More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0960 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  100 
 
 
325 aa  649    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1450  phosphate binding protein  84.29 
 
 
327 aa  519  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467901  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1479  phosphate binding protein  84.29 
 
 
327 aa  519  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.991618  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  41.09 
 
 
666 aa  203  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  40.36 
 
 
669 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4012  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  35.69 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  37.22 
 
 
313 aa  199  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  41.18 
 
 
297 aa  199  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4388  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  36.1 
 
 
305 aa  198  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4405  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  35.35 
 
 
305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0848  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  36.46 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4292  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  35.02 
 
 
305 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000804366 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4174  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  35.02 
 
 
305 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4022  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  35.02 
 
 
305 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4496  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  35.02 
 
 
305 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  36.95 
 
 
338 aa  195  7e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4352  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  35.02 
 
 
305 aa  195  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  35.43 
 
 
341 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4125  phosphate binding protein  35.02 
 
 
302 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3000  phosphate binding protein  35.74 
 
 
305 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  38.41 
 
 
340 aa  192  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0357  phosphate binding protein  36.11 
 
 
376 aa  191  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129882  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3610  phosphate binding protein  36.82 
 
 
376 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  39.71 
 
 
342 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  36.2 
 
 
337 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0330  phosphate binding protein  39.86 
 
 
318 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0209981  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  37.41 
 
 
651 aa  188  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1829  phosphate binding protein  33.99 
 
 
338 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  36.1 
 
 
337 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3818  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  37.91 
 
 
340 aa  186  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.389852 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1249  phosphate binding protein  34.72 
 
 
340 aa  185  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00301089  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  35.43 
 
 
339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4300  phosphate binding protein  35.51 
 
 
369 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0495  phosphate binding protein  35 
 
 
361 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.853772  hitchhiker  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2488  phosphate binding protein  36.33 
 
 
331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435114  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0286  phosphate binding protein  39.06 
 
 
315 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3447  phosphate binding protein  37.76 
 
 
328 aa  182  9.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  35.74 
 
 
332 aa  180  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3298  phosphate binding protein  35.45 
 
 
347 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2825  phosphate binding protein  35.45 
 
 
347 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.820389  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  37.82 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  36.69 
 
 
334 aa  179  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  35.84 
 
 
326 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3716  phosphate binding protein  32.36 
 
 
352 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.583691  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  35.61 
 
 
333 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0192  phosphate binding protein  33.78 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  34.15 
 
 
692 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3334  phosphate binding protein  32.88 
 
 
349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4582  phosphate binding protein  33.96 
 
 
345 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246324  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1793  phosphate binding protein  33.46 
 
 
332 aa  169  7e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0045  phosphate binding protein  34.74 
 
 
333 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8362  normal  0.817382 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0502  phosphate binding protein  35.81 
 
 
329 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.940111  normal  0.578937 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4906  phosphate binding protein  31.64 
 
 
357 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.265302  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1053  phosphate binding protein  36.6 
 
 
318 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216116  hitchhiker  0.000268052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1024  phosphate binding protein  36.6 
 
 
318 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  31.68 
 
 
340 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  31.68 
 
 
340 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4492  phosphate binding protein  33.94 
 
 
326 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.89285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4077  phosphate binding protein  31.27 
 
 
313 aa  162  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.844211  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0670  phosphate binding protein  30.71 
 
 
333 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0494  phosphate binding protein  28.04 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2478  phosphate binding protein  35.79 
 
 
324 aa  145  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2358  ABC transporter periplasmic phosphate-binding protein  27.38 
 
 
342 aa  138  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  34.65 
 
 
284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  34.92 
 
 
301 aa  135  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  35.25 
 
 
270 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  31.64 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  30.8 
 
 
283 aa  126  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  31.58 
 
 
285 aa  125  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  34.23 
 
 
278 aa  125  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  34.66 
 
 
272 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  29.77 
 
 
278 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1228  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  30.57 
 
 
348 aa  124  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.458915  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  30.86 
 
 
274 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  33.45 
 
 
271 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  35.02 
 
 
272 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  35.02 
 
 
272 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  35.02 
 
 
272 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  32.7 
 
 
381 aa  122  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0826  phosphate binding protein, putative  31.83 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320432  normal  0.0147746 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  32.33 
 
 
272 aa  120  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.95 
 
 
272 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0168  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  30.92 
 
 
344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0178  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  30.26 
 
 
344 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433451  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  27.31 
 
 
558 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  30.2 
 
 
273 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  30.28 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  31.23 
 
 
271 aa  116  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  32.14 
 
 
276 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5041  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  30.8 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  32.52 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  32.14 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.14 
 
 
276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0495  ABC transporter substrate binding protein (phosphate)  31.71 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135547  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  30.31 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4330  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  30.18 
 
 
342 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0632044  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0119  putative phosphate-binding periplasmic protein  28.95 
 
 
344 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  32.13 
 
 
272 aa  112  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1402  hypothetical protein  31.37 
 
 
388 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.728708 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  30.66 
 
 
284 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>