More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2835 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00014  molecular chaperone DnaK  61.8 
 
 
638 aa  775    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3583  chaperone protein DnaK  61.8 
 
 
638 aa  775    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766663  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0675  molecular chaperone DnaK  63.58 
 
 
658 aa  749    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.549648  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1399  molecular chaperone DnaK  60.78 
 
 
637 aa  775    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0033  molecular chaperone DnaK  69.58 
 
 
636 aa  892    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4727  molecular chaperone DnaK  61.49 
 
 
641 aa  773    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_002950  PG1208  molecular chaperone DnaK  59.81 
 
 
640 aa  753    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.48647 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0628  molecular chaperone DnaK  64.54 
 
 
646 aa  795    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0264746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1148  molecular chaperone DnaK  60.37 
 
 
609 aa  736    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1856  dnaK protein  62.73 
 
 
641 aa  792    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26903  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0928  molecular chaperone DnaK  61.84 
 
 
640 aa  790    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.689493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2635  molecular chaperone DnaK  61.88 
 
 
688 aa  773    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0170334  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4395  molecular chaperone DnaK  60 
 
 
611 aa  739    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00031537  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1313  chaperone protein DnaK  60.96 
 
 
633 aa  763    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3821  chaperone protein DnaK  58.85 
 
 
638 aa  738    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.486891  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0850  molecular chaperone DnaK  60.1 
 
 
623 aa  734    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.561749  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2125  molecular chaperone DnaK  66.61 
 
 
637 aa  849    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.864242  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1126  molecular chaperone DnaK  60.5 
 
 
639 aa  764    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4505  dnaK protein  60.87 
 
 
638 aa  765    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.493452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4213  molecular chaperone DnaK  59.53 
 
 
611 aa  734    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000284516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4051  molecular chaperone DnaK  59.53 
 
 
611 aa  734    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4061  molecular chaperone DnaK  59.53 
 
 
611 aa  734    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000542106  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2326  molecular chaperone DnaK  61.79 
 
 
650 aa  764    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2007  molecular chaperone DnaK  61.46 
 
 
644 aa  779    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2002  molecular chaperone DnaK  61.46 
 
 
644 aa  780    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4195  molecular chaperone DnaK  60.4 
 
 
638 aa  759    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.697831  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2132  molecular chaperone DnaK  57.54 
 
 
647 aa  737    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0108492  normal  0.497205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0923  heat shock protein Hsp70  61.46 
 
 
645 aa  776    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.831723  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1313  molecular chaperone DnaK  57.66 
 
 
630 aa  730    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.634921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2785  molecular chaperone DnaK  61.65 
 
 
647 aa  769    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134796  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0554  molecular chaperone DnaK  60 
 
 
634 aa  760    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1538  molecular chaperone protein DnaK  63.72 
 
 
639 aa  804    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.163821 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0197  molecular chaperone DnaK  67.17 
 
 
630 aa  828    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432012  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0295  molecular chaperone DnaK  59.06 
 
 
633 aa  730    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3322  molecular chaperone DnaK  61.79 
 
 
650 aa  764    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2811  heat shock protein Hsp70  62.07 
 
 
640 aa  793    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0535458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0763  molecular chaperone DnaK  61.96 
 
 
638 aa  778    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.240702  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1173  molecular chaperone DnaK  63.12 
 
 
636 aa  804    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0107  molecular chaperone DnaK  68.34 
 
 
634 aa  886    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0126383  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3839  molecular chaperone DnaK  61.48 
 
 
650 aa  758    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0621  molecular chaperone DnaK  61.76 
 
 
637 aa  783    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1893  molecular chaperone DnaK  62.48 
 
 
637 aa  771    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.457552  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3532  molecular chaperone DnaK  69.31 
 
 
638 aa  887    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00119444  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1023  molecular chaperone DnaK  85.74 
 
 
637 aa  1102    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0870  heat shock protein Hsp70  63.14 
 
 
638 aa  776    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100089  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4539  molecular chaperone DnaK  59.53 
 
 
611 aa  734    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000969384  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1797  molecular chaperone DnaK  57.41 
 
 
645 aa  728    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0693908  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2468  molecular chaperone DnaK  59.75 
 
 
634 aa  762    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.501675  hitchhiker  0.000000000338371 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2239  molecular chaperone DnaK  62.17 
 
 
644 aa  792    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0425957  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3555  molecular chaperone DnaK  66.46 
 
 
639 aa  854    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0866908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  62.88 
 
 
612 aa  751    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1308  molecular chaperone DnaK  61.33 
 
 
650 aa  760    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.395339  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1580  chaperone DnaK  64.11 
 
 
632 aa  794    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308505  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4328  molecular chaperone DnaK  64.25 
 
 
609 aa  789    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.977158  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0429  molecular chaperone DnaK  64.89 
 
 
633 aa  827    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2054  molecular chaperone DnaK  61.68 
 
 
635 aa  769    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0019  chaperone protein DnaK  61.76 
 
 
636 aa  755    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0471  molecular chaperone DnaK  60.78 
 
 
635 aa  771    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0555822  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0212  molecular chaperone DnaK  64.05 
 
 
639 aa  783    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1969  molecular chaperone DnaK  61.23 
 
 
651 aa  776    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00608101  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2733  molecular chaperone DnaK  63.97 
 
 
643 aa  764    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000184427  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0329  molecular chaperone DnaK  67 
 
 
632 aa  816    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813132  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0751  chaperone DnaK  61.65 
 
 
640 aa  764    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.805739  normal  0.219742 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3126  molecular chaperone DnaK  61.15 
 
 
647 aa  754    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00776768  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3961  molecular chaperone DnaK  59.97 
 
 
653 aa  758    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727521  normal  0.0784984 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1182  molecular chaperone DnaK  60.19 
 
 
638 aa  763    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163847  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0391  molecular chaperone DnaK  64.58 
 
 
633 aa  828    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3094  chaperone DnaK  61.34 
 
 
644 aa  779    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0408879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0155  molecular chaperone DnaK  67.17 
 
 
632 aa  824    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2456  molecular chaperone DnaK  57.7 
 
 
647 aa  739    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00641905  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2922  molecular chaperone DnaK  61.34 
 
 
648 aa  763    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797914  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0552  chaperone protein DnaK  58.7 
 
 
631 aa  749    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0982  molecular chaperone DnaK  65.45 
 
 
644 aa  804    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000339197  unclonable  0.0000180058 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0010  molecular chaperone DnaK  62.95 
 
 
642 aa  811    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0949466  normal  0.47597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0402  molecular chaperone DnaK  62.46 
 
 
643 aa  801    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.362768  normal  0.130805 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2058  molecular chaperone DnaK  63.54 
 
 
634 aa  810    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0268  molecular chaperone DnaK  61.17 
 
 
650 aa  758    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0784  chaperone DnaK  63.44 
 
 
636 aa  770    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1987  molecular chaperone DnaK  59.94 
 
 
639 aa  759    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.636054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0679  molecular chaperone DnaK  67.24 
 
 
636 aa  857    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470568  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3101  molecular chaperone DnaK  59.22 
 
 
632 aa  747    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2290  molecular chaperone DnaK  62.17 
 
 
619 aa  762    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  62.48 
 
 
619 aa  775    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1194  molecular chaperone DnaK  61.8 
 
 
635 aa  773    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00921212  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1306  molecular chaperone DnaK  59.5 
 
 
638 aa  737    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35463  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0957  molecular chaperone DnaK  60.65 
 
 
639 aa  764    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0995  molecular chaperone DnaK  60.65 
 
 
639 aa  764    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0204392  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1900  molecular chaperone DnaK  63.98 
 
 
671 aa  818    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.393588  normal  0.969601 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0969  molecular chaperone DnaK  60.81 
 
 
638 aa  763    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.291129  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  58.33 
 
 
610 aa  744    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3001  chaperone protein DnaK  64.26 
 
 
636 aa  799    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0646  molecular chaperone DnaK  60.86 
 
 
650 aa  756    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62970  molecular chaperone DnaK  61.55 
 
 
637 aa  775    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0423823  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0752  molecular chaperone DnaK  61.17 
 
 
650 aa  758    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1036  chaperone protein DnaK  68.07 
 
 
641 aa  881    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000619516  hitchhiker  0.000149965 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0510  chaperone protein DnaK  64.41 
 
 
653 aa  825    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0638299  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0959  molecular chaperone DnaK  60.81 
 
 
639 aa  766    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0334727  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1089  molecular chaperone DnaK  60.69 
 
 
626 aa  744    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000419438  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1404  molecular chaperone DnaK  69.11 
 
 
636 aa  885    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00594741  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0864  molecular chaperone DnaK  61.25 
 
 
640 aa  780    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.873902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>