More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003558 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3739  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  57.69 
 
 
610 aa  736    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676013  normal  0.253359 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0058  DnaK-related protein  60.13 
 
 
615 aa  739    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1305  DnaK-related protein  59.42 
 
 
658 aa  758    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003558  DnaK-related protein  100 
 
 
651 aa  1340    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00228279  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0497  putative heat-shock chaperone protein  57.99 
 
 
636 aa  729    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271462  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5108  molecular chaperone-like protein  58.79 
 
 
613 aa  732    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.968057  normal  0.0457936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1752  putative heat-shock chaperone protein  58.15 
 
 
614 aa  717    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0045  heat shock protein 70  58.37 
 
 
615 aa  714    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2545  molecular chaperone-like  59.71 
 
 
613 aa  724    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173516  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3489  molecular chaperone-like protein  59.87 
 
 
613 aa  721    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00629635 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2134  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  57.89 
 
 
619 aa  684    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.660367  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0987  hypothetical protein  77.69 
 
 
513 aa  815    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1320  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  59.08 
 
 
615 aa  729    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3677  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  57.83 
 
 
637 aa  740    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786071  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02519  molecular chaperone  96.94 
 
 
654 aa  1280    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2124  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  57.55 
 
 
622 aa  731    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5720  putative heat-shock chaperone protein  57.39 
 
 
621 aa  737    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.531884 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1545  putative chaperone protein  58.37 
 
 
615 aa  712    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166713  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3696  putative heat-shock chaperone protein  57.99 
 
 
636 aa  727    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.297588  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1826  putative heat-shock chaperone protein  73.55 
 
 
606 aa  953    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143123  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3946  molecular chaperone-like protein  60.03 
 
 
613 aa  725    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537274  normal  0.958876 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5540  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  57.94 
 
 
619 aa  723    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218183  normal  0.0196967 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1457  putative chaperone protein  58.47 
 
 
615 aa  713    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5308  molecular chaperone-like protein  59.87 
 
 
613 aa  721    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3574  molecular chaperone-like protein  60.19 
 
 
613 aa  728    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0682429  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1232  chaperone DnaK-related protein  63.52 
 
 
643 aa  806    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3013  putative heat-shock chaperone protein  52.4 
 
 
620 aa  633  1e-180  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3131  putative heat-shock chaperone protein  48.19 
 
 
627 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3232  putative heat-shock chaperone protein  47.88 
 
 
627 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.838749  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3033  putative heat-shock chaperone protein  48.1 
 
 
631 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0151  molecular chaperone  45.62 
 
 
622 aa  548  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3922  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  45.3 
 
 
596 aa  529  1e-149  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2054  heat shock protein 70  43.06 
 
 
592 aa  501  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.462167  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0152  Heat shock protein 70  41.87 
 
 
987 aa  449  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0625  DnaK-related protein  40.82 
 
 
961 aa  435  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3575  molecular chaperone-like protein  39.06 
 
 
918 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0471148  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3945  molecular chaperone-like protein  38.52 
 
 
918 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2544  molecular chaperone-like  38.04 
 
 
914 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.374028  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1753  putative chaperone heat-shock protein  39.55 
 
 
926 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3032  DnaK-related protein  40.95 
 
 
925 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192124  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5541  DnaK-related protein  38.88 
 
 
949 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0176695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2135  putative chaperone protein, HscA/DnaK  37.56 
 
 
961 aa  395  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2123  putative chaperone protein, HscA/DnaK  37.44 
 
 
986 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0343  DnaK-related protein  37 
 
 
971 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.87364 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5107  molecular chaperone-like protein  38.01 
 
 
918 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3740  putative chaperone heat-shock protein  38.95 
 
 
952 aa  391  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.207113 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0986  hypothetical protein  38.01 
 
 
948 aa  392  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02520  hypothetical protein  37.1 
 
 
941 aa  389  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3130  DnaK-related protein  40.16 
 
 
929 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1319  DnaK-related protein  38.8 
 
 
931 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981392  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3231  DnaK-related protein  39.84 
 
 
929 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.717764  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0059  DnaK-related protein  37.94 
 
 
942 aa  388  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1827  putative chaperone heat-shock protein  36.76 
 
 
938 aa  388  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.276059  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3490  molecular chaperone-like protein  38.65 
 
 
918 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0310238 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1306  DnaK-related protein  39.14 
 
 
951 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003559  DnaK-related protein  37.61 
 
 
936 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1458  DnaK-related protein  38.56 
 
 
935 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.103212  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1546  DnaK-related protein  38.56 
 
 
935 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0047  heat shock protein 70  38.56 
 
 
935 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5309  molecular chaperone-like protein  38.54 
 
 
918 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1233  chaperone DnaK-related protein  36.86 
 
 
939 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0953918 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3676  putative chaperone protein, HscA/DnaK  36.43 
 
 
966 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.771726  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0495  DnaK-related protein  36.8 
 
 
951 aa  365  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0799575  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3698  DnaK-related protein  36.46 
 
 
956 aa  365  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.900724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3012  DnaK-related protein  39.27 
 
 
936 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.791103  normal  0.506034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5719  DnaK-related protein  36.81 
 
 
951 aa  363  7.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.376499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2055  molecular chaperone  35.09 
 
 
906 aa  315  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.421939  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0988  heat shock protein 70  75 
 
 
105 aa  160  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1481  chaperone protein HscA  27.73 
 
 
625 aa  83.6  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0290356 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1633  chaperone protein HscA  29.04 
 
 
650 aa  83.2  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.898669  hitchhiker  0.000131814 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1660  chaperone protein HscA  27.73 
 
 
625 aa  80.5  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072963 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2689  Heat shock protein 70  27.51 
 
 
562 aa  79.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1029  2-alkenal reductase  28.52 
 
 
527 aa  79  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.777286  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3058  Fe-S protein assembly chaperone HscA  27.55 
 
 
625 aa  77.8  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.156857  unclonable  0.00000109357 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1557  chaperone protein HscA  27.33 
 
 
613 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218099  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45857  heat shock protein 70  28.1 
 
 
593 aa  76.6  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1207  chaperone protein DnaK  27.12 
 
 
620 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.558053  normal  0.0128499 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0286  2-alkenal reductase  29.58 
 
 
600 aa  75.1  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0529  class I heat-shock protein (chaperonin)  27.45 
 
 
623 aa  73.9  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2333  Heat shock protein 70  26.84 
 
 
571 aa  73.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0102909  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5955  chaperone protein HscA  29.1 
 
 
622 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0943  hypothetical protein  29.81 
 
 
621 aa  73.6  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0513981  normal  0.126736 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0490  chaperone protein DnaK  27.39 
 
 
623 aa  73.6  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000032469  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2122  chaperone protein HscA  29.1 
 
 
622 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2420  Heat shock protein 70  31.42 
 
 
649 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5428  chaperone protein HscA  29.1 
 
 
622 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266474  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2139  chaperone protein HscA  28.76 
 
 
622 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1328  Fe-S protein assembly chaperone HscA  27.49 
 
 
623 aa  72.4  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2575  chaperone protein HscA  27.59 
 
 
623 aa  72  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2032  chaperone protein HscA  28.75 
 
 
622 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2159  chaperone protein HscA  28.75 
 
 
622 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.265898  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1454  chaperone protein HscA  28.52 
 
 
623 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3621  molecular chaperone DnaK  28.33 
 
 
623 aa  70.9  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1954  chaperone protein HscA  26.5 
 
 
629 aa  70.9  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.296275  normal  0.863 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1148  chaperone protein HscA  28.57 
 
 
622 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.505415  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0846  chaperone protein HscA  28.71 
 
 
620 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2047  chaperone protein DnaK  26.88 
 
 
630 aa  70.1  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2182  chaperone protein HscA  27.85 
 
 
620 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0873671  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0889  chaperone protein HscA  28.71 
 
 
620 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000727661 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18810  chaperone protein DnaK  27.21 
 
 
619 aa  69.7  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000228841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>