More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1305 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3946  molecular chaperone-like protein  63.93 
 
 
613 aa  758    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537274  normal  0.958876 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02519  molecular chaperone  59.14 
 
 
654 aa  746    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1305  DnaK-related protein  100 
 
 
658 aa  1318    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1457  putative chaperone protein  64.05 
 
 
615 aa  752    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5720  putative heat-shock chaperone protein  62.03 
 
 
621 aa  766    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.531884 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5540  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  63.52 
 
 
619 aa  775    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218183  normal  0.0196967 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0058  DnaK-related protein  65.62 
 
 
615 aa  773    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3677  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  62.89 
 
 
637 aa  768    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786071  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1752  putative heat-shock chaperone protein  65.64 
 
 
614 aa  780    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3489  molecular chaperone-like protein  63.61 
 
 
613 aa  756    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00629635 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0045  heat shock protein 70  64.22 
 
 
615 aa  755    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1545  putative chaperone protein  64.22 
 
 
615 aa  754    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2545  molecular chaperone-like  63.93 
 
 
613 aa  762    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173516  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3696  putative heat-shock chaperone protein  63.24 
 
 
636 aa  755    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.297588  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1320  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  64.71 
 
 
615 aa  767    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5108  molecular chaperone-like protein  64.59 
 
 
613 aa  776    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.968057  normal  0.0457936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2124  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  64.97 
 
 
622 aa  774    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1826  putative heat-shock chaperone protein  61.74 
 
 
606 aa  790    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143123  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0497  putative heat-shock chaperone protein  62.75 
 
 
636 aa  752    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271462  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5308  molecular chaperone-like protein  63.77 
 
 
613 aa  756    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003558  DnaK-related protein  59.42 
 
 
651 aa  747    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00228279  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3574  molecular chaperone-like protein  64.26 
 
 
613 aa  762    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0682429  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2134  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  64.86 
 
 
619 aa  733    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.660367  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3739  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  62.52 
 
 
610 aa  768    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676013  normal  0.253359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3013  putative heat-shock chaperone protein  57.33 
 
 
620 aa  656    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1232  chaperone DnaK-related protein  59.62 
 
 
643 aa  759    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3131  putative heat-shock chaperone protein  55.68 
 
 
627 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3232  putative heat-shock chaperone protein  55.36 
 
 
627 aa  631  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.838749  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3033  putative heat-shock chaperone protein  55.45 
 
 
631 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0987  hypothetical protein  59.45 
 
 
513 aa  618  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0151  molecular chaperone  50.94 
 
 
622 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3922  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  46.96 
 
 
596 aa  528  1e-148  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2054  heat shock protein 70  45.26 
 
 
592 aa  508  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.462167  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5541  DnaK-related protein  43.2 
 
 
949 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0176695 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3676  putative chaperone protein, HscA/DnaK  42.88 
 
 
966 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.771726  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0986  hypothetical protein  40.93 
 
 
948 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0343  DnaK-related protein  41.69 
 
 
971 aa  427  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.87364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2135  putative chaperone protein, HscA/DnaK  40.12 
 
 
961 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0152  Heat shock protein 70  43.15 
 
 
987 aa  424  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3575  molecular chaperone-like protein  42.07 
 
 
918 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0471148  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3945  molecular chaperone-like protein  41.6 
 
 
918 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1753  putative chaperone heat-shock protein  41.18 
 
 
926 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3231  DnaK-related protein  44.19 
 
 
929 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.717764  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5107  molecular chaperone-like protein  42.33 
 
 
918 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02520  hypothetical protein  39.97 
 
 
941 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3740  putative chaperone heat-shock protein  43.21 
 
 
952 aa  415  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.207113 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3032  DnaK-related protein  44.63 
 
 
925 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192124  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2123  putative chaperone protein, HscA/DnaK  39.01 
 
 
986 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3130  DnaK-related protein  44.35 
 
 
929 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0047  heat shock protein 70  41.71 
 
 
935 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1546  DnaK-related protein  41.71 
 
 
935 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2544  molecular chaperone-like  41.13 
 
 
914 aa  412  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.374028  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0059  DnaK-related protein  42.64 
 
 
942 aa  412  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1827  putative chaperone heat-shock protein  39.4 
 
 
938 aa  411  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.276059  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1458  DnaK-related protein  42.19 
 
 
935 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.103212  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003559  DnaK-related protein  40.06 
 
 
936 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1319  DnaK-related protein  41.82 
 
 
931 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981392  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0625  DnaK-related protein  39.49 
 
 
961 aa  409  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3490  molecular chaperone-like protein  41.92 
 
 
918 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0310238 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1306  DnaK-related protein  43.72 
 
 
951 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3012  DnaK-related protein  44.34 
 
 
936 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.791103  normal  0.506034 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5309  molecular chaperone-like protein  41.12 
 
 
918 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1233  chaperone DnaK-related protein  39.27 
 
 
939 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0953918 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0495  DnaK-related protein  41.56 
 
 
951 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0799575  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3698  DnaK-related protein  40.99 
 
 
956 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.900724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5719  DnaK-related protein  40.73 
 
 
951 aa  365  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.376499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2055  molecular chaperone  37.05 
 
 
906 aa  320  7e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.421939  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0988  heat shock protein 70  55 
 
 
105 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1633  chaperone protein HscA  31.05 
 
 
650 aa  89.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.898669  hitchhiker  0.000131814 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1029  2-alkenal reductase  28.94 
 
 
527 aa  83.2  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.777286  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1557  chaperone protein HscA  27.98 
 
 
613 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218099  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2689  Heat shock protein 70  25.39 
 
 
562 aa  81.6  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2333  Heat shock protein 70  24.65 
 
 
571 aa  80.5  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0102909  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2747  chaperone protein HscA  32.49 
 
 
616 aa  79.3  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18810  chaperone protein DnaK  28.9 
 
 
619 aa  79.7  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000228841  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0490  chaperone protein DnaK  27.66 
 
 
623 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000032469  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2313  chaperone protein HscA  30.03 
 
 
620 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.677318  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0431  chaperone protein HscA  29.02 
 
 
638 aa  78.2  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0247  chaperone protein DnaK  30.38 
 
 
621 aa  78.2  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1242  Fe-S protein assembly chaperone HscA  28.93 
 
 
622 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1660  chaperone protein HscA  28.98 
 
 
625 aa  77.4  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072963 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1481  chaperone protein HscA  28.22 
 
 
625 aa  76.6  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0290356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4352  molecular chaperone DnaK  29.84 
 
 
616 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1280  chaperone protein HscA  33.56 
 
 
638 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3621  molecular chaperone DnaK  29.1 
 
 
623 aa  76.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0196  molecular chaperone DnaK  29.74 
 
 
613 aa  75.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2047  chaperone protein DnaK  27.51 
 
 
630 aa  75.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0369  molecular chaperone DnaK  28.01 
 
 
591 aa  76.3  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3808  molecular chaperone DnaK  28.48 
 
 
622 aa  76.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0238  chaperone protein DnaK  30.65 
 
 
617 aa  75.5  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2139  chaperone protein HscA  30.5 
 
 
622 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2575  chaperone protein HscA  29.18 
 
 
623 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240484 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5955  chaperone protein HscA  31.03 
 
 
622 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2122  chaperone protein HscA  31.03 
 
 
622 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0081  molecular chaperone DnaK  29.32 
 
 
624 aa  75.5  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2032  chaperone protein HscA  29.71 
 
 
622 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1148  chaperone protein HscA  30.5 
 
 
622 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.505415  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0233  molecular chaperone DnaK  30.23 
 
 
612 aa  74.7  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0417702  normal  0.306693 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0784  chaperone DnaK  29.71 
 
 
636 aa  74.7  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0529  class I heat-shock protein (chaperonin)  28.99 
 
 
623 aa  74.7  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>