More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2313 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1489  chaperone protein HscA  56.5 
 
 		 621 aa  664    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2393  chaperone protein HscA  80.32 
 
 		 620 aa  1001    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000110447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02418  chaperone protein HscA  68.76 
 
 		 616 aa  823    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89877  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1142  Fe-S protein assembly chaperone HscA  68.6 
 
 		 616 aa  821    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1280  chaperone protein HscA  65.94 
 
 		 638 aa  798    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2146  chaperone protein HscA  57.81 
 
 		 618 aa  657    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843032  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3995  chaperone protein HscA  56.34 
 
 		 622 aa  661    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300549 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0846  chaperone protein HscA  60.51 
 
 		 620 aa  707    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2122  chaperone protein HscA  59.13 
 
 		 622 aa  686    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0252  chaperone protein HscA  57.51 
 
 		 619 aa  671    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1965  chaperone protein HscA  80.48 
 
 		 620 aa  1002    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0206747  hitchhiker  0.000657718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0889  chaperone protein HscA  60.48 
 
 		 620 aa  707    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000727661 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1024  chaperone protein HscA  59.32 
 
 		 621 aa  694    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.662352  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2747  chaperone protein HscA  68.6 
 
 		 616 aa  813    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1136  chaperone protein HscA  64.9 
 
 		 620 aa  787    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2032  chaperone protein HscA  58.81 
 
 		 622 aa  697    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2678  chaperone protein HscA  68.6 
 
 		 616 aa  820    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1303  chaperone protein HscA  62.54 
 
 		 619 aa  734    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323166  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2268  chaperone protein HscA  80.65 
 
 		 620 aa  1005    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1427  chaperone protein HscA  59.87 
 
 		 620 aa  707    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1704  chaperone protein HscA  58.65 
 
 		 622 aa  692    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.366095  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1485  chaperone protein HscA  58.65 
 
 		 622 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715947  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1043  chaperone protein HscA  58.08 
 
 		 621 aa  672    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1780  chaperone protein HscA  81.45 
 
 		 620 aa  984    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4332  chaperone protein HscA  59.87 
 
 		 620 aa  705    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000366602 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1241  chaperone protein HscA  59.55 
 
 		 620 aa  708    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2055  2-alkenal reductase  62.7 
 
 		 623 aa  764    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.223423  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1328  Fe-S protein assembly chaperone HscA  62.58 
 
 		 623 aa  732    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0889  chaperone protein HscA  58.04 
 
 		 621 aa  691    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0490665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1954  chaperone protein HscA  59.81 
 
 		 629 aa  715    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.296275  normal  0.863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1565  Fe-S protein assembly chaperone HscA  57.83 
 
 		 625 aa  683    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1063  chaperone protein HscA  58.59 
 
 		 621 aa  700    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2286  chaperone protein HscA  55.8 
 
 		 620 aa  650    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3757  chaperone protein HscA  68.6 
 
 		 616 aa  821    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0170788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2901  chaperone protein HscA  68.6 
 
 		 616 aa  822    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.87079  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1168  chaperone protein HscA  60.71 
 
 		 620 aa  733    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2595  chaperone protein HscA  58.65 
 
 		 622 aa  679    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.899432  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2801  chaperone protein HscA  67.31 
 
 		 616 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2276  chaperone protein HscA  81.45 
 
 		 620 aa  1019    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000669317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2728  chaperone protein HscA  58.49 
 
 		 622 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2213  chaperone protein HscA  58.65 
 
 		 622 aa  692    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2313  chaperone protein HscA  100 
 
 		 620 aa  1239    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.677318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4608  chaperone protein HscA  61.16 
 
 		 621 aa  718    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2810  chaperone protein HscA  68.6 
 
 		 616 aa  820    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.648326  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2867  chaperone protein HscA  81.13 
 
 		 620 aa  974    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000418416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2377  chaperone protein HscA  56.39 
 
 		 622 aa  645    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.750622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5428  chaperone protein HscA  58.81 
 
 		 622 aa  692    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0721  chaperone protein HscA  67.04 
 
 		 617 aa  831    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0431  chaperone protein HscA  65.63 
 
 		 638 aa  793    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1492  chaperone protein HscA  81.77 
 
 		 620 aa  1021    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3623  chaperone protein HscA  68.76 
 
 		 616 aa  830    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2145  chaperone protein HscA  79.03 
 
 		 620 aa  983    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000851094  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1297  chaperone protein HscA  79.68 
 
 		 619 aa  978    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0167807 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1148  chaperone protein HscA  59.46 
 
 		 622 aa  701    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.505415  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3107  chaperone protein HscA  58.65 
 
 		 622 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.594657  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1879  chaperone protein HscA  59.58 
 
 		 622 aa  700    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737508  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40360  chaperone protein HscA  60.26 
 
 		 621 aa  694    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2779  chaperone protein HscA  67.31 
 
 		 616 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.346282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1454  chaperone protein HscA  59.36 
 
 		 623 aa  705    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0281  chaperone protein HscA  67.95 
 
 		 616 aa  827    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00307418  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0826  chaperone protein HscA  57.49 
 
 		 621 aa  654    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.353391  normal  0.61281 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2201  chaperone protein HscA  59.16 
 
 		 622 aa  710    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14780  chaperone protein HscA  62.06 
 
 		 619 aa  728    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1151  chaperone protein HscA  68.6 
 
 		 616 aa  821    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2181  chaperone protein HscA  56.98 
 
 		 618 aa  645    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.174221  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2738  chaperone protein HscA  67.31 
 
 		 616 aa  822    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01059  chaperone protein HscA  67.36 
 
 		 617 aa  817    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0804  Fe-S protein assembly chaperone HscA  58.2 
 
 		 622 aa  714    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.428496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2182  chaperone protein HscA  55.64 
 
 		 620 aa  653    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0873671  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2159  chaperone protein HscA  58.81 
 
 		 622 aa  694    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.265898  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1557  chaperone protein HscA  58.17 
 
 		 613 aa  654    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218099  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2140  chaperone protein HscA  57.65 
 
 		 622 aa  658    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0156468 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1440  Fe-S protein assembly chaperone HscA  57.28 
 
 		 624 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.241862  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0876  chaperone protein HscA  60.03 
 
 		 620 aa  703    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70427  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1462  chaperone protein HscA  76.77 
 
 		 619 aa  941    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0476336  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2575  chaperone protein HscA  57.92 
 
 		 623 aa  688    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240484 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2651  chaperone protein HscA  58.65 
 
 		 622 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1642  chaperone protein HscA  57.17 
 
 		 622 aa  652    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.393087  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0954  chaperone protein HscA  58.04 
 
 		 621 aa  691    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282439 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2447  chaperone protein HscA  55.95 
 
 		 620 aa  642    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1029  chaperone protein HscA  57.4 
 
 		 621 aa  692    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.175393  normal  0.210751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3058  Fe-S protein assembly chaperone HscA  53.28 
 
 		 625 aa  638    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.156857  unclonable  0.00000109357 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0677  chaperone protein HscA  57.49 
 
 		 621 aa  654    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3507  chaperone protein HscA  60.26 
 
 		 621 aa  706    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0473  chaperone protein HscA  56.5 
 
 		 621 aa  657    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2694  chaperone protein HscA  67.15 
 
 		 616 aa  819    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2677  chaperone protein HscA  68.6 
 
 		 616 aa  821    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5955  chaperone protein HscA  59.13 
 
 		 622 aa  686    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1242  Fe-S protein assembly chaperone HscA  64.95 
 
 		 622 aa  766    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2913  chaperone protein HscA  67.31 
 
 		 616 aa  821    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2382  chaperone protein HscA  80.48 
 
 		 620 aa  1003    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000622111  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0285  chaperone protein HscA  64.19 
 
 		 616 aa  809    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2498  chaperone protein HscA  80.48 
 
 		 620 aa  1002    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184268  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1172  chaperone protein HscA  65.33 
 
 		 644 aa  795    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1743  chaperone protein HscA  81.94 
 
 		 620 aa  1021    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000392017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2258  chaperone protein HscA  57.65 
 
 		 618 aa  669    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1823  chaperone protein HscA  81.94 
 
 		 620 aa  1021    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.582459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2139  chaperone protein HscA  58.81 
 
 		 622 aa  690    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3023  chaperone protein HscA  68.6 
 
 		 616 aa  824    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.168254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2420  chaperone protein HscA  77.74 
 
 		 619 aa  935    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.643944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>