More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2763 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1170  OmpA family protein  81.45 
 
 		 512 aa  711    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2832  OmpA/MotB domain-containing protein  79.84 
 
 		 512 aa  748    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2763  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 499 aa  975    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.621533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0287  OmpA/MotB  45.42 
 
 		 513 aa  382  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791122 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2919  OmpA/MotB  39.33 
 
 		 517 aa  342  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  32.24 
 
 		 558 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3568  hypothetical protein  30.75 
 
 		 508 aa  153  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  27.19 
 
 		 482 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  30.79 
 
 		 464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2746  OmpA family protein  30.12 
 
 		 451 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  27.71 
 
 		 519 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28890  periplasmic phosphate binding protein  31.58 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.938585  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  29.71 
 
 		 562 aa  137  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2689  hypothetical protein  33.23 
 
 		 465 aa  136  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2475  OmpA/MotB  27.55 
 
 		 447 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.201724  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3650  OmpA/MotB  30.82 
 
 		 444 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0612  serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 		 734 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3818  OmpA/MotB domain protein  28.73 
 
 		 435 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0260085  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2437  OmpA/MotB domain-containing protein  28.34 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0417  OmpA/MotB domain protein  26.78 
 
 		 585 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.846597  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1951  OmpA/MotB domain-containing protein  30.12 
 
 		 435 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2087  OmpA/MotB domain-containing protein  28.83 
 
 		 435 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  27.6 
 
 		 435 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0939577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  27.17 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 273 aa  72  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  26.29 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  33.08 
 
 		 233 aa  66.6  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  33.96 
 
 		 185 aa  65.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  25.35 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  25.97 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  26.37 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1350  putative periplasmic phosphate-binding protein  25.91 
 
 		 498 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592696 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  24.88 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  39.02 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  24.88 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  24.73 
 
 		 269 aa  63.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  34.58 
 
 		 707 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  22.99 
 
 		 272 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  22.41 
 
 		 218 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  23.63 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  37.21 
 
 		 237 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  25.99 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2703  OmpA domain-containing protein  35 
 
 		 560 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.74535  normal  0.0183644 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  22.99 
 
 		 281 aa  62  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  37.21 
 
 		 237 aa  62  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  28.65 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  37.08 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  35.92 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  22.94 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0220  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  21.98 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00000480634  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  24.31 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  31.62 
 
 		 631 aa  60.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  33.01 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1584  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000121386  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  35.37 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  32.67 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  26.37 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  30.91 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  34.19 
 
 		 223 aa  59.7  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  30.63 
 
 		 271 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  30.63 
 
 		 271 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  38.1 
 
 		 212 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  33.04 
 
 		 270 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1467  OmpA/MotB domain-containing protein  34 
 
 		 560 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.459953  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  26.52 
 
 		 270 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1355  OmpA domain-containing protein  34 
 
 		 560 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  30.38 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  32.14 
 
 		 270 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3528  phosphate-binding protein  27.78 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  36.56 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  32.14 
 
 		 270 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  41.43 
 
 		 214 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  23.3 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  33.63 
 
 		 587 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  33.03 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  25.28 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 223 aa  58.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  34.95 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  39.02 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  33.33 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  30.63 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  39.74 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  39.74 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  28.18 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  39.74 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0716  OmpA/MotB domain-containing protein  39.76 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  40.28 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  40.28 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  42.67 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  40.28 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  40.28 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  40.28 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  36.25 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  30.69 
 
 		 890 aa  57.4  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  31.07 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  38.89 
 
 		 219 aa  57  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>