195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2409 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2409  ABC phosphate transporter eriplasmic phosphate-binding protein  100 
 
 
350 aa  721    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0315618 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3755  phosphate binding protein, putative  63.9 
 
 
347 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.58233 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1230  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  66.97 
 
 
408 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0949  phosphate binding protein, putative  61.93 
 
 
351 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0598  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  60.06 
 
 
342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0165881  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1544  phosphate binding protein, putative  62.27 
 
 
344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132302  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3318  phosphate binding protein, putative  55.62 
 
 
361 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0394  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  56.15 
 
 
359 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0396  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  55.41 
 
 
351 aa  371  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.883019 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3629  phosphate ABC transporter periplasmic binding protein  54.8 
 
 
349 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0464  periplasmic phosphate binding protein  50.29 
 
 
337 aa  345  5e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.707597  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1784  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  51.82 
 
 
346 aa  344  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0376  periplasmic phosphate binding protein  52.44 
 
 
342 aa  343  4e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1476  periplasmic phosphate binding protein  50.14 
 
 
341 aa  341  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0826  phosphate binding protein, putative  53.17 
 
 
353 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320432  normal  0.0147746 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1859  periplasmic phosphate binding protein  50.61 
 
 
346 aa  335  1e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.266184  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2565  periplasmic phosphate binding protein  51.68 
 
 
344 aa  330  3e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2679  periplasmic phosphate binding protein  49.7 
 
 
338 aa  330  3e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0263  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  48.48 
 
 
347 aa  316  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0501  periplasmic phosphate binding protein  46.88 
 
 
342 aa  316  4e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2276  phosphate binding protein, putative  48.74 
 
 
353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0716872  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0378  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  41.47 
 
 
338 aa  276  4e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.686429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3102  phosphate binding protein, putative  44.86 
 
 
383 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0457162  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1056  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  44.41 
 
 
331 aa  264  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.929077  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0642  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  44.41 
 
 
331 aa  261  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0168  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  43.52 
 
 
344 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0178  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  43.21 
 
 
344 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433451  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0771  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  40.7 
 
 
348 aa  252  8.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0716  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  42.94 
 
 
331 aa  251  1e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2035  phosphate binding protein, putative  39.48 
 
 
338 aa  250  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2053  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  40.12 
 
 
348 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  40.12 
 
 
348 aa  250  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0495  ABC transporter substrate binding protein (phosphate)  43.99 
 
 
341 aa  250  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135547  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  41.12 
 
 
346 aa  245  8e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0801  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  42.19 
 
 
327 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2289  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  39.35 
 
 
344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.789525  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0977  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  38.7 
 
 
339 aa  243  5e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1262  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  41.78 
 
 
347 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2604  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  41.78 
 
 
347 aa  242  9e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0150  phosphate ABC transporter, periplasmicphosphate-binding protein, putative  38.72 
 
 
340 aa  241  2e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0122043  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3121  phosphate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  41.28 
 
 
346 aa  240  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355955  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0119  putative phosphate-binding periplasmic protein  40.76 
 
 
344 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1919  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  41.36 
 
 
347 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141978  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4330  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  42.76 
 
 
342 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0632044  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1533  periplasmic binding protein  39.6 
 
 
341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0063  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  34.65 
 
 
338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1228  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  39.27 
 
 
348 aa  212  5.999999999999999e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.458915  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4242  putative phosphate-binding periplasmic protein  34.25 
 
 
339 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.391821 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  31.38 
 
 
313 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  31.32 
 
 
669 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  31.32 
 
 
666 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  34.45 
 
 
337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4582  phosphate binding protein  31.48 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246324  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  28.94 
 
 
651 aa  126  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  28.87 
 
 
297 aa  123  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  31.89 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  30.75 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  32.34 
 
 
692 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  30.1 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3000  phosphate binding protein  28.62 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2488  phosphate binding protein  31.23 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435114  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1053  phosphate binding protein  30.75 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216116  hitchhiker  0.000268052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1024  phosphate binding protein  30.75 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3334  phosphate binding protein  28.27 
 
 
349 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  27.93 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  29.93 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4906  phosphate binding protein  29.68 
 
 
357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.265302  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0192  phosphate binding protein  30.32 
 
 
312 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  26.86 
 
 
340 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  30 
 
 
326 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  26.86 
 
 
340 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3447  phosphate binding protein  30.96 
 
 
328 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3610  phosphate binding protein  27.84 
 
 
376 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0357  phosphate binding protein  28 
 
 
376 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129882  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3298  phosphate binding protein  27.95 
 
 
347 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  30.25 
 
 
339 aa  106  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2825  phosphate binding protein  27.95 
 
 
347 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.820389  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0670  phosphate binding protein  28.21 
 
 
333 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4300  phosphate binding protein  27.04 
 
 
369 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2478  phosphate binding protein  29.15 
 
 
324 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4077  phosphate binding protein  26.54 
 
 
313 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.844211  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4352  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.42 
 
 
305 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0495  phosphate binding protein  28.99 
 
 
361 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.853772  hitchhiker  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4405  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.42 
 
 
305 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3716  phosphate binding protein  29.26 
 
 
352 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.583691  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4012  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.1 
 
 
305 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1793  phosphate binding protein  27.22 
 
 
332 aa  103  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0502  phosphate binding protein  28.71 
 
 
329 aa  102  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.940111  normal  0.578937 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4125  phosphate binding protein  27.06 
 
 
302 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.99 
 
 
325 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  27.88 
 
 
333 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4174  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  27.1 
 
 
305 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4496  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  27.1 
 
 
305 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4388  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.47 
 
 
305 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0848  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.76 
 
 
305 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  28.01 
 
 
337 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4022  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.77 
 
 
305 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4292  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.1 
 
 
305 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000804366 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3818  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  26.93 
 
 
340 aa  97.1  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.389852 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  29.9 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>