188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0218 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0218  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  522  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0139  hypothetical protein  54.55 
 
 		 265 aa  242  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11595  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2676  hypothetical protein  52.72 
 
 		 264 aa  239  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.829729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2771  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  30.04 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3331  extracellular solute-binding protein, family 1  29.44 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1967  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  28.09 
 
 		 862 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.543569  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.52 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  27.68 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0857  putative phosphate transport system substrate-binding protein  32.3 
 
 		 1035 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0648  extracellular solute-binding protein, family 1  26.53 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117296  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0661  extracellular solute-binding protein, family 1  27.38 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.81727e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0647  extracellular solute-binding protein, family 1  26.1 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000964521  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  24.67 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  28.57 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0052  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  27.44 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0603  phosphate binding protein  32.39 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1692  phosphate-binding protein PstS-like protein  31.28 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3451  extracellular solute-binding protein, family 1  27.43 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1794  phosphate-binding protein PstS-like protein  29.13 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1711  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  31.28 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.15 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.93 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.23 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  25 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3493  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  28.95 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0660  extracellular solute-binding protein, family 1  28.14 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5102800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0631  phosphate binding protein  31.14 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0750  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.94 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  26.01 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4587  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.27 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.668295 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.57 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  31.44 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  31.94 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0681  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25.91 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.91 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.91 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0278418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0715  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  27.04 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  24.14 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  28.32 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0844  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.04 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0770  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.04 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000063317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2467  phosphate transport system substrate-binding protein  23.67 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0220  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  23.48 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00000480634  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1735  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  27.98 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0547  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  31.16 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000976943  unclonable  2.05428e-28 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  29.21 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2048  hypothetical protein  25.43 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.897956 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2484  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0152963  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  30.37 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1584  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000121386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  30.87 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  26.56 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  25 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  30.67 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  28.04 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1647  phosphate transport system substrate-binding protein  22.49 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  24.38 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  30.65 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  27.01 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  41.56 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  24.9 
 
 		 482 aa  59.7  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  28.07 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  25.56 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  25.24 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  32.28 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  25.88 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0589  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.63 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000214948  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  25.24 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2133  hypothetical protein  31.14 
 
 		 903 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0029443  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  27 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3709  hypothetical protein  27.27 
 
 		 501 aa  57  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.447391 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  31.84 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3377  putative periplasmic phosphate-binding protein  21.08 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000468434  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0555  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  25.82 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000309892  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0556  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  23.59 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00147571  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.35 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2689  hypothetical protein  32.18 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  25.41 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3626  hypothetical protein  27.81 
 
 		 371 aa  57  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  30.19 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0285  hypothetical protein  26.79 
 
 		 505 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  23.78 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0417  OmpA/MotB domain protein  28.95 
 
 		 585 aa  56.6  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.846597  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1568  phosphate binding protein  30.97 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201952  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  27.78 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  31.06 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  28.72 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03232  hypothetical protein  26.32 
 
 		 501 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  42.68 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  27.54 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  33.7 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  25 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3836  putative periplasmic phosphate-binding protein  25.4 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  35.11 
 
 		 278 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  26.05 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>