122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3812 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3812  hypothetical membrane protein  100 
 
 		 106 aa  219  9e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843933  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3906  hypothetical protein  96.19 
 
 		 501 aa  211  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3709  hypothetical protein  95.24 
 
 		 501 aa  210  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.447391 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03232  hypothetical protein  91.43 
 
 		 501 aa  202  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3626  hypothetical protein  91.43 
 
 		 371 aa  202  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0285  hypothetical protein  91.43 
 
 		 505 aa  202  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4738  hypothetical protein  90.48 
 
 		 471 aa  201  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3721  putative periplasmic phosphate-binding protein  71.57 
 
 		 124 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.449275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3836  putative periplasmic phosphate-binding protein  70.59 
 
 		 280 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3898  putative periplasmic phosphate-binding protein  70.59 
 
 		 498 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal  0.815113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3795  putative periplasmic phosphate-binding protein  70.59 
 
 		 486 aa  163  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0718968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3729  putative periplasmic phosphate-binding protein  70.59 
 
 		 486 aa  163  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03279  hypothetical protein  63.89 
 
 		 330 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.720807  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03231  hypothetical protein  63.89 
 
 		 330 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0286  hypothetical protein  63.89 
 
 		 330 aa  149  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4737  hypothetical protein  63.89 
 
 		 330 aa  149  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3625  hypothetical protein  62.96 
 
 		 330 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3708  hypothetical protein  66.35 
 
 		 330 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371578 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1350  putative periplasmic phosphate-binding protein  55.56 
 
 		 498 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592696 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3376  putative periplasmic phosphate-binding protein  52.53 
 
 		 335 aa  114  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000120195  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3377  putative periplasmic phosphate-binding protein  47.96 
 
 		 326 aa  107  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000468434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1068  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  41.41 
 
 		 835 aa  88.2  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0358436  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0889  hypothetical protein  41.84 
 
 		 444 aa  75.5  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.181137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1989  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  36 
 
 		 630 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000844376  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  36.05 
 
 		 274 aa  64.3  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  33.33 
 
 		 270 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  36.46 
 
 		 301 aa  60.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  40.3 
 
 		 272 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  40.3 
 
 		 272 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  40.3 
 
 		 272 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  32.99 
 
 		 268 aa  57.8  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  34.41 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  32.94 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  34.88 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1647  phosphate transport system substrate-binding protein  35.11 
 
 		 276 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0128  phosphate binding protein  35.8 
 
 		 307 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2295  phosphate-binding protein  32.14 
 
 		 304 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  37.8 
 
 		 283 aa  53.9  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  32.14 
 
 		 218 aa  52  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  33.82 
 
 		 273 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.03 
 
 		 272 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.73 
 
 		 285 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  33.73 
 
 		 284 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  30.49 
 
 		 281 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  31.71 
 
 		 273 aa  50.8  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  27.71 
 
 		 272 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  32.84 
 
 		 271 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  33.33 
 
 		 278 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.53 
 
 		 278 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  35.82 
 
 		 273 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0121  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  27.27 
 
 		 336 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  27.94 
 
 		 299 aa  50.1  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  29.85 
 
 		 272 aa  50.1  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1147  phosphate binding protein  29.59 
 
 		 263 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  28.71 
 
 		 272 aa  49.7  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  30.59 
 
 		 296 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0376  periplasmic phosphate binding protein  28.28 
 
 		 342 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3451  extracellular solute-binding protein, family 1  29.29 
 
 		 245 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  33.85 
 
 		 299 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0681  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  33.85 
 
 		 308 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.85 
 
 		 308 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.85 
 
 		 308 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0278418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0715  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  33.85 
 
 		 299 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1584  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 		 290 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000121386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0844  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.85 
 
 		 299 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0750  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.85 
 
 		 300 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0770  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.85 
 
 		 299 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000063317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  32.31 
 
 		 298 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  33.78 
 
 		 273 aa  47.8  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4587  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.85 
 
 		 300 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.668295 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  39.71 
 
 		 303 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1605  phosphate ABC transporter (binding protein)-like protein  28.74 
 
 		 284 aa  47  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00137647  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0648  extracellular solute-binding protein, family 1  28.57 
 
 		 275 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117296  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  34.41 
 
 		 309 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  28.12 
 
 		 271 aa  47  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0781  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 		 281 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0555  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  31.76 
 
 		 288 aa  47  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000309892  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  37.93 
 
 		 274 aa  46.2  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  34.04 
 
 		 328 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0631  phosphate binding protein  33.85 
 
 		 304 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  32.56 
 
 		 294 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2913  phosphate binding protein  31.48 
 
 		 311 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  37.93 
 
 		 274 aa  45.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  28.72 
 
 		 282 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  32.22 
 
 		 273 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  33.68 
 
 		 274 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0501  periplasmic phosphate binding protein  31.4 
 
 		 342 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  29.21 
 
 		 279 aa  45.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1966  hemolysin precursor, putative  29.73 
 
 		 293 aa  45.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  28.12 
 
 		 290 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  24.72 
 
 		 276 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2771  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  31.75 
 
 		 274 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2567  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  28.05 
 
 		 307 aa  44.3  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0603  phosphate binding protein  31.46 
 
 		 306 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0661  extracellular solute-binding protein, family 1  25.4 
 
 		 277 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.81727e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3493  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 280 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  27.36 
 
 		 330 aa  43.5  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  28.24 
 
 		 281 aa  43.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  31.58 
 
 		 278 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  27.37 
 
 		 307 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>