More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2832 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2763  OmpA/MotB domain-containing protein  79.84 
 
 		 499 aa  763    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.621533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2832  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 512 aa  990    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1170  OmpA family protein  96.68 
 
 		 512 aa  850    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0287  OmpA/MotB  45.27 
 
 		 513 aa  375  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791122 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2919  OmpA/MotB  40.86 
 
 		 517 aa  360  3e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  32.6 
 
 		 558 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  28.46 
 
 		 562 aa  141  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  27.06 
 
 		 519 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3568  hypothetical protein  32.56 
 
 		 508 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0417  OmpA/MotB domain protein  28.28 
 
 		 585 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.846597  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  30 
 
 		 482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  29.45 
 
 		 464 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0612  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 		 734 aa  128  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2689  hypothetical protein  30.51 
 
 		 465 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2746  OmpA family protein  27.44 
 
 		 451 aa  126  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3650  OmpA/MotB  28.76 
 
 		 444 aa  123  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2437  OmpA/MotB domain-containing protein  28.8 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28890  periplasmic phosphate binding protein  30.09 
 
 		 428 aa  119  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.938585  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3818  OmpA/MotB domain protein  29 
 
 		 435 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0260085  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1951  OmpA/MotB domain-containing protein  28.44 
 
 		 435 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 435 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0939577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2087  OmpA/MotB domain-containing protein  28.44 
 
 		 435 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2475  OmpA/MotB  25.47 
 
 		 447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.201724  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  25.57 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  26.53 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  27.62 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  24.64 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.44 
 
 		 272 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  27.49 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  23.2 
 
 		 218 aa  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  24.56 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  27.78 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0220  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  20.26 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00000480634  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  27.62 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  26.9 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  27.63 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 273 aa  62.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  26.9 
 
 		 272 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25.99 
 
 		 285 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  26.7 
 
 		 302 aa  62  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  26.37 
 
 		 303 aa  62  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  24.43 
 
 		 277 aa  62  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  25.64 
 
 		 273 aa  62  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  29.77 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  32.03 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  28.41 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1584  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000121386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  26.37 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  23.2 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  31.13 
 
 		 185 aa  59.7  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  26.38 
 
 		 299 aa  60.1  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1350  putative periplasmic phosphate-binding protein  25.68 
 
 		 498 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592696 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  35 
 
 		 229 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0005  extracellular solute-binding protein, family 1  26.42 
 
 		 291 aa  59.7  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2212  putative phosphate ABC transporter  26.57 
 
 		 255 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  31.52 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3528  phosphate-binding protein  28.26 
 
 		 261 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  30.08 
 
 		 195 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  32.71 
 
 		 236 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1147  phosphate binding protein  27.32 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  21.22 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  24.4 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  25.7 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  23.6 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  29.11 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  34.95 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  32.5 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  28.76 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  36.63 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  39.8 
 
 		 221 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  23.96 
 
 		 287 aa  57  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  39.8 
 
 		 221 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  39.8 
 
 		 221 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  33.01 
 
 		 233 aa  57  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  24.88 
 
 		 284 aa  57  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  30.5 
 
 		 212 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  33.02 
 
 		 440 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  32.11 
 
 		 890 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  33.72 
 
 		 237 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 240 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  35.58 
 
 		 364 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  25.71 
 
 		 276 aa  56.6  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  34.58 
 
 		 320 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  33.72 
 
 		 237 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  33.01 
 
 		 445 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  29.25 
 
 		 219 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0603  OmpA family protein  32.41 
 
 		 207 aa  55.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  29.25 
 
 		 219 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0716  OmpA/MotB domain-containing protein  41.33 
 
 		 226 aa  56.2  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  32.43 
 
 		 217 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  31.86 
 
 		 227 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1467  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 		 560 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.459953  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.78 
 
 		 220 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  36.15 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  29.25 
 
 		 219 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.97 
 
 		 278 aa  55.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  29.25 
 
 		 219 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  29.25 
 
 		 219 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  21.77 
 
 		 272 aa  55.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>