More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5376 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5329  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  98.49 
 
 		 332 aa  663    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0861464  hitchhiker  0.00379996 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5237  phosphate binding protein  98.8 
 
 		 332 aa  665    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184797  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5376  phosphate binding protein  100 
 
 		 332 aa  673    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0145  phosphate binding protein  97.29 
 
 		 332 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.528128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5487  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  85.24 
 
 		 332 aa  580  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5041  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  85.54 
 
 		 332 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5615  phosphate binding protein  88.89 
 
 		 333 aa  577  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426736  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6148  hypothetical protein  85.76 
 
 		 323 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70860  hypothetical protein  86.07 
 
 		 323 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.60906 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0179  phosphate binding protein  79.57 
 
 		 322 aa  519  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48600  Phosphate-binding protein PstS  82.66 
 
 		 322 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1560  phosphate-binding protein  72.76 
 
 		 323 aa  487  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4417  phosphate binding protein  72.36 
 
 		 322 aa  478  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2707  phosphate binding protein  71.52 
 
 		 323 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000109138  hitchhiker  0.00000175354 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2775  phosphate binding protein  71.21 
 
 		 323 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000207455  decreased coverage  0.000220712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2877  phosphate binding protein  71.52 
 
 		 323 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027974  hitchhiker  0.000116468 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1366  phosphate binding protein  70.28 
 
 		 323 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00814513  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2747  phosphate binding protein  69.97 
 
 		 323 aa  472  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000097067  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1380  phosphate binding protein  70.28 
 
 		 323 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000270515  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2766  phosphate binding protein  69.35 
 
 		 323 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366631  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  70.9 
 
 		 323 aa  472  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2979  phosphate binding protein  70.28 
 
 		 323 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0450601  normal  0.0144524 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1405  phosphate binding protein  70.28 
 
 		 323 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000717575  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1076  phosphate-binding protein  71.83 
 
 		 323 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000178631  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3450  phosphate binding protein  67.8 
 
 		 323 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00138297  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2553  phosphate binding protein  68.42 
 
 		 323 aa  461  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177722  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  67.49 
 
 		 323 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  67.49 
 
 		 323 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0544  phosphate binding protein  72.78 
 
 		 322 aa  442  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1210  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  68.23 
 
 		 319 aa  440  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2399  phosphate binding protein  64.13 
 
 		 332 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.427135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2653  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  59.44 
 
 		 323 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0957  phosphate binding protein  61.59 
 
 		 324 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.086307  normal  0.163139 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0096  phosphate binding protein  57.28 
 
 		 321 aa  384  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0255  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  54.52 
 
 		 325 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1113  phosphate binding protein  58.72 
 
 		 319 aa  381  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847548 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3157  phosphate binding protein  59.69 
 
 		 321 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01028  hypothetical protein  56.31 
 
 		 321 aa  378  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004383  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  53.56 
 
 		 319 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0618  phosphate binding protein  59.5 
 
 		 321 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2455  hypothetical protein  56.91 
 
 		 329 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0655  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  62.16 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.952816  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3274  phosphate binding protein  56.82 
 
 		 354 aa  347  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1306  phosphate binding protein  55.94 
 
 		 320 aa  346  4e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.259605 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3284  phosphate binding protein  56.17 
 
 		 354 aa  344  1e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0271757 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3134  phosphate-binding protein  56.17 
 
 		 348 aa  344  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1010  phosphate binding protein  52.98 
 
 		 312 aa  330  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3300  phosphate binding protein  53.33 
 
 		 312 aa  330  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1043  phosphate binding protein  59.65 
 
 		 312 aa  328  8e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3104  phosphate binding protein  54.74 
 
 		 324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03438  putative phosphate ABC transporter  52.63 
 
 		 316 aa  318  6e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2913  phosphate binding protein  53.68 
 
 		 311 aa  309  5e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3268  phosphate binding protein  50.18 
 
 		 330 aa  286  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.889504  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  35.74 
 
 		 270 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  34.04 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  32.06 
 
 		 285 aa  135  9e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  35.06 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  33.84 
 
 		 272 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  33.84 
 
 		 301 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  32.09 
 
 		 278 aa  132  9e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  33.84 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  33.84 
 
 		 272 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  32.46 
 
 		 268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  31.91 
 
 		 284 aa  126  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  31.62 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  30.8 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  31.94 
 
 		 267 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  30 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  32.34 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  30.3 
 
 		 274 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  29.78 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  33.21 
 
 		 381 aa  112  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  30.74 
 
 		 332 aa  112  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  31.72 
 
 		 281 aa  112  9e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  32.33 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  30.42 
 
 		 273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.07 
 
 		 325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  27.17 
 
 		 273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  31.18 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3266  phosphate-binding protein  25.81 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  30.29 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  30.26 
 
 		 272 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  28.8 
 
 		 285 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  31.56 
 
 		 281 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.81 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  31.78 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  30.94 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  32.97 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  30.92 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  32.44 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0047  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  25 
 
 		 269 aa  106  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  28.32 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  31.41 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  26.9 
 
 		 558 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  29.59 
 
 		 337 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.84 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  30.77 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  30.68 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  29.22 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  32.1 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>