201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4330 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4330  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  100 
 
 		 342 aa  690    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0632044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1919  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  73.68 
 
 		 347 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141978  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  73.98 
 
 		 346 aa  501  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2604  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  71.35 
 
 		 347 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1262  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  71.64 
 
 		 347 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2289  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  66.27 
 
 		 344 aa  464  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.789525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1533  periplasmic binding protein  68.15 
 
 		 341 aa  462  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0119  putative phosphate-binding periplasmic protein  69.21 
 
 		 344 aa  448  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_004310  BR2138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  61.76 
 
 		 348 aa  431  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0495  ABC transporter substrate binding protein (phosphate)  63.3 
 
 		 341 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135547  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0771  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  62.06 
 
 		 348 aa  428  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2053  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  61.47 
 
 		 348 aa  428  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0168  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  65.9 
 
 		 344 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0178  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  65.9 
 
 		 344 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433451  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1228  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  58.1 
 
 		 348 aa  391  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.458915  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3121  phosphate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  56.09 
 
 		 346 aa  335  7e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355955  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1476  periplasmic phosphate binding protein  44.28 
 
 		 341 aa  285  7e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0598  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  46.45 
 
 		 342 aa  271  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0165881  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0464  periplasmic phosphate binding protein  43.73 
 
 		 337 aa  262  6e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.707597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2679  periplasmic phosphate binding protein  42.09 
 
 		 338 aa  260  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3629  phosphate ABC transporter periplasmic binding protein  42.25 
 
 		 349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0394  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  43.44 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1784  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  40 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1230  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  40.84 
 
 		 408 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3755  phosphate binding protein, putative  40.18 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.58233 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2565  periplasmic phosphate binding protein  41.72 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0501  periplasmic phosphate binding protein  41.85 
 
 		 342 aa  236  4e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2409  ABC phosphate transporter eriplasmic phosphate-binding protein  42.76 
 
 		 350 aa  236  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0315618 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0949  phosphate binding protein, putative  40.55 
 
 		 351 aa  236  6e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0396  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  43.3 
 
 		 351 aa  235  7e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.883019 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0376  periplasmic phosphate binding protein  42.72 
 
 		 342 aa  235  8e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1544  phosphate binding protein, putative  41.18 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3318  phosphate binding protein, putative  39.35 
 
 		 361 aa  233  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0263  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  40.92 
 
 		 347 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_002978  WD0378  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  36.2 
 
 		 338 aa  228  9e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.686429  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1859  periplasmic phosphate binding protein  38.89 
 
 		 346 aa  227  3e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.266184  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2276  phosphate binding protein, putative  37.89 
 
 		 353 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0716872  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0642  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  38.94 
 
 		 331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1056  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  38.94 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.929077  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0826  phosphate binding protein, putative  39.5 
 
 		 353 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320432  normal  0.0147746 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4242  putative phosphate-binding periplasmic protein  37.06 
 
 		 339 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.391821 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0716  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  37.17 
 
 		 331 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0150  phosphate ABC transporter, periplasmicphosphate-binding protein, putative  34.22 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0122043  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0977  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  32.83 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0801  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  34.33 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0063  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  34.57 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3102  phosphate binding protein, putative  34.65 
 
 		 383 aa  189  8e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0457162  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2035  phosphate binding protein, putative  32.33 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4582  phosphate binding protein  31.54 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246324  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  29.11 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  29.38 
 
 		 332 aa  122  9e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  34.21 
 
 		 313 aa  122  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  33.23 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3334  phosphate binding protein  29.13 
 
 		 349 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  28.21 
 
 		 666 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2488  phosphate binding protein  31.03 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  28.98 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  31.71 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3610  phosphate binding protein  30.9 
 
 		 376 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  28.47 
 
 		 669 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  31.16 
 
 		 333 aa  116  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  28.14 
 
 		 340 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  28.14 
 
 		 340 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  30 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4300  phosphate binding protein  30.24 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0670  phosphate binding protein  29.74 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1053  phosphate binding protein  29.04 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216116  hitchhiker  0.000268052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1024  phosphate binding protein  29.04 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.18 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0495  phosphate binding protein  30.8 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.853772  hitchhiker  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  29.62 
 
 		 651 aa  112  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  29.77 
 
 		 692 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  28.52 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0286  phosphate binding protein  31.74 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4077  phosphate binding protein  28.3 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.844211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1450  phosphate binding protein  29.57 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467901  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1479  phosphate binding protein  29.57 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.991618  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2825  phosphate binding protein  26.93 
 
 		 347 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.820389  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3298  phosphate binding protein  26.93 
 
 		 347 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  29.83 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3716  phosphate binding protein  28.39 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.583691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3818  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  29.41 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.389852 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  31.77 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0330  phosphate binding protein  31.19 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0209981  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1249  phosphate binding protein  27.54 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00301089  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2478  phosphate binding protein  29.63 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  31.21 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  30.9 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4906  phosphate binding protein  30.23 
 
 		 357 aa  99.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.265302  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1829  phosphate binding protein  27.12 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0357  phosphate binding protein  27.33 
 
 		 376 aa  97.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129882  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0045  phosphate binding protein  26.18 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8362  normal  0.817382 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  27.96 
 
 		 274 aa  97.1  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  27.19 
 
 		 278 aa  95.9  9e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4492  phosphate binding protein  31.14 
 
 		 326 aa  95.9  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.89285 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0502  phosphate binding protein  28.97 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.940111  normal  0.578937 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  28.42 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0192  phosphate binding protein  28.12 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1793  phosphate binding protein  28.94 
 
 		 332 aa  94.4  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4125  phosphate binding protein  24.18 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>