More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0343 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0152  Heat shock protein 70  41.97 
 
 
987 aa  656    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0343  DnaK-related protein  100 
 
 
971 aa  1932    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.87364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5541  DnaK-related protein  40.36 
 
 
949 aa  631  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0176695 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1306  DnaK-related protein  41.56 
 
 
951 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0625  DnaK-related protein  39.74 
 
 
961 aa  601  1e-170  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2135  putative chaperone protein, HscA/DnaK  39.05 
 
 
961 aa  601  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3945  molecular chaperone-like protein  38.89 
 
 
918 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1753  putative chaperone heat-shock protein  38.93 
 
 
926 aa  591  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277549  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1546  DnaK-related protein  39.45 
 
 
935 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2544  molecular chaperone-like  38.68 
 
 
914 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.374028  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2123  putative chaperone protein, HscA/DnaK  38.3 
 
 
986 aa  588  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3575  molecular chaperone-like protein  39.22 
 
 
918 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0471148  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1233  chaperone DnaK-related protein  36.61 
 
 
939 aa  586  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0953918 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1458  DnaK-related protein  39.35 
 
 
935 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.103212  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5107  molecular chaperone-like protein  39.63 
 
 
918 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3231  DnaK-related protein  42.81 
 
 
929 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.717764  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0047  heat shock protein 70  39.25 
 
 
935 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3676  putative chaperone protein, HscA/DnaK  38.49 
 
 
966 aa  580  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.771726  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003559  DnaK-related protein  36.89 
 
 
936 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1319  DnaK-related protein  39.22 
 
 
931 aa  579  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981392  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3032  DnaK-related protein  42.63 
 
 
925 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192124  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3490  molecular chaperone-like protein  39.13 
 
 
918 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0310238 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5309  molecular chaperone-like protein  39.15 
 
 
918 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3130  DnaK-related protein  42.33 
 
 
929 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0986  hypothetical protein  36.7 
 
 
948 aa  572  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0059  DnaK-related protein  39.78 
 
 
942 aa  567  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02520  hypothetical protein  35.89 
 
 
941 aa  568  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3012  DnaK-related protein  42.89 
 
 
936 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.791103  normal  0.506034 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1827  putative chaperone heat-shock protein  34.32 
 
 
938 aa  549  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.276059  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3740  putative chaperone heat-shock protein  37.6 
 
 
952 aa  530  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.207113 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3698  DnaK-related protein  37.23 
 
 
956 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.900724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0495  DnaK-related protein  37.61 
 
 
951 aa  519  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0799575  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5719  DnaK-related protein  37.36 
 
 
951 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.376499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0151  molecular chaperone  44.31 
 
 
622 aa  442  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3232  putative heat-shock chaperone protein  44.5 
 
 
627 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.838749  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3131  putative heat-shock chaperone protein  44.03 
 
 
627 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3013  putative heat-shock chaperone protein  44.37 
 
 
620 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5720  putative heat-shock chaperone protein  42.3 
 
 
621 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.531884 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1305  DnaK-related protein  41.69 
 
 
658 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3677  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  42.16 
 
 
637 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786071  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0497  putative heat-shock chaperone protein  43.53 
 
 
636 aa  423  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271462  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3696  putative heat-shock chaperone protein  43.69 
 
 
636 aa  425  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.297588  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5540  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  41.92 
 
 
619 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218183  normal  0.0196967 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2124  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  42.97 
 
 
622 aa  422  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0058  DnaK-related protein  44.46 
 
 
615 aa  420  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3922  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  41.44 
 
 
596 aa  418  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3739  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  42.34 
 
 
610 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676013  normal  0.253359 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5108  molecular chaperone-like protein  43.33 
 
 
613 aa  416  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.968057  normal  0.0457936 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3033  putative heat-shock chaperone protein  43.26 
 
 
631 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0045  heat shock protein 70  43.4 
 
 
615 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1457  putative chaperone protein  43.4 
 
 
615 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1320  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  43.4 
 
 
615 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1826  putative heat-shock chaperone protein  39.3 
 
 
606 aa  410  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143123  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1545  putative chaperone protein  43.24 
 
 
615 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166713  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1752  putative heat-shock chaperone protein  43.22 
 
 
614 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3946  molecular chaperone-like protein  42.83 
 
 
613 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537274  normal  0.958876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2134  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  42.97 
 
 
619 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.660367  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3574  molecular chaperone-like protein  42.47 
 
 
613 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0682429  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2055  molecular chaperone  33.27 
 
 
906 aa  405  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.421939  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3489  molecular chaperone-like protein  42.11 
 
 
613 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00629635 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2545  molecular chaperone-like  42.25 
 
 
613 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173516  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5308  molecular chaperone-like protein  42.52 
 
 
613 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02519  molecular chaperone  36.87 
 
 
654 aa  389  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003558  DnaK-related protein  36.76 
 
 
651 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00228279  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1232  chaperone DnaK-related protein  37.86 
 
 
643 aa  389  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2054  heat shock protein 70  35.49 
 
 
592 aa  337  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.462167  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0987  hypothetical protein  34.88 
 
 
513 aa  290  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2689  Heat shock protein 70  27.3 
 
 
562 aa  90.1  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1242  Fe-S protein assembly chaperone HscA  28.25 
 
 
622 aa  88.6  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1089  molecular chaperone DnaK  29.81 
 
 
626 aa  88.6  6e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000419438  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1452  molecular chaperone DnaK  28.62 
 
 
498 aa  85.9  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0834  Fe-S protein assembly chaperone HscA  29.51 
 
 
627 aa  85.1  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.255655 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0490  chaperone protein DnaK  27.36 
 
 
623 aa  84.7  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000032469  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1119  molecular chaperone DnaK  28.43 
 
 
634 aa  84.3  0.000000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.828103  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0935  molecular chaperone DnaK  28.77 
 
 
622 aa  84.3  0.000000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.550928  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1024  chaperone protein HscA  30.17 
 
 
621 aa  84.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.662352  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1063  chaperone protein HscA  27.3 
 
 
621 aa  83.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1454  chaperone protein HscA  31.17 
 
 
623 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18951  molecular chaperone DnaK  25.15 
 
 
634 aa  82.4  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0241  dnaK family protein  29.37 
 
 
575 aa  82.4  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215943  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0238  dnaK family protein  29.37 
 
 
575 aa  82.4  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.878692  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0148  molecular chaperone DnaK  29.97 
 
 
625 aa  82.4  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0238648  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2393  chaperone protein HscA  28.21 
 
 
620 aa  81.6  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000110447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2382  chaperone protein HscA  28.21 
 
 
620 aa  82  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000622111  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1557  chaperone protein HscA  29.85 
 
 
613 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218099  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1965  chaperone protein HscA  29.15 
 
 
620 aa  81.6  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0206747  hitchhiker  0.000657718 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2139  chaperone protein HscA  30.08 
 
 
622 aa  82  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2498  chaperone protein HscA  29.15 
 
 
620 aa  81.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184268  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2420  chaperone protein HscA  28.93 
 
 
619 aa  81.3  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.643944  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0850  molecular chaperone DnaK  28.9 
 
 
623 aa  80.9  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.561749  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0775  molecular chaperone DnaK  28.9 
 
 
623 aa  80.9  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.175007  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2575  chaperone protein HscA  28.57 
 
 
623 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3591  molecular chaperone DnaK  27.41 
 
 
632 aa  80.5  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143132  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2674  molecular chaperone DnaK  25 
 
 
637 aa  80.5  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1029  chaperone protein HscA  27.15 
 
 
621 aa  80.5  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.175393  normal  0.210751 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1258  molecular chaperone DnaK  28.9 
 
 
623 aa  80.9  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.757771  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2032  chaperone protein HscA  29.81 
 
 
622 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1166  chaperone protein DnaK  28.16 
 
 
605 aa  80.9  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1347  molecular chaperone DnaK  25.21 
 
 
615 aa  80.9  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.730753  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0954  chaperone protein HscA  28.29 
 
 
621 aa  80.9  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0282439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>