172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3451 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3451  extracellular solute-binding protein, family 1  100 
 
 		 245 aa  495  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0052  extracellular solute-binding protein  45.02 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0648  extracellular solute-binding protein, family 1  34.04 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117296  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0647  extracellular solute-binding protein, family 1  37.02 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000964521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0660  extracellular solute-binding protein, family 1  37.02 
 
 		 276 aa  165  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5102800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0781  extracellular solute-binding protein  35.32 
 
 		 281 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0661  extracellular solute-binding protein, family 1  32.34 
 
 		 277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.81727e-24 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1735  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  32.52 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3493  extracellular solute-binding protein  34.47 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2771  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  26.69 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1647  phosphate transport system substrate-binding protein  27.71 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0139  hypothetical protein  27.82 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11595  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2467  phosphate transport system substrate-binding protein  22.73 
 
 		 292 aa  78.6  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  23.75 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2484  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0152963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3331  extracellular solute-binding protein, family 1  25.62 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  27.09 
 
 		 558 aa  72.8  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  22.78 
 
 		 279 aa  72  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1584  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000121386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0218  hypothetical protein  28.65 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2676  hypothetical protein  24.9 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.829729 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  22.18 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  22.63 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  25.93 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  26.43 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  26.32 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  22.87 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3836  putative periplasmic phosphate-binding protein  25.29 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  20.16 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3906  hypothetical protein  23.58 
 
 		 501 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  25.1 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  20.52 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  24.19 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3898  putative periplasmic phosphate-binding protein  25.38 
 
 		 498 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal  0.815113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4738  hypothetical protein  26.05 
 
 		 471 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3729  putative periplasmic phosphate-binding protein  25.38 
 
 		 486 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03232  hypothetical protein  23.11 
 
 		 501 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3709  hypothetical protein  22.64 
 
 		 501 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.447391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  23.77 
 
 		 669 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03279  hypothetical protein  24.38 
 
 		 330 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.720807  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  22.58 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4737  hypothetical protein  24.38 
 
 		 330 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3795  putative periplasmic phosphate-binding protein  25.38 
 
 		 486 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0718968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03231  hypothetical protein  24.38 
 
 		 330 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0286  hypothetical protein  24.38 
 
 		 330 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  21.31 
 
 		 285 aa  58.5  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  22.27 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  23.27 
 
 		 666 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  25.1 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3625  hypothetical protein  24.38 
 
 		 330 aa  57  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.37 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  19.74 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  23.46 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3650  OmpA/MotB  25.21 
 
 		 444 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  21.15 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  20.73 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3626  hypothetical protein  22.17 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0285  hypothetical protein  22.17 
 
 		 505 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1350  putative periplasmic phosphate-binding protein  24.77 
 
 		 498 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592696 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  25.48 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  21.6 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  20.33 
 
 		 284 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2295  phosphate-binding protein  20.07 
 
 		 304 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  24.78 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  25.79 
 
 		 299 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  24.2 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0128  phosphate binding protein  19.33 
 
 		 307 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3708  hypothetical protein  23.65 
 
 		 330 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371578 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  22.37 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  26.18 
 
 		 692 aa  52.8  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  22.63 
 
 		 272 aa  52.4  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  24.48 
 
 		 269 aa  52.4  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2212  putative phosphate ABC transporter  23.53 
 
 		 255 aa  52.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1784  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  23.55 
 
 		 346 aa  52.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3376  putative periplasmic phosphate-binding protein  21.24 
 
 		 335 aa  52  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000120195  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  23.87 
 
 		 272 aa  52  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  22.31 
 
 		 278 aa  52  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  24.55 
 
 		 333 aa  52  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  22.57 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2475  OmpA/MotB  25.66 
 
 		 447 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.201724  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  24.69 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  25 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3721  putative periplasmic phosphate-binding protein  30.83 
 
 		 124 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.449275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2437  OmpA/MotB domain-containing protein  26.96 
 
 		 460 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  22.8 
 
 		 313 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  21.52 
 
 		 277 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  22.76 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0005  extracellular solute-binding protein, family 1  29.89 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  21.12 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  21.43 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  22.75 
 
 		 325 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  22.76 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  24.66 
 
 		 274 aa  49.3  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0589  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  23.81 
 
 		 293 aa  49.3  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000214948  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3812  hypothetical membrane protein  29.29 
 
 		 106 aa  49.3  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843933  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.76 
 
 		 278 aa  48.9  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2689  hypothetical protein  26.43 
 
 		 465 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0263  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  25.1 
 
 		 347 aa  48.9  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  27.59 
 
 		 337 aa  48.5  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>