170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0661 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0661  extracellular solute-binding protein, family 1  100 
 
 		 277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.81727e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0648  extracellular solute-binding protein, family 1  82.55 
 
 		 275 aa  470  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117296  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0647  extracellular solute-binding protein, family 1  48.79 
 
 		 275 aa  254  8e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000964521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0660  extracellular solute-binding protein, family 1  48.51 
 
 		 276 aa  254  9e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5102800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0781  extracellular solute-binding protein  38.66 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3493  extracellular solute-binding protein  38.71 
 
 		 280 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0052  extracellular solute-binding protein  38.15 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3451  extracellular solute-binding protein, family 1  32.34 
 
 		 245 aa  152  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1735  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  32.77 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2771  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  25.37 
 
 		 274 aa  99.8  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2467  phosphate transport system substrate-binding protein  24.61 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0750  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.64 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1647  phosphate transport system substrate-binding protein  24.54 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4587  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.64 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.668295 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  25.29 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0681  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25.29 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.29 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.29 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0278418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0715  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25.29 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0844  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.29 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0770  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.29 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000063317 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0603  phosphate binding protein  24.03 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0631  phosphate binding protein  24.9 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.7 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  24.03 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2484  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0152963  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  24.82 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2676  hypothetical protein  27.53 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.829729 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  23.33 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0218  hypothetical protein  27.62 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  24.46 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  26.11 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  25.23 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  25.69 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  24.07 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0139  hypothetical protein  26.96 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11595  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  23.36 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  25.27 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  25.1 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  21.34 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3377  putative periplasmic phosphate-binding protein  23.5 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000468434  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  26.02 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  24.91 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  26.32 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  22.69 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3376  putative periplasmic phosphate-binding protein  24.29 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000120195  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0005  extracellular solute-binding protein, family 1  24.8 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25.34 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2212  putative phosphate ABC transporter  25.56 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  20.5 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  20.63 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  24.11 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0857  putative phosphate transport system substrate-binding protein  24.37 
 
 		 1035 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  24.89 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3836  putative periplasmic phosphate-binding protein  22.14 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  24.73 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  25.23 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  20.63 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03279  hypothetical protein  23.12 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.720807  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4737  hypothetical protein  23.12 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  24.26 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03231  hypothetical protein  23.12 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  23.78 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  21.18 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  24.44 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  20.37 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  20.96 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3898  putative periplasmic phosphate-binding protein  22.1 
 
 		 498 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal  0.815113 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0286  hypothetical protein  23.12 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3795  putative periplasmic phosphate-binding protein  22.09 
 
 		 486 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0718968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3729  putative periplasmic phosphate-binding protein  22.09 
 
 		 486 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  22.99 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3906  hypothetical protein  21.03 
 
 		 501 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3709  hypothetical protein  20.92 
 
 		 501 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.447391 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  23.13 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03232  hypothetical protein  21.39 
 
 		 501 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  24.44 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  25.8 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  21.84 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3626  hypothetical protein  21.39 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0285  hypothetical protein  21.39 
 
 		 505 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  26.41 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4738  hypothetical protein  20.9 
 
 		 471 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.21 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.63 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  26.9 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  23.79 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0220  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  20.36 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00000480634  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3708  hypothetical protein  22.11 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371578 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  23.37 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  22.14 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  20.74 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3625  hypothetical protein  22.61 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2133  hypothetical protein  20.69 
 
 		 903 aa  53.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0029443  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  23.16 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  24.64 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  25.58 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  26.7 
 
 		 332 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  24.77 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>