More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004383 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004383  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  100 
 
 		 319 aa  660    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01028  hypothetical protein  85.44 
 
 		 321 aa  580  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0255  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  71.47 
 
 		 325 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2455  hypothetical protein  60.65 
 
 		 329 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2553  phosphate binding protein  58.31 
 
 		 323 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177722  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2775  phosphate binding protein  58.62 
 
 		 323 aa  408  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000207455  decreased coverage  0.000220712 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  58.31 
 
 		 323 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2747  phosphate binding protein  58.62 
 
 		 323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000097067  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1560  phosphate-binding protein  58.62 
 
 		 323 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  58.62 
 
 		 323 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1366  phosphate binding protein  57.99 
 
 		 323 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00814513  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1380  phosphate binding protein  57.99 
 
 		 323 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000270515  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2707  phosphate binding protein  58.62 
 
 		 323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000109138  hitchhiker  0.00000175354 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2766  phosphate binding protein  58.62 
 
 		 323 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366631  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2979  phosphate binding protein  57.99 
 
 		 323 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0450601  normal  0.0144524 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1405  phosphate binding protein  57.99 
 
 		 323 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000717575  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2877  phosphate binding protein  58.62 
 
 		 323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027974  hitchhiker  0.000116468 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  58.93 
 
 		 323 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1076  phosphate-binding protein  57.76 
 
 		 323 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000178631  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1210  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  59.33 
 
 		 319 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3450  phosphate binding protein  58.31 
 
 		 323 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00138297  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0179  phosphate binding protein  58.11 
 
 		 322 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4417  phosphate binding protein  56.07 
 
 		 322 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70860  hypothetical protein  58.92 
 
 		 323 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.60906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2399  phosphate binding protein  57.19 
 
 		 332 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.427135  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6148  hypothetical protein  58.59 
 
 		 323 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5615  phosphate binding protein  55.66 
 
 		 333 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426736  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5329  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  56.9 
 
 		 332 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0861464  hitchhiker  0.00379996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0145  phosphate binding protein  57.24 
 
 		 332 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.528128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5487  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  54.4 
 
 		 332 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5237  phosphate binding protein  56.9 
 
 		 332 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184797  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5376  phosphate binding protein  56.57 
 
 		 332 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5041  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  53.25 
 
 		 332 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48600  Phosphate-binding protein PstS  55.21 
 
 		 322 aa  361  7.0000000000000005e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2653  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  52.48 
 
 		 323 aa  359  4e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0544  phosphate binding protein  57.14 
 
 		 322 aa  357  9.999999999999999e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0957  phosphate binding protein  54.05 
 
 		 324 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.086307  normal  0.163139 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0096  phosphate binding protein  53.04 
 
 		 321 aa  353  1e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1113  phosphate binding protein  52.7 
 
 		 319 aa  346  3e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847548 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1010  phosphate binding protein  49.69 
 
 		 312 aa  324  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3300  phosphate binding protein  49.06 
 
 		 312 aa  322  4e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1043  phosphate binding protein  57.04 
 
 		 312 aa  322  7e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3104  phosphate binding protein  55.09 
 
 		 324 aa  318  6e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3157  phosphate binding protein  47.44 
 
 		 321 aa  317  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0618  phosphate binding protein  49.04 
 
 		 321 aa  316  4e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3134  phosphate-binding protein  49.68 
 
 		 348 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3284  phosphate binding protein  49.68 
 
 		 354 aa  311  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0271757 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3274  phosphate binding protein  49.35 
 
 		 354 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2913  phosphate binding protein  53.33 
 
 		 311 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03438  putative phosphate ABC transporter  50.35 
 
 		 316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0655  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  47.48 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.952816  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1306  phosphate binding protein  46.84 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.259605 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3268  phosphate binding protein  45.79 
 
 		 330 aa  255  9e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.889504  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  33.83 
 
 		 278 aa  142  7e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  31.3 
 
 		 270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  31.32 
 
 		 274 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  31.23 
 
 		 274 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  32.82 
 
 		 272 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  32.82 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  32.82 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  31.85 
 
 		 302 aa  125  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  30.47 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  30.53 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  30.15 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  30 
 
 		 268 aa  122  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  32.45 
 
 		 274 aa  122  9e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  29.77 
 
 		 284 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  31.62 
 
 		 330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  27.65 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  31.9 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  30.6 
 
 		 332 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  29.67 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  28.84 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0047  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  25.16 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  29.59 
 
 		 558 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  27.4 
 
 		 272 aa  99.8  6e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  28.95 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  29.28 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  28.89 
 
 		 283 aa  97.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.04 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  27.41 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  24.58 
 
 		 284 aa  96.3  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  31.58 
 
 		 278 aa  95.9  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  27.27 
 
 		 281 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4582  phosphate binding protein  32.17 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246324  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  27.17 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  27.67 
 
 		 272 aa  94  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  28.69 
 
 		 282 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  29.39 
 
 		 464 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  27.42 
 
 		 278 aa  93.6  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  26.97 
 
 		 272 aa  92.8  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  26.47 
 
 		 279 aa  92.4  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3818  OmpA/MotB domain protein  29.05 
 
 		 435 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0260085  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2689  hypothetical protein  30.08 
 
 		 465 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  28.57 
 
 		 218 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  28.2 
 
 		 281 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0494  phosphate binding protein  27.11 
 
 		 348 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  28.75 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  27.2 
 
 		 272 aa  90.9  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  29.58 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>