More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1605 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1605  phosphate ABC transporter (binding protein)-like protein  100 
 
 		 284 aa  565  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00137647  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2567  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  56.91 
 
 		 307 aa  332  5e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1966  hemolysin precursor, putative  54.08 
 
 		 293 aa  281  8.000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1379  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  50.19 
 
 		 327 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000788807  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  50.38 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  48.51 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  48.89 
 
 		 381 aa  122  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  46.15 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  45.11 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  44.44 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  45.45 
 
 		 283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  42.75 
 
 		 218 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  45.8 
 
 		 270 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  41.18 
 
 		 299 aa  112  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  44.85 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  39.71 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  42.75 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  45.59 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  45.59 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  42.11 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  42.75 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  42.42 
 
 		 307 aa  102  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.57 
 
 		 278 aa  99  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  38.64 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  43.22 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  39.55 
 
 		 274 aa  96.3  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  44.35 
 
 		 270 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  37.88 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  39.26 
 
 		 272 aa  95.5  9e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  44.04 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  41.09 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  40.15 
 
 		 284 aa  93.6  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  37.23 
 
 		 273 aa  93.2  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  44.95 
 
 		 281 aa  92.8  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2840  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  42.45 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  40.52 
 
 		 268 aa  89.7  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  35.77 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  35.07 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  27.05 
 
 		 669 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  40.3 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  39.69 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  43.12 
 
 		 281 aa  86.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  42.2 
 
 		 281 aa  86.3  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  41.74 
 
 		 285 aa  85.9  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0128  phosphate binding protein  35.66 
 
 		 307 aa  85.9  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3528  phosphate-binding protein  41.67 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  36.84 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  27.4 
 
 		 666 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  32.09 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  39.45 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  37.78 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  35 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  38.46 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  35.34 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  37.93 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  36.36 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  38.14 
 
 		 272 aa  82  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  41.59 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13780  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  40.48 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0228402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  28.52 
 
 		 651 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  36.84 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2295  phosphate-binding protein  34.06 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  37.14 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  38.58 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  25.55 
 
 		 692 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  37.04 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5237  phosphate binding protein  38.1 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184797  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5376  phosphate binding protein  38.1 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572014 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  35.96 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  36.75 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  35.96 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  33.91 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  41.11 
 
 		 562 aa  76.3  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  32.46 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0612  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 734 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  44.94 
 
 		 482 aa  75.9  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  38.98 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5329  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  37.3 
 
 		 332 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0861464  hitchhiker  0.00379996 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  34.48 
 
 		 272 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  36.84 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  35.4 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  34.35 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0145  phosphate binding protein  35.71 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.528128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  33.91 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  34.33 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  34.33 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  29.82 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  34.94 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5615  phosphate binding protein  34.92 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426736  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  33.33 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  37.78 
 
 		 558 aa  72.8  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  29.1 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  39.78 
 
 		 519 aa  72.4  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03438  putative phosphate ABC transporter  29.68 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1147  phosphate binding protein  32.76 
 
 		 263 aa  72  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5487  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  35.71 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  40.5 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  35.4 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70860  hypothetical protein  32.54 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.60906 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  28.24 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>