More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3676 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1306  DnaK-related protein  51.42 
 
 
951 aa  828    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2135  putative chaperone protein, HscA/DnaK  57.23 
 
 
961 aa  1040    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5541  DnaK-related protein  56.02 
 
 
949 aa  994    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0176695 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3698  DnaK-related protein  50.95 
 
 
956 aa  853    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.900724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0495  DnaK-related protein  51.52 
 
 
951 aa  857    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0799575  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1233  chaperone DnaK-related protein  45.94 
 
 
939 aa  827    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0953918 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5107  molecular chaperone-like protein  55.96 
 
 
918 aa  944    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3676  putative chaperone protein, HscA/DnaK  100 
 
 
966 aa  1905    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.771726  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3740  putative chaperone heat-shock protein  51.71 
 
 
952 aa  840    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.207113 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1753  putative chaperone heat-shock protein  57.95 
 
 
926 aa  1038    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277549  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0986  hypothetical protein  45.24 
 
 
948 aa  776    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3231  DnaK-related protein  44.42 
 
 
929 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.717764  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0047  heat shock protein 70  55.15 
 
 
935 aa  937    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003559  DnaK-related protein  43.23 
 
 
936 aa  775    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2544  molecular chaperone-like  57.42 
 
 
914 aa  966    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.374028  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5719  DnaK-related protein  49.9 
 
 
951 aa  808    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.376499 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1319  DnaK-related protein  54.86 
 
 
931 aa  926    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981392  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3490  molecular chaperone-like protein  57.23 
 
 
918 aa  952    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0310238 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3032  DnaK-related protein  45.03 
 
 
925 aa  647    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192124  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0059  DnaK-related protein  55.3 
 
 
942 aa  901    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2123  putative chaperone protein, HscA/DnaK  56.62 
 
 
986 aa  1036    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1827  putative chaperone heat-shock protein  41.61 
 
 
938 aa  751    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.276059  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1546  DnaK-related protein  55.15 
 
 
935 aa  936    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1458  DnaK-related protein  55.25 
 
 
935 aa  939    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.103212  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5309  molecular chaperone-like protein  57.23 
 
 
918 aa  948    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3575  molecular chaperone-like protein  57.74 
 
 
918 aa  974    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0471148  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3945  molecular chaperone-like protein  57.56 
 
 
918 aa  973    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02520  hypothetical protein  43.64 
 
 
941 aa  791    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3130  DnaK-related protein  44.52 
 
 
929 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3012  DnaK-related protein  44.24 
 
 
936 aa  605  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.791103  normal  0.506034 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0152  Heat shock protein 70  38.88 
 
 
987 aa  572  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0343  DnaK-related protein  38.49 
 
 
971 aa  546  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.87364 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0625  DnaK-related protein  36.35 
 
 
961 aa  541  9.999999999999999e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2055  molecular chaperone  37.38 
 
 
906 aa  523  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.421939  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0151  molecular chaperone  43.75 
 
 
622 aa  430  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1305  DnaK-related protein  42.88 
 
 
658 aa  429  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3922  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  41.35 
 
 
596 aa  397  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3013  putative heat-shock chaperone protein  42.54 
 
 
620 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3232  putative heat-shock chaperone protein  43.15 
 
 
627 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.838749  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3131  putative heat-shock chaperone protein  42.99 
 
 
627 aa  389  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1457  putative chaperone protein  42.25 
 
 
615 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3696  putative heat-shock chaperone protein  41.44 
 
 
636 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.297588  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0497  putative heat-shock chaperone protein  41.44 
 
 
636 aa  385  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271462  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5540  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  40.31 
 
 
619 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218183  normal  0.0196967 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1752  putative heat-shock chaperone protein  41.94 
 
 
614 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0045  heat shock protein 70  42.1 
 
 
615 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1545  putative chaperone protein  42.1 
 
 
615 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166713  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2124  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  40.44 
 
 
622 aa  386  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3033  putative heat-shock chaperone protein  42.47 
 
 
631 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5720  putative heat-shock chaperone protein  38.85 
 
 
621 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.531884 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1826  putative heat-shock chaperone protein  36.94 
 
 
606 aa  381  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143123  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3677  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  39.38 
 
 
637 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786071  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5108  molecular chaperone-like protein  40.41 
 
 
613 aa  379  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.968057  normal  0.0457936 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1320  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  40.95 
 
 
615 aa  379  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0058  DnaK-related protein  40.35 
 
 
615 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1232  chaperone DnaK-related protein  36.43 
 
 
643 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2545  molecular chaperone-like  39.87 
 
 
613 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173516  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3489  molecular chaperone-like protein  40.51 
 
 
613 aa  373  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00629635 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3946  molecular chaperone-like protein  39.75 
 
 
613 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537274  normal  0.958876 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5308  molecular chaperone-like protein  40.51 
 
 
613 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3574  molecular chaperone-like protein  39.9 
 
 
613 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0682429  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02519  molecular chaperone  36.27 
 
 
654 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3739  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  38.51 
 
 
610 aa  364  4e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676013  normal  0.253359 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003558  DnaK-related protein  36.12 
 
 
651 aa  363  7.0000000000000005e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00228279  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2134  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  40.19 
 
 
619 aa  363  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.660367  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2054  heat shock protein 70  39.22 
 
 
592 aa  355  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.462167  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0987  hypothetical protein  36.99 
 
 
513 aa  310  9e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2689  Heat shock protein 70  26.03 
 
 
562 aa  95.5  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1633  chaperone protein HscA  30.94 
 
 
650 aa  91.7  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.898669  hitchhiker  0.000131814 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0826  chaperone protein HscA  30.47 
 
 
621 aa  89.4  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.353391  normal  0.61281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0677  chaperone protein HscA  30.47 
 
 
621 aa  89.4  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0633  chaperone protein HscA  27.82 
 
 
617 aa  88.2  6e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.672596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1029  2-alkenal reductase  27.3 
 
 
527 aa  87.8  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.777286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4608  chaperone protein HscA  33.54 
 
 
621 aa  85.1  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317931  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1427  chaperone protein HscA  32.71 
 
 
620 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1241  chaperone protein HscA  33.02 
 
 
620 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1024  chaperone protein HscA  31.16 
 
 
621 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.662352  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14780  chaperone protein HscA  31.18 
 
 
619 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3058  Fe-S protein assembly chaperone HscA  30.24 
 
 
625 aa  82.8  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.156857  unclonable  0.00000109357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1954  chaperone protein HscA  29.03 
 
 
629 aa  82.4  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.296275  normal  0.863 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2182  chaperone protein HscA  32.2 
 
 
620 aa  81.6  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0873671  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0480  heat shock protein 70  30.3 
 
 
634 aa  81.3  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.742328  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2055  2-alkenal reductase  29.72 
 
 
623 aa  81.3  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.223423  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1600  molecular chaperone DnaK  26.71 
 
 
641 aa  81.3  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.56491  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1303  chaperone protein HscA  32.92 
 
 
619 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323166  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1642  chaperone protein HscA  33.02 
 
 
622 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.393087  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2140  chaperone protein HscA  32.71 
 
 
622 aa  80.5  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0156468 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3507  chaperone protein HscA  31.58 
 
 
621 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0424  Heat shock protein 70  29.79 
 
 
524 aa  79.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.205897 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2139  chaperone protein HscA  31.55 
 
 
622 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1148  chaperone protein HscA  36.6 
 
 
622 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.505415  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5428  chaperone protein HscA  30.87 
 
 
622 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266474  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0431  chaperone protein HscA  32.51 
 
 
638 aa  78.6  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2201  chaperone protein HscA  30.66 
 
 
622 aa  78.6  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112267  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3623  chaperone protein HscA  30.94 
 
 
616 aa  78.2  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2575  chaperone protein HscA  37.44 
 
 
623 aa  78.2  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240484 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0834  Fe-S protein assembly chaperone HscA  28.7 
 
 
627 aa  78.2  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.255655 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1280  chaperone protein HscA  32.51 
 
 
638 aa  78.2  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0870  heat shock protein Hsp70  27.54 
 
 
638 aa  77.8  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100089  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1172  chaperone protein HscA  32.18 
 
 
644 aa  77.4  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>