290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03438 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03438  putative phosphate ABC transporter  100 
 
 		 316 aa  649    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1076  phosphate-binding protein  54.42 
 
 		 323 aa  338  8e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000178631  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1366  phosphate binding protein  53.15 
 
 		 323 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00814513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1405  phosphate binding protein  53.15 
 
 		 323 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000717575  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2979  phosphate binding protein  53.15 
 
 		 323 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0450601  normal  0.0144524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1380  phosphate binding protein  53.15 
 
 		 323 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000270515  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2553  phosphate binding protein  53.85 
 
 		 323 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177722  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1210  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  52.74 
 
 		 319 aa  335  5e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2775  phosphate binding protein  52.23 
 
 		 323 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000207455  decreased coverage  0.000220712 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2707  phosphate binding protein  52.23 
 
 		 323 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000109138  hitchhiker  0.00000175354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2877  phosphate binding protein  52.23 
 
 		 323 aa  333  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027974  hitchhiker  0.000116468 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2747  phosphate binding protein  52.8 
 
 		 323 aa  333  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000097067  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  52.45 
 
 		 323 aa  331  8e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  51.89 
 
 		 323 aa  330  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0096  phosphate binding protein  52.74 
 
 		 321 aa  330  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1560  phosphate-binding protein  51.55 
 
 		 323 aa  329  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0179  phosphate binding protein  52.58 
 
 		 322 aa  328  8e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2766  phosphate binding protein  52.1 
 
 		 323 aa  328  8e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366631  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0957  phosphate binding protein  52.4 
 
 		 324 aa  322  7e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.086307  normal  0.163139 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  51.05 
 
 		 323 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70860  hypothetical protein  52.82 
 
 		 323 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.60906 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2455  hypothetical protein  52.78 
 
 		 329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3450  phosphate binding protein  50.7 
 
 		 323 aa  320  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00138297  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5041  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  53.21 
 
 		 332 aa  319  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6148  hypothetical protein  52.46 
 
 		 323 aa  319  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5237  phosphate binding protein  52.63 
 
 		 332 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184797  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5329  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  52.28 
 
 		 332 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0861464  hitchhiker  0.00379996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5487  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  52.5 
 
 		 332 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2399  phosphate binding protein  53.17 
 
 		 332 aa  317  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.427135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5615  phosphate binding protein  50.87 
 
 		 333 aa  317  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426736  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5376  phosphate binding protein  52.63 
 
 		 332 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0145  phosphate binding protein  51.93 
 
 		 332 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.528128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4417  phosphate binding protein  51.72 
 
 		 322 aa  315  7e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3157  phosphate binding protein  52.2 
 
 		 321 aa  315  7e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2653  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  52.08 
 
 		 323 aa  314  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1113  phosphate binding protein  52.86 
 
 		 319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847548 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0544  phosphate binding protein  51.86 
 
 		 322 aa  312  4.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0618  phosphate binding protein  47.94 
 
 		 321 aa  309  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0255  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  52.5 
 
 		 325 aa  308  5.9999999999999995e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01028  hypothetical protein  50.71 
 
 		 321 aa  305  7e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004383  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  50.35 
 
 		 319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48600  Phosphate-binding protein PstS  52.58 
 
 		 322 aa  304  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1010  phosphate binding protein  50.36 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3300  phosphate binding protein  49.64 
 
 		 312 aa  286  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0655  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  47.02 
 
 		 333 aa  278  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.952816  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1306  phosphate binding protein  47.93 
 
 		 320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.259605 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3104  phosphate binding protein  50 
 
 		 324 aa  269  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3274  phosphate binding protein  48.58 
 
 		 354 aa  269  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3284  phosphate binding protein  48.23 
 
 		 354 aa  266  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0271757 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3134  phosphate-binding protein  48.23 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2913  phosphate binding protein  49.11 
 
 		 311 aa  260  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1043  phosphate binding protein  49.65 
 
 		 312 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3268  phosphate binding protein  45.23 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.889504  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  31.18 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  33.58 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  32.49 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  30.42 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  30.42 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  30.42 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  32.59 
 
 		 285 aa  119  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  30.32 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  31.16 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  29.28 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  32.61 
 
 		 273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  31.06 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  31.72 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  31.54 
 
 		 274 aa  109  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  30.97 
 
 		 274 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  31.91 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  31.15 
 
 		 274 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  29.89 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  33.47 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  30 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  31.62 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  29.74 
 
 		 332 aa  106  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  31.16 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  28.36 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  32.95 
 
 		 482 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  28.19 
 
 		 273 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  30.05 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  29.15 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.38 
 
 		 272 aa  99  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 273 aa  99  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  28.23 
 
 		 272 aa  99  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  31.4 
 
 		 562 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  27.92 
 
 		 269 aa  96.3  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  27.9 
 
 		 281 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  27.84 
 
 		 381 aa  93.6  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.04 
 
 		 276 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  27.57 
 
 		 218 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  27.8 
 
 		 281 aa  92.8  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  30.17 
 
 		 302 aa  92.4  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.8 
 
 		 278 aa  92.4  9e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  27.9 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  27.21 
 
 		 269 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  28.68 
 
 		 276 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  29.03 
 
 		 273 aa  89.7  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  28.52 
 
 		 270 aa  89.7  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  25.84 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0612  serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 		 734 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>