174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1919 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1919  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 
347 aa  707    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141978  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2604  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  91.07 
 
 
347 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1262  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  91.35 
 
 
347 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4330  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  73.68 
 
 
342 aa  505  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0632044  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  69.97 
 
 
346 aa  492  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2289  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  68.6 
 
 
344 aa  482  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.789525  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1533  periplasmic binding protein  69.91 
 
 
341 aa  473  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0119  putative phosphate-binding periplasmic protein  65.35 
 
 
344 aa  425  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0771  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  62.42 
 
 
348 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  61.82 
 
 
348 aa  419  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2053  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  61.82 
 
 
348 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0168  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  62.31 
 
 
344 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0178  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  61.99 
 
 
344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433451  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0495  ABC transporter substrate binding protein (phosphate)  62.01 
 
 
341 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135547  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1228  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  55.49 
 
 
348 aa  375  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.458915  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3121  phosphate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  55.99 
 
 
346 aa  332  6e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355955  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0598  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  44.92 
 
 
342 aa  266  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0165881  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1544  phosphate binding protein, putative  43.51 
 
 
344 aa  257  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132302  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1230  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  43.45 
 
 
408 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1476  periplasmic phosphate binding protein  42.09 
 
 
341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0464  periplasmic phosphate binding protein  42.41 
 
 
337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.707597  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0376  periplasmic phosphate binding protein  42.94 
 
 
342 aa  252  7e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3629  phosphate ABC transporter periplasmic binding protein  41.54 
 
 
349 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2679  periplasmic phosphate binding protein  41.1 
 
 
338 aa  249  5e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3755  phosphate binding protein, putative  40.77 
 
 
347 aa  245  8e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.58233 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3318  phosphate binding protein, putative  38.75 
 
 
361 aa  243  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2409  ABC phosphate transporter eriplasmic phosphate-binding protein  41.12 
 
 
350 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0315618 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0949  phosphate binding protein, putative  39.88 
 
 
351 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0394  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  41.06 
 
 
359 aa  235  8e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0501  periplasmic phosphate binding protein  40.98 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2276  phosphate binding protein, putative  39.26 
 
 
353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0716872  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0396  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  41.77 
 
 
351 aa  232  7.000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.883019 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2565  periplasmic phosphate binding protein  40.85 
 
 
344 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1784  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  39.14 
 
 
346 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0826  phosphate binding protein, putative  39.88 
 
 
353 aa  223  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320432  normal  0.0147746 
 
 
-
 
NC_002978  WD0378  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  36.6 
 
 
338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.686429  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0263  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  37.86 
 
 
347 aa  212  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1859  periplasmic phosphate binding protein  34.69 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.266184  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4242  putative phosphate-binding periplasmic protein  37.46 
 
 
339 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.391821 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3102  phosphate binding protein, putative  35.33 
 
 
383 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0457162  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0063  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  33.64 
 
 
338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0150  phosphate ABC transporter, periplasmicphosphate-binding protein, putative  32.04 
 
 
340 aa  182  8.000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0122043  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0977  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  32.18 
 
 
339 aa  181  2e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1056  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  34.22 
 
 
331 aa  180  4e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.929077  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0642  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  33.63 
 
 
331 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0716  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  32.35 
 
 
331 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0801  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  30.54 
 
 
327 aa  161  1e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2035  phosphate binding protein, putative  31.79 
 
 
338 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  28.44 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  30.27 
 
 
666 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2488  phosphate binding protein  30.37 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435114  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  30.63 
 
 
337 aa  109  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  27.21 
 
 
340 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  27.21 
 
 
340 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  28.61 
 
 
651 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  28.82 
 
 
669 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  30.6 
 
 
333 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3334  phosphate binding protein  28.04 
 
 
349 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3610  phosphate binding protein  31.6 
 
 
376 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  27.71 
 
 
342 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  28.35 
 
 
341 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  29.9 
 
 
313 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  29.24 
 
 
692 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  26.65 
 
 
339 aa  99  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4582  phosphate binding protein  26.77 
 
 
345 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246324  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  29.01 
 
 
334 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0495  phosphate binding protein  29.14 
 
 
361 aa  97.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.853772  hitchhiker  0.00177045 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2825  phosphate binding protein  25.94 
 
 
347 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.820389  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3298  phosphate binding protein  25.94 
 
 
347 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3818  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  26.86 
 
 
340 aa  96.3  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.389852 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1829  phosphate binding protein  28.04 
 
 
338 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  27.42 
 
 
337 aa  95.9  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  28.98 
 
 
326 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4300  phosphate binding protein  29.76 
 
 
369 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.53 
 
 
325 aa  94  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2478  phosphate binding protein  29.19 
 
 
324 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1053  phosphate binding protein  26.09 
 
 
318 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216116  hitchhiker  0.000268052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1024  phosphate binding protein  26.09 
 
 
318 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  27.36 
 
 
297 aa  92.8  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  28.91 
 
 
333 aa  92.8  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0357  phosphate binding protein  26.56 
 
 
376 aa  92  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129882  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  28.83 
 
 
278 aa  92  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  26.67 
 
 
340 aa  91.3  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0045  phosphate binding protein  25.08 
 
 
333 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8362  normal  0.817382 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4077  phosphate binding protein  26.85 
 
 
313 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.844211  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3716  phosphate binding protein  26.9 
 
 
352 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.583691  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1450  phosphate binding protein  25.69 
 
 
327 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467901  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1479  phosphate binding protein  25.69 
 
 
327 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.991618  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0192  phosphate binding protein  27.27 
 
 
312 aa  86.7  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4906  phosphate binding protein  28.05 
 
 
357 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.265302  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  27.74 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0670  phosphate binding protein  25.08 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3000  phosphate binding protein  24.31 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1249  phosphate binding protein  25.57 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00301089  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  27.33 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  27.68 
 
 
272 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0502  phosphate binding protein  28.03 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.940111  normal  0.578937 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  29.3 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  25.33 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  26.02 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>