More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3134 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3134  phosphate-binding protein  100 
 
 		 348 aa  705    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3284  phosphate binding protein  98.31 
 
 		 354 aa  680    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0271757 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3274  phosphate binding protein  97.74 
 
 		 354 aa  677    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3300  phosphate binding protein  68.88 
 
 		 312 aa  413  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1010  phosphate binding protein  68.53 
 
 		 312 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1043  phosphate binding protein  75.35 
 
 		 312 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3104  phosphate binding protein  68.64 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2913  phosphate binding protein  68.77 
 
 		 311 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1210  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  60.92 
 
 		 319 aa  371  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6148  hypothetical protein  58.39 
 
 		 323 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70860  hypothetical protein  58.39 
 
 		 323 aa  362  8e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.60906 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1560  phosphate-binding protein  53.94 
 
 		 323 aa  359  4e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5615  phosphate binding protein  56.71 
 
 		 333 aa  359  5e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426736  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0179  phosphate binding protein  57.04 
 
 		 322 aa  358  7e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2707  phosphate binding protein  54.57 
 
 		 323 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000109138  hitchhiker  0.00000175354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2877  phosphate binding protein  54.57 
 
 		 323 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027974  hitchhiker  0.000116468 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1366  phosphate binding protein  53.94 
 
 		 323 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00814513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2979  phosphate binding protein  53.94 
 
 		 323 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0450601  normal  0.0144524 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1405  phosphate binding protein  53.94 
 
 		 323 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000717575  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1380  phosphate binding protein  53.94 
 
 		 323 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000270515  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5237  phosphate binding protein  57.38 
 
 		 332 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184797  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2775  phosphate binding protein  54.26 
 
 		 323 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000207455  decreased coverage  0.000220712 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5329  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  57.38 
 
 		 332 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0861464  hitchhiker  0.00379996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5487  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  59.3 
 
 		 332 aa  355  5e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2766  phosphate binding protein  55.22 
 
 		 323 aa  354  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5376  phosphate binding protein  57.24 
 
 		 332 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572014 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  57.39 
 
 		 323 aa  353  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0145  phosphate binding protein  56.9 
 
 		 332 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.528128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5041  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  56.03 
 
 		 332 aa  352  8e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  58.67 
 
 		 323 aa  348  7e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4417  phosphate binding protein  57.99 
 
 		 322 aa  346  3e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2747  phosphate binding protein  54.61 
 
 		 323 aa  347  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000097067  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3450  phosphate binding protein  53.95 
 
 		 323 aa  346  4e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00138297  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1076  phosphate-binding protein  57.82 
 
 		 323 aa  343  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000178631  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2553  phosphate binding protein  56.36 
 
 		 323 aa  341  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177722  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  56 
 
 		 323 aa  340  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2399  phosphate binding protein  54.83 
 
 		 332 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.427135  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48600  Phosphate-binding protein PstS  56.69 
 
 		 322 aa  335  9e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2455  hypothetical protein  58.15 
 
 		 329 aa  330  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0957  phosphate binding protein  54.23 
 
 		 324 aa  325  5e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.086307  normal  0.163139 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0544  phosphate binding protein  56.43 
 
 		 322 aa  322  7e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004383  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  49.68 
 
 		 319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01028  hypothetical protein  47.48 
 
 		 321 aa  320  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0255  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  55.93 
 
 		 325 aa  318  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0096  phosphate binding protein  50.7 
 
 		 321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3157  phosphate binding protein  52.78 
 
 		 321 aa  306  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1113  phosphate binding protein  49.83 
 
 		 319 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847548 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0618  phosphate binding protein  48.45 
 
 		 321 aa  298  6e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2653  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  50.53 
 
 		 323 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3268  phosphate binding protein  48.78 
 
 		 330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.889504  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1306  phosphate binding protein  46.54 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.259605 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0655  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  48.45 
 
 		 333 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.952816  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03438  putative phosphate ABC transporter  48.23 
 
 		 316 aa  280  4e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  35.5 
 
 		 270 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  36.47 
 
 		 272 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  36.47 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  36.47 
 
 		 272 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  31.3 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  33.58 
 
 		 284 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  32.4 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  31.6 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  30.38 
 
 		 274 aa  116  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  29.63 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  32.06 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  30.94 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  31.5 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  30.34 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  29.55 
 
 		 284 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  31.03 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  31.37 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  30.37 
 
 		 332 aa  105  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0047  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  26.92 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  28.57 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  28.84 
 
 		 302 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  28.57 
 
 		 285 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  26.67 
 
 		 273 aa  102  8e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  31.18 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  28.47 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  29.85 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  26.97 
 
 		 273 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.65 
 
 		 272 aa  99.8  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  29.41 
 
 		 272 aa  99.4  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  27.82 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  26.82 
 
 		 274 aa  99  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  30.42 
 
 		 281 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  29.82 
 
 		 273 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  30.67 
 
 		 558 aa  97.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0612  serine/threonine protein kinase  29.84 
 
 		 734 aa  97.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  26.84 
 
 		 278 aa  97.4  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  26.97 
 
 		 337 aa  96.7  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  30.99 
 
 		 337 aa  96.3  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  26.64 
 
 		 272 aa  96.3  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  28.24 
 
 		 267 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  27.7 
 
 		 278 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  28.89 
 
 		 280 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  27.87 
 
 		 218 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  29.12 
 
 		 272 aa  94  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2437  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 		 460 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  28.01 
 
 		 278 aa  92.4  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  28.26 
 
 		 299 aa  92.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>