203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0394 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0394  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  100 
 
 		 359 aa  744    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0598  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  58.97 
 
 		 342 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0165881  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2409  ABC phosphate transporter eriplasmic phosphate-binding protein  56.33 
 
 		 350 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0315618 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3755  phosphate binding protein, putative  53.24 
 
 		 347 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.58233 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0949  phosphate binding protein, putative  50.58 
 
 		 351 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0396  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  53.17 
 
 		 351 aa  354  2e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.883019 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3629  phosphate ABC transporter periplasmic binding protein  50.14 
 
 		 349 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1230  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  51.25 
 
 		 408 aa  345  8e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1859  periplasmic phosphate binding protein  51.04 
 
 		 346 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.266184  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1476  periplasmic phosphate binding protein  50.58 
 
 		 341 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1784  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  48.27 
 
 		 346 aa  328  8e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1544  phosphate binding protein, putative  49.37 
 
 		 344 aa  325  6e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0263  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  48.52 
 
 		 347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2679  periplasmic phosphate binding protein  50.31 
 
 		 338 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3318  phosphate binding protein, putative  43.55 
 
 		 361 aa  308  9e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0464  periplasmic phosphate binding protein  47.02 
 
 		 337 aa  306  3e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.707597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2565  periplasmic phosphate binding protein  50 
 
 		 344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0826  phosphate binding protein, putative  47.95 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320432  normal  0.0147746 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0501  periplasmic phosphate binding protein  45.82 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0376  periplasmic phosphate binding protein  45.29 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1056  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  43.87 
 
 		 331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.929077  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0642  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  43.87 
 
 		 331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0716  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  43.25 
 
 		 331 aa  279  5e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2276  phosphate binding protein, putative  45.4 
 
 		 353 aa  279  5e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0716872  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0771  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  42.14 
 
 		 348 aa  262  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  41.84 
 
 		 348 aa  261  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2035  phosphate binding protein, putative  43.09 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2053  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  41.84 
 
 		 348 aa  261  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0495  ABC transporter substrate binding protein (phosphate)  43.91 
 
 		 341 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135547  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0801  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  41.56 
 
 		 327 aa  260  3e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0168  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  42.06 
 
 		 344 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0178  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  42.37 
 
 		 344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433451  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_002978  WD0378  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  40.06 
 
 		 338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.686429  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0119  putative phosphate-binding periplasmic protein  41.72 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  42.06 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4330  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  43.26 
 
 		 342 aa  246  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0632044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2289  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  37.97 
 
 		 344 aa  243  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.789525  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3102  phosphate binding protein, putative  37.92 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0457162  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0977  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  38.75 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1262  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  40.81 
 
 		 347 aa  239  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2604  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  40.81 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1533  periplasmic binding protein  39.38 
 
 		 341 aa  236  6e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1919  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  40.86 
 
 		 347 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141978  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0150  phosphate ABC transporter, periplasmicphosphate-binding protein, putative  39.06 
 
 		 340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0122043  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1228  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  40 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.458915  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3121  phosphate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  40.81 
 
 		 346 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355955  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0063  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  37.01 
 
 		 338 aa  218  2e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4242  putative phosphate-binding periplasmic protein  32.92 
 
 		 339 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.391821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  34 
 
 		 669 aa  153  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  34.48 
 
 		 666 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  34.43 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  30.15 
 
 		 651 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  33.62 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  32.65 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3000  phosphate binding protein  29.3 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4582  phosphate binding protein  33.11 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246324  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  31.92 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  31.23 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  33.21 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3298  phosphate binding protein  29.71 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2825  phosphate binding protein  29.71 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.820389  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  28.74 
 
 		 341 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  30.7 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  31.47 
 
 		 692 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  30.09 
 
 		 333 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1024  phosphate binding protein  31.37 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3818  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  31.44 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.389852 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1053  phosphate binding protein  31.37 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216116  hitchhiker  0.000268052 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4125  phosphate binding protein  27.03 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2488  phosphate binding protein  29.66 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0670  phosphate binding protein  29.07 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4906  phosphate binding protein  31.58 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.265302  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0192  phosphate binding protein  30.43 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3334  phosphate binding protein  27.79 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4388  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.51 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4405  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.61 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  28.08 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0495  phosphate binding protein  31.25 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.853772  hitchhiker  0.00177045 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4174  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  26.3 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4496  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  26.3 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4012  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.52 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3447  phosphate binding protein  29.39 
 
 		 328 aa  109  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0848  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.51 
 
 		 305 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4022  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.99 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4352  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.91 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3716  phosphate binding protein  28.62 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.583691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  31.16 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  28.62 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  28.62 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4077  phosphate binding protein  25.95 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.844211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0045  phosphate binding protein  25.14 
 
 		 333 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8362  normal  0.817382 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4292  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.99 
 
 		 305 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000804366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0330  phosphate binding protein  30.89 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0209981  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3610  phosphate binding protein  29.82 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  27.9 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1793  phosphate binding protein  29.43 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1829  phosphate binding protein  28.23 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0286  phosphate binding protein  30.57 
 
 		 315 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  30.46 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  30.28 
 
 		 338 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>