More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1350 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1350  putative periplasmic phosphate-binding protein  100 
 
 		 498 aa  1022    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4738  hypothetical protein  48.47 
 
 		 471 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3906  hypothetical protein  40 
 
 		 501 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3709  hypothetical protein  38.22 
 
 		 501 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.447391 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0285  hypothetical protein  48.14 
 
 		 505 aa  306  7e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03232  hypothetical protein  39.95 
 
 		 501 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3626  hypothetical protein  48.3 
 
 		 371 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3795  putative periplasmic phosphate-binding protein  51.85 
 
 		 486 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0718968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3898  putative periplasmic phosphate-binding protein  51.85 
 
 		 498 aa  300  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal  0.815113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3729  putative periplasmic phosphate-binding protein  51.85 
 
 		 486 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3376  putative periplasmic phosphate-binding protein  44.67 
 
 		 335 aa  283  5.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000120195  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3836  putative periplasmic phosphate-binding protein  53.21 
 
 		 280 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3377  putative periplasmic phosphate-binding protein  43.77 
 
 		 326 aa  278  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000468434  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03279  hypothetical protein  46.85 
 
 		 330 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.720807  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03231  hypothetical protein  46.85 
 
 		 330 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4737  hypothetical protein  46.85 
 
 		 330 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0286  hypothetical protein  46.85 
 
 		 330 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3625  hypothetical protein  46.85 
 
 		 330 aa  253  6e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3708  hypothetical protein  46.85 
 
 		 330 aa  249  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371578 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1068  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  35.32 
 
 		 835 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0358436  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0889  hypothetical protein  29.31 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.181137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1989  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  34.08 
 
 		 630 aa  160  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000844376  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3721  putative periplasmic phosphate-binding protein  55.46 
 
 		 124 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.449275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3812  hypothetical membrane protein  55.56 
 
 		 106 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0121  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  28.91 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  30.35 
 
 		 272 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  31.23 
 
 		 271 aa  117  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  31.47 
 
 		 301 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  29.64 
 
 		 298 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  30.37 
 
 		 274 aa  111  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  28.46 
 
 		 278 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  29.41 
 
 		 296 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  27.57 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  29.91 
 
 		 268 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  27.45 
 
 		 287 aa  106  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  29.53 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  26.88 
 
 		 271 aa  103  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  27.67 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.43 
 
 		 278 aa  102  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0681  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  26.77 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.77 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.77 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0278418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  29.35 
 
 		 299 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0844  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.35 
 
 		 299 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0770  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.35 
 
 		 299 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000063317 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0715  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  29.35 
 
 		 299 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0631  phosphate binding protein  30.68 
 
 		 304 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0750  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.38 
 
 		 300 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  33.33 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  26.48 
 
 		 276 aa  100  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  29.73 
 
 		 279 aa  100  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  27.69 
 
 		 270 aa  100  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  27.27 
 
 		 272 aa  100  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4587  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.98 
 
 		 300 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.668295 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  25.88 
 
 		 281 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  29.44 
 
 		 281 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.35 
 
 		 285 aa  99  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2467  phosphate transport system substrate-binding protein  26.84 
 
 		 292 aa  98.2  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  26.62 
 
 		 284 aa  98.2  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  29.69 
 
 		 272 aa  98.2  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  28.52 
 
 		 283 aa  97.4  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  31.89 
 
 		 284 aa  96.7  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  31.15 
 
 		 272 aa  96.7  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  31.72 
 
 		 281 aa  96.7  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  25.59 
 
 		 273 aa  96.7  9e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  31.96 
 
 		 280 aa  96.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  26.27 
 
 		 281 aa  96.3  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0603  phosphate binding protein  28.89 
 
 		 306 aa  96.3  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1647  phosphate transport system substrate-binding protein  32.62 
 
 		 276 aa  94.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  29.9 
 
 		 272 aa  94.4  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  27.38 
 
 		 264 aa  93.6  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  27.98 
 
 		 270 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.61 
 
 		 272 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  32.11 
 
 		 303 aa  92.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  30.36 
 
 		 274 aa  92.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  32.41 
 
 		 285 aa  91.7  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  26.97 
 
 		 273 aa  91.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  27.32 
 
 		 332 aa  90.9  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  29.67 
 
 		 218 aa  90.9  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  30.11 
 
 		 299 aa  91.3  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  29.57 
 
 		 278 aa  90.9  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  25.29 
 
 		 282 aa  90.5  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  27.63 
 
 		 292 aa  90.1  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.44 
 
 		 276 aa  90.1  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  29.41 
 
 		 330 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  28.8 
 
 		 279 aa  89.7  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  28.84 
 
 		 272 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  28.41 
 
 		 303 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  28.84 
 
 		 272 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0555  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  29.82 
 
 		 288 aa  88.2  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000309892  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  28.02 
 
 		 292 aa  87.8  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  28.84 
 
 		 272 aa  87.4  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  29.2 
 
 		 276 aa  87.4  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0128  phosphate binding protein  25.37 
 
 		 307 aa  87.4  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  27.03 
 
 		 294 aa  87  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  29.51 
 
 		 277 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  29.95 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  27.81 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  27.03 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0556  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  29.12 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00147571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>