More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0179 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_0179  phosphate binding protein  100 
 
 
322 aa  654    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48600  Phosphate-binding protein PstS  88.2 
 
 
322 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5487  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  77.4 
 
 
332 aa  528  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70860  hypothetical protein  79.88 
 
 
323 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.60906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6148  hypothetical protein  79.57 
 
 
323 aa  527  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5615  phosphate binding protein  79.88 
 
 
333 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426736  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5329  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  80.19 
 
 
332 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0861464  hitchhiker  0.00379996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5041  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  76.78 
 
 
332 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5376  phosphate binding protein  79.57 
 
 
332 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.572014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5237  phosphate binding protein  79.88 
 
 
332 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184797  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0145  phosphate binding protein  79.57 
 
 
332 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.528128  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1560  phosphate-binding protein  70.19 
 
 
323 aa  486  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4417  phosphate binding protein  73.52 
 
 
322 aa  483  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1366  phosphate binding protein  69.88 
 
 
323 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00814513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1405  phosphate binding protein  69.88 
 
 
323 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000717575  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2707  phosphate binding protein  70.19 
 
 
323 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000109138  hitchhiker  0.00000175354 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2775  phosphate binding protein  69.88 
 
 
323 aa  478  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000207455  decreased coverage  0.000220712 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2766  phosphate binding protein  70.19 
 
 
323 aa  479  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366631  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  69.88 
 
 
323 aa  480  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2877  phosphate binding protein  70.19 
 
 
323 aa  479  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027974  hitchhiker  0.000116468 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2979  phosphate binding protein  69.88 
 
 
323 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0450601  normal  0.0144524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1380  phosphate binding protein  69.88 
 
 
323 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000270515  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2553  phosphate binding protein  69.25 
 
 
323 aa  476  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177722  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2747  phosphate binding protein  68.94 
 
 
323 aa  477  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000097067  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  68.63 
 
 
323 aa  474  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3450  phosphate binding protein  68.32 
 
 
323 aa  472  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00138297  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1076  phosphate-binding protein  70.19 
 
 
323 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000178631  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  67.08 
 
 
323 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1210  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  70.13 
 
 
319 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2399  phosphate binding protein  67.55 
 
 
332 aa  441  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.427135  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0544  phosphate binding protein  69.97 
 
 
322 aa  434  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2653  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  60.99 
 
 
323 aa  425  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0957  phosphate binding protein  63.25 
 
 
324 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.086307  normal  0.163139 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0255  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  55.94 
 
 
325 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01028  hypothetical protein  59.93 
 
 
321 aa  402  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1113  phosphate binding protein  61.62 
 
 
319 aa  401  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.847548 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004383  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  54.66 
 
 
319 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0096  phosphate binding protein  57.76 
 
 
321 aa  397  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2455  hypothetical protein  59.73 
 
 
329 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0618  phosphate binding protein  61.39 
 
 
321 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3157  phosphate binding protein  58.57 
 
 
321 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0655  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  58.26 
 
 
333 aa  363  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.952816  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3274  phosphate binding protein  54.58 
 
 
354 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3284  phosphate binding protein  54.58 
 
 
354 aa  350  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0271757 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3134  phosphate-binding protein  54.58 
 
 
348 aa  349  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1010  phosphate binding protein  54.93 
 
 
312 aa  347  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3300  phosphate binding protein  50.79 
 
 
312 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1043  phosphate binding protein  57.75 
 
 
312 aa  333  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1306  phosphate binding protein  52.5 
 
 
320 aa  331  8e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.259605 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03438  putative phosphate ABC transporter  52.58 
 
 
316 aa  329  4e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3104  phosphate binding protein  54.74 
 
 
324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2913  phosphate binding protein  53.79 
 
 
311 aa  324  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3268  phosphate binding protein  47.37 
 
 
330 aa  291  7e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.889504  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  32.82 
 
 
270 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  32.57 
 
 
285 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  30.92 
 
 
272 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  30.92 
 
 
272 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  30.92 
 
 
272 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  31.82 
 
 
278 aa  135  9e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  32.47 
 
 
303 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  33.33 
 
 
268 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  32.06 
 
 
301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  31.34 
 
 
284 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  30.42 
 
 
274 aa  123  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  31 
 
 
302 aa  122  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  33.21 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  31.84 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  28.63 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  31.6 
 
 
330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  29.52 
 
 
274 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  29.21 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  29.08 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  30.15 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0047  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  25.48 
 
 
269 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134705  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  29.3 
 
 
332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  28.71 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  31.16 
 
 
273 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  30.51 
 
 
281 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  28.31 
 
 
283 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  29.21 
 
 
281 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  27.7 
 
 
328 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  29.26 
 
 
269 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  29.78 
 
 
280 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  29.28 
 
 
279 aa  107  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  27.99 
 
 
337 aa  106  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.06 
 
 
272 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  28.68 
 
 
272 aa  105  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  30.69 
 
 
299 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  27.1 
 
 
273 aa  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.52 
 
 
276 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  29.88 
 
 
302 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  30.04 
 
 
282 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28890  periplasmic phosphate binding protein  31.43 
 
 
428 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.938585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  30.28 
 
 
281 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  30.84 
 
 
276 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0357  phosphate binding protein  29.05 
 
 
376 aa  103  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129882  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  28.24 
 
 
281 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  29.15 
 
 
464 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  28.11 
 
 
271 aa  102  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  28.48 
 
 
313 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>