202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1262 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2604  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  99.71 
 
 
347 aa  706    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1262  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  100 
 
 
347 aa  707    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1919  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  91.35 
 
 
347 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141978  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  71.72 
 
 
346 aa  501  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4330  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  71.64 
 
 
342 aa  492  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0632044  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1533  periplasmic binding protein  71.47 
 
 
341 aa  481  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2289  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  68.6 
 
 
344 aa  481  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.789525  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0119  putative phosphate-binding periplasmic protein  62.57 
 
 
344 aa  415  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_004310  BR2138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  59 
 
 
348 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2053  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  59 
 
 
348 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0771  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  58.7 
 
 
348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0495  ABC transporter substrate binding protein (phosphate)  61.38 
 
 
341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135547  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0168  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  63.4 
 
 
344 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0178  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  63.07 
 
 
344 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433451  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1228  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  53.45 
 
 
348 aa  370  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.458915  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3121  phosphate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  56.07 
 
 
346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355955  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0598  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  43.83 
 
 
342 aa  264  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0165881  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1476  periplasmic phosphate binding protein  42.39 
 
 
341 aa  262  8e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3629  phosphate ABC transporter periplasmic binding protein  42.06 
 
 
349 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0464  periplasmic phosphate binding protein  42.72 
 
 
337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.707597  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1230  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  43.03 
 
 
408 aa  253  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3755  phosphate binding protein, putative  40.9 
 
 
347 aa  249  5e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.58233 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1544  phosphate binding protein, putative  42.53 
 
 
344 aa  246  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132302  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2679  periplasmic phosphate binding protein  39.23 
 
 
338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2409  ABC phosphate transporter eriplasmic phosphate-binding protein  41.78 
 
 
350 aa  242  9e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0315618 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0376  periplasmic phosphate binding protein  41.72 
 
 
342 aa  241  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0394  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  41.72 
 
 
359 aa  240  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0949  phosphate binding protein, putative  39.77 
 
 
351 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3318  phosphate binding protein, putative  40 
 
 
361 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2276  phosphate binding protein, putative  40.91 
 
 
353 aa  236  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0716872  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1784  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  38.73 
 
 
346 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0396  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  40.55 
 
 
351 aa  229  4e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.883019 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0501  periplasmic phosphate binding protein  40.06 
 
 
342 aa  229  6e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2565  periplasmic phosphate binding protein  39.94 
 
 
344 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0826  phosphate binding protein, putative  41.18 
 
 
353 aa  227  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320432  normal  0.0147746 
 
 
-
 
NC_002978  WD0378  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  36.93 
 
 
338 aa  222  6e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.686429  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0263  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  37.86 
 
 
347 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1859  periplasmic phosphate binding protein  35.26 
 
 
346 aa  206  4e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.266184  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4242  putative phosphate-binding periplasmic protein  37.14 
 
 
339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.391821 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0063  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  35.47 
 
 
338 aa  199  7.999999999999999e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3102  phosphate binding protein, putative  35.63 
 
 
383 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0457162  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0977  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  32.49 
 
 
339 aa  186  5e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0150  phosphate ABC transporter, periplasmicphosphate-binding protein, putative  32.39 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0122043  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1056  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  34.51 
 
 
331 aa  179  4e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.929077  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0642  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  33.92 
 
 
331 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0716  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  33.04 
 
 
331 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0801  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  31.27 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2035  phosphate binding protein, putative  32.12 
 
 
338 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  30.95 
 
 
666 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  29.51 
 
 
669 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  29.36 
 
 
332 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  29.41 
 
 
651 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3610  phosphate binding protein  29.72 
 
 
376 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  29.9 
 
 
692 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  30.03 
 
 
313 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.87 
 
 
325 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2488  phosphate binding protein  30.25 
 
 
331 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435114  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3334  phosphate binding protein  26.79 
 
 
349 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  27.24 
 
 
342 aa  99.8  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  30.12 
 
 
337 aa  99.4  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4300  phosphate binding protein  28.4 
 
 
369 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  27.22 
 
 
341 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  27.74 
 
 
297 aa  97.4  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4582  phosphate binding protein  26.25 
 
 
345 aa  97.1  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246324  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  25 
 
 
340 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  25 
 
 
340 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  29.65 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  27.63 
 
 
337 aa  94.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4077  phosphate binding protein  27.41 
 
 
313 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.844211  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1829  phosphate binding protein  27.74 
 
 
338 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1053  phosphate binding protein  25.91 
 
 
318 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216116  hitchhiker  0.000268052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1024  phosphate binding protein  25.91 
 
 
318 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1450  phosphate binding protein  28.47 
 
 
327 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467901  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1479  phosphate binding protein  28.47 
 
 
327 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.991618  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0495  phosphate binding protein  27.8 
 
 
361 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.853772  hitchhiker  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  28.28 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0357  phosphate binding protein  27.33 
 
 
376 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129882  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  28.06 
 
 
278 aa  89.4  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  30.1 
 
 
334 aa  89  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2478  phosphate binding protein  27.19 
 
 
324 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  27.12 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2825  phosphate binding protein  24.69 
 
 
347 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.820389  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3298  phosphate binding protein  24.69 
 
 
347 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4125  phosphate binding protein  24.03 
 
 
302 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3818  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  26.21 
 
 
340 aa  86.3  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.389852 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3000  phosphate binding protein  24.62 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3716  phosphate binding protein  26.74 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.583691  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  26.95 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  28.43 
 
 
274 aa  84  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0045  phosphate binding protein  23.41 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8362  normal  0.817382 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  26.84 
 
 
326 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  28.03 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4906  phosphate binding protein  28.96 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.265302  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1249  phosphate binding protein  25.57 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00301089  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  31.29 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1793  phosphate binding protein  26.71 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4405  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.46 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4012  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.82 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  28.77 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4022  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.74 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>