134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0647 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0647  extracellular solute-binding protein, family 1  100 
 
 		 275 aa  564  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000964521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0660  extracellular solute-binding protein, family 1  87.32 
 
 		 276 aa  478  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5102800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0648  extracellular solute-binding protein, family 1  49.81 
 
 		 275 aa  275  8e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117296  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0661  extracellular solute-binding protein, family 1  47.91 
 
 		 277 aa  258  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.81727e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0781  extracellular solute-binding protein  38.01 
 
 		 281 aa  192  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3493  extracellular solute-binding protein  40.93 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3451  extracellular solute-binding protein, family 1  37.02 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0052  extracellular solute-binding protein  37.82 
 
 		 276 aa  159  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1735  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  29.2 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2771  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  28.02 
 
 		 274 aa  102  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2484  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0152963  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2467  phosphate transport system substrate-binding protein  22.8 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3331  extracellular solute-binding protein, family 1  25.09 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  26.14 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1647  phosphate transport system substrate-binding protein  24.16 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  22.58 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  22 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.72 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  21.71 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0218  hypothetical protein  26.73 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  25.91 
 
 		 274 aa  72  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2676  hypothetical protein  27.24 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.829729 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  23.88 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  23.44 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  24.07 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0631  phosphate binding protein  22.18 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  26.39 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  24.91 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0139  hypothetical protein  26.96 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11595  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0750  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  21.79 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0603  phosphate binding protein  21.84 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  25.78 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4587  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  21.4 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.668295 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  24.78 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  21.01 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0681  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  21.01 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  21.01 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  21.01 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0278418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0715  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  21.01 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0770  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  21.01 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000063317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0844  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  21.01 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  23.16 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  23.68 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  23.74 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  20.16 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  23.38 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  39.06 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0005  extracellular solute-binding protein, family 1  24.13 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  23.9 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0857  putative phosphate transport system substrate-binding protein  25.86 
 
 		 1035 aa  59.3  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.64 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  22.96 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  23.86 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  24.21 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03279  hypothetical protein  22.22 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.720807  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  19.76 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  23.4 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03231  hypothetical protein  22.22 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0286  hypothetical protein  22.22 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1379  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  32.71 
 
 		 327 aa  57  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000788807  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4737  hypothetical protein  22.22 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1350  putative periplasmic phosphate-binding protein  22.66 
 
 		 498 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592696 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  23.4 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  22.3 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  22.78 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  23.33 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3625  hypothetical protein  21.84 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  21.38 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  23.72 
 
 		 272 aa  52.4  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  26.55 
 
 		 283 aa  52.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  36.84 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  24.12 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  21.5 
 
 		 281 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3626  hypothetical protein  19.38 
 
 		 371 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0285  hypothetical protein  19.11 
 
 		 505 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0992  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  22.62 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2295  phosphate-binding protein  27.38 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2133  hypothetical protein  20.69 
 
 		 903 aa  50.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0029443  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  24.32 
 
 		 271 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  25.74 
 
 		 267 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0220  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  20.07 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00000480634  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03232  hypothetical protein  19.05 
 
 		 501 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  23.73 
 
 		 292 aa  49.3  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3836  putative periplasmic phosphate-binding protein  20.07 
 
 		 280 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3906  hypothetical protein  19.05 
 
 		 501 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3709  hypothetical protein  18.94 
 
 		 501 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.447391 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  20.51 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4738  hypothetical protein  19.05 
 
 		 471 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1794  phosphate-binding protein PstS-like protein  22.41 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  23.27 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  19.64 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3376  putative periplasmic phosphate-binding protein  19.02 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000120195  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  21.83 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  35.09 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0128  phosphate binding protein  20.18 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  24.33 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0589  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  24.29 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000214948  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  22.66 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  21.97 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>