More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1633 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1481  chaperone protein HscA  64.77 
 
 
625 aa  838    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0290356 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1633  chaperone protein HscA  100 
 
 
650 aa  1324    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.898669  hitchhiker  0.000131814 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1660  chaperone protein HscA  65.08 
 
 
625 aa  843    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072963 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1136  chaperone protein HscA  50.15 
 
 
620 aa  591  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1303  chaperone protein HscA  50.7 
 
 
619 aa  588  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14780  chaperone protein HscA  50.7 
 
 
619 aa  588  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0281  chaperone protein HscA  49.54 
 
 
616 aa  578  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00307418  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0721  chaperone protein HscA  49.62 
 
 
617 aa  575  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1108  chaperone protein HscA  48.56 
 
 
616 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473858  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01059  chaperone protein HscA  48.92 
 
 
617 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0804  Fe-S protein assembly chaperone HscA  49.18 
 
 
622 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.428496  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2182  chaperone protein HscA  49 
 
 
620 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0873671  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004356  chaperone protein HscA  48.77 
 
 
617 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2140  chaperone protein HscA  48.39 
 
 
622 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0156468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1642  chaperone protein HscA  48.54 
 
 
622 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.393087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2286  chaperone protein HscA  48.69 
 
 
620 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588837  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3507  chaperone protein HscA  48.85 
 
 
621 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3623  chaperone protein HscA  49.31 
 
 
616 aa  575  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2055  2-alkenal reductase  49.16 
 
 
623 aa  572  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.223423  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1168  chaperone protein HscA  48.55 
 
 
620 aa  569  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0876  chaperone protein HscA  49.31 
 
 
620 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70427  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1297  chaperone protein HscA  48.47 
 
 
619 aa  571  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0167807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0846  chaperone protein HscA  49.31 
 
 
620 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1427  chaperone protein HscA  49.31 
 
 
620 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1954  chaperone protein HscA  49.92 
 
 
629 aa  566  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.296275  normal  0.863 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4608  chaperone protein HscA  48.93 
 
 
621 aa  565  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317931  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1462  chaperone protein HscA  48.09 
 
 
619 aa  567  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0476336  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40360  chaperone protein HscA  48.84 
 
 
621 aa  568  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2377  chaperone protein HscA  49.7 
 
 
622 aa  566  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.750622  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2747  chaperone protein HscA  48.23 
 
 
616 aa  566  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2268  chaperone protein HscA  48.39 
 
 
620 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1241  chaperone protein HscA  49 
 
 
620 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2258  chaperone protein HscA  49.54 
 
 
618 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1492  chaperone protein HscA  47.47 
 
 
620 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0889  chaperone protein HscA  49 
 
 
620 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000727661 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0834  Fe-S protein assembly chaperone HscA  48.4 
 
 
627 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.255655 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2145  chaperone protein HscA  48.48 
 
 
620 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000851094  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2313  chaperone protein HscA  47.63 
 
 
620 aa  560  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.677318  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1823  chaperone protein HscA  47.71 
 
 
620 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.582459  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4332  chaperone protein HscA  49.15 
 
 
620 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000366602 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2201  chaperone protein HscA  48.54 
 
 
622 aa  558  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112267  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3995  chaperone protein HscA  48.39 
 
 
622 aa  558  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0300549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1063  chaperone protein HscA  49.61 
 
 
621 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1280  chaperone protein HscA  47.7 
 
 
638 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2181  chaperone protein HscA  48.92 
 
 
618 aa  557  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.174221  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1489  chaperone protein HscA  48.4 
 
 
621 aa  558  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1743  chaperone protein HscA  47.71 
 
 
620 aa  558  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000392017  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2276  chaperone protein HscA  47.49 
 
 
620 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000669317  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1172  chaperone protein HscA  47.14 
 
 
644 aa  552  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1024  chaperone protein HscA  48.31 
 
 
621 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.662352  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2447  chaperone protein HscA  47.77 
 
 
620 aa  553  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0473  chaperone protein HscA  48.31 
 
 
621 aa  555  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307279  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2498  chaperone protein HscA  47.47 
 
 
620 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184268  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1780  chaperone protein HscA  49.54 
 
 
620 aa  555  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166205 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0954  chaperone protein HscA  48.16 
 
 
621 aa  555  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0282439 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1965  chaperone protein HscA  47.47 
 
 
620 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0206747  hitchhiker  0.000657718 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0285  chaperone protein HscA  46.33 
 
 
616 aa  552  1e-156  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0431  chaperone protein HscA  47.56 
 
 
638 aa  553  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2420  chaperone protein HscA  48.39 
 
 
619 aa  553  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.643944  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2382  chaperone protein HscA  47.32 
 
 
620 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000622111  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2393  chaperone protein HscA  47.32 
 
 
620 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000110447  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0889  chaperone protein HscA  47.7 
 
 
621 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0490665 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3027  chaperone protein HscA  47.55 
 
 
616 aa  546  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1029  chaperone protein HscA  48.55 
 
 
621 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.175393  normal  0.210751 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1248  chaperone protein HscA  47.85 
 
 
616 aa  548  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.873456  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1565  Fe-S protein assembly chaperone HscA  47.96 
 
 
625 aa  544  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1440  Fe-S protein assembly chaperone HscA  47.42 
 
 
624 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.241862  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2801  chaperone protein HscA  46.55 
 
 
616 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2779  chaperone protein HscA  46.55 
 
 
616 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.346282  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2694  chaperone protein HscA  46.55 
 
 
616 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2738  chaperone protein HscA  46.55 
 
 
616 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0252  chaperone protein HscA  47.54 
 
 
619 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2678  chaperone protein HscA  47.93 
 
 
616 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2913  chaperone protein HscA  46.55 
 
 
616 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1148  chaperone protein HscA  47.07 
 
 
622 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.505415  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5428  chaperone protein HscA  47.78 
 
 
622 aa  535  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266474  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1879  chaperone protein HscA  48.07 
 
 
622 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737508  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2901  chaperone protein HscA  47.77 
 
 
616 aa  536  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.87079  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2032  chaperone protein HscA  47.38 
 
 
622 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1043  chaperone protein HscA  48.39 
 
 
621 aa  538  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2810  chaperone protein HscA  47.77 
 
 
616 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.648326  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2159  chaperone protein HscA  47.53 
 
 
622 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.265898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02418  chaperone protein HscA  47.77 
 
 
616 aa  535  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89877  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1142  Fe-S protein assembly chaperone HscA  47.77 
 
 
616 aa  535  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3023  chaperone protein HscA  47.24 
 
 
616 aa  533  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.168254  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1704  chaperone protein HscA  48.07 
 
 
622 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.366095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1151  chaperone protein HscA  47.77 
 
 
616 aa  535  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172764  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1485  chaperone protein HscA  48.07 
 
 
622 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715947  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3757  chaperone protein HscA  47.77 
 
 
616 aa  535  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0170788  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2575  chaperone protein HscA  47.27 
 
 
623 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240484 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3107  chaperone protein HscA  48.07 
 
 
622 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.594657  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2213  chaperone protein HscA  48.07 
 
 
622 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1328  Fe-S protein assembly chaperone HscA  46.93 
 
 
623 aa  535  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2677  chaperone protein HscA  47.77 
 
 
616 aa  535  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02382  hypothetical protein  47.77 
 
 
616 aa  535  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1454  chaperone protein HscA  47.55 
 
 
623 aa  532  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2139  chaperone protein HscA  47.07 
 
 
622 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0826  chaperone protein HscA  49.83 
 
 
621 aa  531  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.353391  normal  0.61281 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2122  chaperone protein HscA  47.46 
 
 
622 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2146  chaperone protein HscA  47.39 
 
 
618 aa  531  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>