 aa  87.4  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0622  chaperone protein HscA  29.71 
 
 		 625 aa  87.4  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199695  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3231  Fe-S protein assembly chaperone HscA  25.87 
 
 		 628 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.124104 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0954  chaperone protein HscA  31.07 
 
 		 621 aa  86.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282439 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1029  2-alkenal reductase  24.21 
 
 		 527 aa  87  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.777286  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0889  chaperone protein HscA  31.07 
 
 		 621 aa  85.9  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0490665 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1660  chaperone protein HscA  27.65 
 
 		 625 aa  85.5  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3058  Fe-S protein assembly chaperone HscA  30.31 
 
 		 625 aa  85.1  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.156857  unclonable  0.00000109357 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1454  chaperone protein HscA  32.42 
 
 		 623 aa  84.7  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1557  chaperone protein HscA  30.33 
 
 		 613 aa  84.3  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218099  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1427  chaperone protein HscA  31.45 
 
 		 620 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1241  chaperone protein HscA  31.45 
 
 		 620 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0633  chaperone protein HscA  28.25 
 
 		 617 aa  83.2  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.672596  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1565  Fe-S protein assembly chaperone HscA  32.01 
 
 		 625 aa  82.4  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1364  Fe-S protein assembly chaperone HscA  29.03 
 
 		 636 aa  82.4  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3507  chaperone protein HscA  31.56 
 
 		 621 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2575  chaperone protein HscA  30.15 
 
 		 623 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240484 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14780  chaperone protein HscA  28.65 
 
 		 619 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4332  chaperone protein HscA  30.65 
 
 		 620 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000366602 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2201  chaperone protein HscA  29.5 
 
 		 622 aa  79.7  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112267  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2139  chaperone protein HscA  29.64 
 
 		 622 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0490  chaperone protein DnaK  27.48 
 
 		 623 aa  79  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000032469  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1440  Fe-S protein assembly chaperone HscA  32.69 
 
 		 624 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.241862  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5955  chaperone protein HscA  29.64 
 
 		 622 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2122  chaperone protein HscA  29.64 
 
 		 622 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1954  chaperone protein HscA  30.58 
 
 		 629 aa  78.2  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.296275  normal  0.863 
 
 
-
 
NC_002978  WD0892  chaperone protein HscA  25.07 
 
 		 582 aa  78.2  0.0000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4608  chaperone protein HscA  31.38 
 
 		 621 aa  78.2  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317931  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>