268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1647 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1647  phosphate transport system substrate-binding protein  100 
 
 
276 aa  559  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3331  extracellular solute-binding protein, family 1  34.94 
 
 
265 aa  142  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2484  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0152963  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  32.34 
 
 
278 aa  139  7e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  33.47 
 
 
272 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2467  phosphate transport system substrate-binding protein  32.52 
 
 
292 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  34.29 
 
 
279 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  30.6 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  32.48 
 
 
284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  30.16 
 
 
283 aa  119  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  28.28 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.3 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  31.02 
 
 
287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  28.1 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  26.64 
 
 
273 aa  113  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2771  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  29.29 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  31.05 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  28.8 
 
 
381 aa  112  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  27.86 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  26.32 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  31.91 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  30.82 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  28.21 
 
 
272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  29.24 
 
 
270 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  29.15 
 
 
267 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
273 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  29.96 
 
 
272 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  29.17 
 
 
271 aa  107  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.58 
 
 
276 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  29.28 
 
 
218 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  29.93 
 
 
271 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  26.5 
 
 
288 aa  106  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  27.68 
 
 
273 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  25.57 
 
 
269 aa  105  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  26.59 
 
 
272 aa  105  6e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  30.3 
 
 
281 aa  105  9e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  30.17 
 
 
276 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  30.5 
 
 
280 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  29.07 
 
 
301 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  28.93 
 
 
264 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  26.88 
 
 
285 aa  103  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  26.62 
 
 
299 aa  102  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  30.68 
 
 
271 aa  102  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  26.12 
 
 
279 aa  102  6e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  29.22 
 
 
284 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  27.41 
 
 
273 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3451  extracellular solute-binding protein, family 1  27.71 
 
 
245 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  28.4 
 
 
298 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  25.65 
 
 
270 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  30.65 
 
 
292 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  26.8 
 
 
296 aa  99  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  27.64 
 
 
278 aa  99  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  24.92 
 
 
282 aa  99  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4738  hypothetical protein  33.52 
 
 
471 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  27.95 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  26.74 
 
 
281 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  29.87 
 
 
303 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0750  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.81 
 
 
300 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4587  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.81 
 
 
300 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.668295 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  26.8 
 
 
281 aa  96.3  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3709  hypothetical protein  29.34 
 
 
501 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.447391 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3898  putative periplasmic phosphate-binding protein  32.2 
 
 
498 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal  0.815113 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3836  putative periplasmic phosphate-binding protein  32.2 
 
 
280 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0285  hypothetical protein  31.64 
 
 
505 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  30.18 
 
 
274 aa  96.3  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03232  hypothetical protein  32.77 
 
 
501 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  27.9 
 
 
290 aa  95.9  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3626  hypothetical protein  31.64 
 
 
371 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  25.31 
 
 
281 aa  95.9  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  29.85 
 
 
281 aa  95.5  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  27.24 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1350  putative periplasmic phosphate-binding protein  32.62 
 
 
498 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592696 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3795  putative periplasmic phosphate-binding protein  31.64 
 
 
486 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0718968  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3729  putative periplasmic phosphate-binding protein  31.64 
 
 
486 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  29.08 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.59 
 
 
278 aa  94.7  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  26.87 
 
 
272 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  27.42 
 
 
286 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3906  hypothetical protein  31.64 
 
 
501 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0681  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25.81 
 
 
308 aa  92.4  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.81 
 
 
308 aa  92.4  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.81 
 
 
308 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0278418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0631  phosphate binding protein  25.4 
 
 
304 aa  92.8  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  28.68 
 
 
278 aa  92.8  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  25.2 
 
 
299 aa  92  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0715  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25.2 
 
 
299 aa  92.4  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0844  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.2 
 
 
299 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  29.05 
 
 
294 aa  92.4  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0770  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.2 
 
 
299 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000063317 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03279  hypothetical protein  28.72 
 
 
330 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.720807  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03231  hypothetical protein  28.72 
 
 
330 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  26.69 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3708  hypothetical protein  29.26 
 
 
330 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.371578 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4737  hypothetical protein  28.72 
 
 
330 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0286  hypothetical protein  28.72 
 
 
330 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2295  phosphate-binding protein  26.84 
 
 
304 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  29.06 
 
 
328 aa  90.9  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0781  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
281 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  26.94 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  33.33 
 
 
309 aa  90.5  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>