More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2747 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2747  phosphate binding protein  100 
 
 		 323 aa  664    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000097067  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  91.64 
 
 		 323 aa  621  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3450  phosphate binding protein  92.57 
 
 		 323 aa  623  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00138297  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  88.85 
 
 		 323 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2766  phosphate binding protein  87.31 
 
 		 323 aa  600  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1560  phosphate-binding protein  86.38 
 
 		 323 aa  598  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1380  phosphate binding protein  86.38 
 
 		 323 aa  597  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000270515  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1405  phosphate binding protein  86.38 
 
 		 323 aa  597  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000717575  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1366  phosphate binding protein  86.38 
 
 		 323 aa  597  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00814513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2979  phosphate binding protein  86.38 
 
 		 323 aa  597  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0450601  normal  0.0144524 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2707  phosphate binding protein  85.76 
 
 		 323 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000109138  hitchhiker  0.00000175354 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2775  phosphate binding protein  85.45 
 
 		 323 aa  591  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000207455  decreased coverage  0.000220712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2877  phosphate binding protein  85.76 
 
 		 323 aa  593  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027974  hitchhiker  0.000116468 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  85.45 
 
 		 323 aa  587  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1076  phosphate-binding protein  86.38 
 
 		 323 aa  585  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000178631  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2553  phosphate binding protein  85.14 
 
 		 323 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177722  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70860  hypothetical protein  70.28 
 
 		 323 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.60906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6148  hypothetical protein  70.59 
 
 		 323 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1210  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  72.82 
 
 		 319 aa  465  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0179  phosphate binding protein  68.94 
 
 		 322 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5041  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  68.52 
 
 		 332 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5376  phosphate binding protein  69.97 
 
 		 332 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5329  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  69.97 
 
 		 332 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0861464  hitchhiker  0.00379996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5615  phosphate binding protein  69.75 
 
 		 333 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426736  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0145  phosphate binding protein  70.28 
 
 		 332 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.528128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5487  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  66.36 
 
 		 332 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5237  phosphate binding protein  69.66 
 
 		 332 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184797  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4417  phosphate binding protein  68.85 
 
 		 322 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2399  phosphate binding protein  64.72 
 
 		 332 aa  449  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.427135  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48600  Phosphate-binding protein PstS  69.57 
 
 		 322 aa  444  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0096  phosphate binding protein  62.5 
 
 		 321 aa  424  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0544  phosphate binding protein  68.37 
 
 		 322 aa  414  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1113  phosphate binding protein  60.81 
 
 		 319 aa  412  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847548 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0255  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  57.63 
 
 		 325 aa  413  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01028  hypothetical protein  59.49 
 
 		 321 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2653  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  59.13 
 
 		 323 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004383  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  58.62 
 
 		 319 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0957  phosphate binding protein  60.54 
 
 		 324 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.086307  normal  0.163139 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2455  hypothetical protein  58.81 
 
 		 329 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0618  phosphate binding protein  57.73 
 
 		 321 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3157  phosphate binding protein  57.33 
 
 		 321 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0655  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  59.37 
 
 		 333 aa  350  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.952816  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3300  phosphate binding protein  54.93 
 
 		 312 aa  342  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1306  phosphate binding protein  54.66 
 
 		 320 aa  342  7e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.259605 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1010  phosphate binding protein  54.58 
 
 		 312 aa  340  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3274  phosphate binding protein  52.37 
 
 		 354 aa  334  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3284  phosphate binding protein  54.28 
 
 		 354 aa  334  1e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0271757 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03438  putative phosphate ABC transporter  52.8 
 
 		 316 aa  333  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3134  phosphate-binding protein  54.61 
 
 		 348 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1043  phosphate binding protein  57.89 
 
 		 312 aa  322  7e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3104  phosphate binding protein  56.14 
 
 		 324 aa  321  8e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2913  phosphate binding protein  54.14 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3268  phosphate binding protein  48.2 
 
 		 330 aa  279  5e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.889504  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  36.78 
 
 		 270 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  35.56 
 
 		 330 aa  145  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  33.71 
 
 		 278 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  35.98 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  34.07 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  33.08 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  33.21 
 
 		 274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  34.1 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  33.33 
 
 		 272 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  33.33 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  33.33 
 
 		 272 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  34.21 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  32.06 
 
 		 274 aa  132  6e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  32.96 
 
 		 274 aa  132  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  34.44 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  30.1 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  32.49 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  31.34 
 
 		 272 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  32.2 
 
 		 267 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  29.96 
 
 		 278 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  32.22 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  31.11 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  30.08 
 
 		 273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  30.51 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0047  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  25.08 
 
 		 269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  32.44 
 
 		 270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3266  phosphate-binding protein  28.21 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  29.85 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  31.49 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  27.81 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  29.28 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  30.8 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  29.23 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.32 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  28.85 
 
 		 281 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2478  phosphate binding protein  29.68 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  29.86 
 
 		 338 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  28.78 
 
 		 283 aa  102  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13780  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  29.12 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0228402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  29.78 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  28.83 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  30.5 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  27.39 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  30.27 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3650  OmpA/MotB  33.61 
 
 		 444 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  29.23 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  27.02 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>