192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0047 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0047  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 269 aa  544  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2553  phosphate binding protein  25.08 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177722  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2766  phosphate binding protein  25.97 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366631  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1210  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  26.64 
 
 		 319 aa  115  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5487  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  27.24 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  24.92 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2747  phosphate binding protein  25.08 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000097067  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3450  phosphate binding protein  24.14 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00138297  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5041  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  26.11 
 
 		 332 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5237  phosphate binding protein  25.93 
 
 		 332 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184797  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1560  phosphate-binding protein  23.7 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0179  phosphate binding protein  25.68 
 
 		 322 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  24.68 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3157  phosphate binding protein  25.58 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1076  phosphate-binding protein  24.76 
 
 		 323 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000178631  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0618  phosphate binding protein  25.32 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2653  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  26.92 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5329  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25.25 
 
 		 332 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0861464  hitchhiker  0.00379996 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3274  phosphate binding protein  26.92 
 
 		 354 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2707  phosphate binding protein  23.05 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000109138  hitchhiker  0.00000175354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2877  phosphate binding protein  23.05 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027974  hitchhiker  0.000116468 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0096  phosphate binding protein  25.68 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3284  phosphate binding protein  26.92 
 
 		 354 aa  105  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0271757 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4417  phosphate binding protein  25.42 
 
 		 322 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3134  phosphate-binding protein  26.92 
 
 		 348 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5615  phosphate binding protein  25.59 
 
 		 333 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426736  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2775  phosphate binding protein  22.73 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000207455  decreased coverage  0.000220712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0145  phosphate binding protein  24.92 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.528128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2979  phosphate binding protein  22.4 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0450601  normal  0.0144524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1380  phosphate binding protein  22.4 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000270515  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  23.55 
 
 		 323 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1405  phosphate binding protein  22.4 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000717575  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1366  phosphate binding protein  22.4 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00814513  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5376  phosphate binding protein  24.58 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6148  hypothetical protein  24.16 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70860  hypothetical protein  24.16 
 
 		 323 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.60906 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1010  phosphate binding protein  28.28 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2455  hypothetical protein  24.92 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004383  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  25.16 
 
 		 319 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48600  Phosphate-binding protein PstS  25.68 
 
 		 322 aa  99.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0544  phosphate binding protein  24.6 
 
 		 322 aa  98.2  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3300  phosphate binding protein  27.21 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1113  phosphate binding protein  24.07 
 
 		 319 aa  95.5  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847548 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0957  phosphate binding protein  24.5 
 
 		 324 aa  95.9  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.086307  normal  0.163139 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2913  phosphate binding protein  26.9 
 
 		 311 aa  94.7  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2399  phosphate binding protein  25.4 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.427135  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3104  phosphate binding protein  25.52 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1043  phosphate binding protein  27.59 
 
 		 312 aa  93.2  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0255  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  23.18 
 
 		 325 aa  90.9  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01028  hypothetical protein  24.27 
 
 		 321 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  33.33 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1306  phosphate binding protein  23.1 
 
 		 320 aa  89  8e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.259605 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0655  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.46 
 
 		 333 aa  88.6  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.952816  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03438  putative phosphate ABC transporter  24.28 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3268  phosphate binding protein  28.99 
 
 		 330 aa  82  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.889504  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  29.17 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  29.71 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  26.32 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  28.33 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  28.63 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  26.92 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  30.9 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  26.86 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1402  hypothetical protein  28.08 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.728708 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  27.87 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.58 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  25.86 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  26.9 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  23.73 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  24.17 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  25.71 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  24.16 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  23.87 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  26.56 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  24.43 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  25.82 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  22.51 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  24.38 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  25.82 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  24.31 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  21.86 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  25.37 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  24.71 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  25.82 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0612  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 734 aa  62.4  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  24.27 
 
 		 330 aa  62  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  21.76 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  29.5 
 
 		 558 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  23.08 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.95 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25.15 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  25.52 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2689  hypothetical protein  31.25 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2212  putative phosphate ABC transporter  29.41 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  25.14 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1966  hemolysin precursor, putative  31.34 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  28.04 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4492  phosphate binding protein  29.21 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.89285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  30.11 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.19 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>