More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2653 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2653  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  100 
 
 
323 aa  664    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0957  phosphate binding protein  70.1 
 
 
324 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.086307  normal  0.163139 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4417  phosphate binding protein  63.75 
 
 
322 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0096  phosphate binding protein  67.22 
 
 
321 aa  427  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1113  phosphate binding protein  64.69 
 
 
319 aa  422  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.847548 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70860  hypothetical protein  62.08 
 
 
323 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.60906 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2979  phosphate binding protein  59.44 
 
 
323 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0450601  normal  0.0144524 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1560  phosphate-binding protein  59.75 
 
 
323 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1405  phosphate binding protein  59.44 
 
 
323 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000717575  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1366  phosphate binding protein  59.44 
 
 
323 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00814513  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0179  phosphate binding protein  63.64 
 
 
322 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6148  hypothetical protein  61.74 
 
 
323 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1380  phosphate binding protein  59.44 
 
 
323 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000270515  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5487  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  59.88 
 
 
332 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5041  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  60.49 
 
 
332 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2399  phosphate binding protein  61.41 
 
 
332 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.427135  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2775  phosphate binding protein  59.13 
 
 
323 aa  411  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000207455  decreased coverage  0.000220712 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2747  phosphate binding protein  59.13 
 
 
323 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000097067  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5329  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  62.63 
 
 
332 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0861464  hitchhiker  0.00379996 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2707  phosphate binding protein  59.13 
 
 
323 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000109138  hitchhiker  0.00000175354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2877  phosphate binding protein  59.13 
 
 
323 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027974  hitchhiker  0.000116468 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  59.44 
 
 
323 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1210  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  60.74 
 
 
319 aa  405  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5237  phosphate binding protein  62.29 
 
 
332 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184797  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0544  phosphate binding protein  59.49 
 
 
322 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  57.59 
 
 
323 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3450  phosphate binding protein  57.28 
 
 
323 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00138297  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0145  phosphate binding protein  61.28 
 
 
332 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.528128  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5376  phosphate binding protein  61.95 
 
 
332 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.572014 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2553  phosphate binding protein  58.2 
 
 
323 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177722  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  57.1 
 
 
323 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1076  phosphate-binding protein  59.13 
 
 
323 aa  401  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000178631  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5615  phosphate binding protein  60.4 
 
 
333 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426736  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2766  phosphate binding protein  57.1 
 
 
323 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366631  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48600  Phosphate-binding protein PstS  63.3 
 
 
322 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0618  phosphate binding protein  58.62 
 
 
321 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01028  hypothetical protein  54.19 
 
 
321 aa  363  3e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004383  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  52.48 
 
 
319 aa  359  4e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0255  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  52.55 
 
 
325 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3157  phosphate binding protein  54.55 
 
 
321 aa  357  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2455  hypothetical protein  59.01 
 
 
329 aa  353  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0655  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  59.32 
 
 
333 aa  351  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.952816  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1306  phosphate binding protein  50.32 
 
 
320 aa  321  9.999999999999999e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.259605 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03438  putative phosphate ABC transporter  52.08 
 
 
316 aa  314  9.999999999999999e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1010  phosphate binding protein  50.18 
 
 
312 aa  302  6.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3300  phosphate binding protein  49.47 
 
 
312 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3104  phosphate binding protein  50.69 
 
 
324 aa  293  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2913  phosphate binding protein  51.58 
 
 
311 aa  292  6e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1043  phosphate binding protein  51.75 
 
 
312 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3274  phosphate binding protein  50.18 
 
 
354 aa  285  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3284  phosphate binding protein  50.53 
 
 
354 aa  285  5e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0271757 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3134  phosphate-binding protein  50.53 
 
 
348 aa  286  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3268  phosphate binding protein  48.36 
 
 
330 aa  270  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.889504  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  40.38 
 
 
270 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  38.08 
 
 
272 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  38.08 
 
 
272 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  38.08 
 
 
272 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  34.62 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  34.57 
 
 
330 aa  132  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  34.21 
 
 
274 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  33.46 
 
 
278 aa  130  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  31.68 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  33.96 
 
 
284 aa  126  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  31.48 
 
 
274 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  32.7 
 
 
301 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  32.32 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  32.72 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  34.05 
 
 
302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  30.42 
 
 
302 aa  113  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  31.18 
 
 
267 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  31.48 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  32.22 
 
 
332 aa  110  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  30.37 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  29.17 
 
 
273 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0047  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  26.92 
 
 
269 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134705  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  31.97 
 
 
328 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  31.18 
 
 
279 aa  102  9e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  28.52 
 
 
272 aa  102  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  31.23 
 
 
281 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  31.14 
 
 
381 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  29.71 
 
 
273 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  28.52 
 
 
284 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  30.42 
 
 
292 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.9 
 
 
325 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  30.92 
 
 
281 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  31.16 
 
 
287 aa  97.1  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  32.68 
 
 
281 aa  96.7  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  29.08 
 
 
272 aa  95.5  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.37 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  29.23 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  28.62 
 
 
283 aa  94  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  29.8 
 
 
278 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  29.67 
 
 
272 aa  93.6  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3266  phosphate-binding protein  25.64 
 
 
307 aa  93.6  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  30.77 
 
 
280 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  28.26 
 
 
273 aa  92.8  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  28.35 
 
 
272 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  27.95 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  29.77 
 
 
279 aa  90.5  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  29.5 
 
 
270 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.173796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>