More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5487 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5487  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  100 
 
 		 332 aa  676    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5041  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  94.58 
 
 		 332 aa  643    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5329  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  86.14 
 
 		 332 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0861464  hitchhiker  0.00379996 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5237  phosphate binding protein  86.14 
 
 		 332 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184797  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0145  phosphate binding protein  85.54 
 
 		 332 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.528128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5376  phosphate binding protein  85.24 
 
 		 332 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5615  phosphate binding protein  83.02 
 
 		 333 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426736  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6148  hypothetical protein  80.19 
 
 		 323 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70860  hypothetical protein  80.5 
 
 		 323 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.60906 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0179  phosphate binding protein  77.4 
 
 		 322 aa  510  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48600  Phosphate-binding protein PstS  78.64 
 
 		 322 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4417  phosphate binding protein  70.19 
 
 		 322 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1560  phosphate-binding protein  68.21 
 
 		 323 aa  463  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2747  phosphate binding protein  66.36 
 
 		 323 aa  455  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000097067  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2707  phosphate binding protein  67.28 
 
 		 323 aa  455  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000109138  hitchhiker  0.00000175354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2877  phosphate binding protein  67.28 
 
 		 323 aa  455  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027974  hitchhiker  0.000116468 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1380  phosphate binding protein  66.05 
 
 		 323 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000270515  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1405  phosphate binding protein  66.05 
 
 		 323 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000717575  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  66.98 
 
 		 323 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2775  phosphate binding protein  66.98 
 
 		 323 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000207455  decreased coverage  0.000220712 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2979  phosphate binding protein  66.05 
 
 		 323 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0450601  normal  0.0144524 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1366  phosphate binding protein  66.05 
 
 		 323 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00814513  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1076  phosphate-binding protein  67.9 
 
 		 323 aa  448  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000178631  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3450  phosphate binding protein  64.51 
 
 		 323 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00138297  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  64.51 
 
 		 323 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2766  phosphate binding protein  64.51 
 
 		 323 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366631  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2553  phosphate binding protein  64.51 
 
 		 323 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177722  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2399  phosphate binding protein  69 
 
 		 332 aa  437  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.427135  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1210  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  66.89 
 
 		 319 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  62.65 
 
 		 323 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0544  phosphate binding protein  68.57 
 
 		 322 aa  427  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2653  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  59.88 
 
 		 323 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0957  phosphate binding protein  61.13 
 
 		 324 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.086307  normal  0.163139 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0255  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  55.28 
 
 		 325 aa  391  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3157  phosphate binding protein  60 
 
 		 321 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1113  phosphate binding protein  57.72 
 
 		 319 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847548 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01028  hypothetical protein  54.89 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2455  hypothetical protein  58.67 
 
 		 329 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004383  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  54.4 
 
 		 319 aa  368  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0618  phosphate binding protein  57.81 
 
 		 321 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0096  phosphate binding protein  55.42 
 
 		 321 aa  367  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0655  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  61.49 
 
 		 333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.952816  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3274  phosphate binding protein  60 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1306  phosphate binding protein  57.77 
 
 		 320 aa  345  6e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.259605 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3134  phosphate-binding protein  59.3 
 
 		 348 aa  343  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3284  phosphate binding protein  59.3 
 
 		 354 aa  343  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0271757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1043  phosphate binding protein  61.19 
 
 		 312 aa  331  9e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1010  phosphate binding protein  53.33 
 
 		 312 aa  326  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3300  phosphate binding protein  52.63 
 
 		 312 aa  323  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03438  putative phosphate ABC transporter  52.5 
 
 		 316 aa  317  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3104  phosphate binding protein  55.79 
 
 		 324 aa  315  5e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2913  phosphate binding protein  55.44 
 
 		 311 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3268  phosphate binding protein  48.72 
 
 		 330 aa  276  5e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.889504  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  35.74 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  32.99 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  32.44 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  32.95 
 
 		 278 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  33.71 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  33.95 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  30.69 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  32.7 
 
 		 272 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  32.7 
 
 		 272 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  32.7 
 
 		 272 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  31.72 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  30.15 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  30.92 
 
 		 284 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  29 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  31.02 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  32.12 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  28.79 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  29.28 
 
 		 273 aa  112  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0047  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  27.24 
 
 		 269 aa  113  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  32.2 
 
 		 302 aa  112  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  31.37 
 
 		 272 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  28.68 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.45 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  31.18 
 
 		 381 aa  109  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  29.17 
 
 		 285 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  31.18 
 
 		 267 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  31.34 
 
 		 281 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  31.18 
 
 		 281 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  29.39 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  31.16 
 
 		 299 aa  105  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  30.3 
 
 		 281 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3266  phosphate-binding protein  27.11 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  31.56 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.5 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.68 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  29.43 
 
 		 271 aa  102  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3650  OmpA/MotB  33.47 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  29.71 
 
 		 273 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  31.44 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  29.39 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  31.14 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  29.67 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1479  phosphate binding protein  28.22 
 
 		 327 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.991618  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1450  phosphate binding protein  28.22 
 
 		 327 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467901  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  25.36 
 
 		 273 aa  99.4  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  29.39 
 
 		 264 aa  99  9e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  29.67 
 
 		 287 aa  99  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>