95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1735 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1735  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  100 
 
 		 266 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0052  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3451  extracellular solute-binding protein, family 1  32.52 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0781  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0660  extracellular solute-binding protein, family 1  29.72 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5102800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0648  extracellular solute-binding protein, family 1  32.65 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117296  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0647  extracellular solute-binding protein, family 1  29.2 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000964521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0661  extracellular solute-binding protein, family 1  32.77 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.81727e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3493  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 280 aa  108  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2771  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  25.94 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2467  phosphate transport system substrate-binding protein  21.92 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.7 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1647  phosphate transport system substrate-binding protein  22.75 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1350  putative periplasmic phosphate-binding protein  24.89 
 
 		 498 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0218  hypothetical protein  30.05 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3836  putative periplasmic phosphate-binding protein  23.56 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3898  putative periplasmic phosphate-binding protein  23.56 
 
 		 498 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal  0.815113 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3625  hypothetical protein  24.55 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0286  hypothetical protein  24.55 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4737  hypothetical protein  24.55 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03231  hypothetical protein  24.55 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03279  hypothetical protein  24.55 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.720807  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  24.89 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3729  putative periplasmic phosphate-binding protein  23.11 
 
 		 486 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3795  putative periplasmic phosphate-binding protein  23.11 
 
 		 486 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0718968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  23.83 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  24.62 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1794  phosphate-binding protein PstS-like protein  23.44 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  23.1 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3708  hypothetical protein  25.22 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2676  hypothetical protein  25 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.829729 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  23.63 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  20.36 
 
 		 288 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  20.73 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3331  extracellular solute-binding protein, family 1  24.72 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  23.05 
 
 		 272 aa  52.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1068  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  26.85 
 
 		 835 aa  52.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0358436  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  24.54 
 
 		 270 aa  52.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  21.58 
 
 		 272 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  21.69 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  22.94 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  20.96 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  22 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3721  putative periplasmic phosphate-binding protein  37.7 
 
 		 124 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.449275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  19.41 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  22.52 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  22.46 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  22.54 
 
 		 296 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  22.22 
 
 		 290 aa  49.7  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  23.39 
 
 		 276 aa  49.3  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  21.96 
 
 		 290 aa  48.9  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  22.52 
 
 		 276 aa  48.9  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1147  phosphate binding protein  18.87 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0139  hypothetical protein  25.67 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11595  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  25.62 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  24.43 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0889  hypothetical protein  20.19 
 
 		 444 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.181137  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  21.05 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  19.57 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0857  putative phosphate transport system substrate-binding protein  21.69 
 
 		 1035 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3377  putative periplasmic phosphate-binding protein  20 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000468434  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  22.67 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  23.08 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0128  phosphate binding protein  23.01 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1711  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  19.42 
 
 		 319 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  23.66 
 
 		 279 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2295  phosphate-binding protein  21.82 
 
 		 304 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1692  phosphate-binding protein PstS-like protein  19.42 
 
 		 319 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3906  hypothetical protein  18.78 
 
 		 501 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0631  phosphate binding protein  21.55 
 
 		 304 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0750  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  21.46 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  18.94 
 
 		 273 aa  44.7  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  23.16 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  19.56 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  19.26 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3709  hypothetical protein  19.82 
 
 		 501 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.447391 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  22.92 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  20 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  24.68 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4738  hypothetical protein  18.42 
 
 		 471 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0770  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.68 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000063317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0844  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.68 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0715  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  24.68 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3626  hypothetical protein  18.89 
 
 		 371 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.68 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0278418  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.68 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0681  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  24.68 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4587  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  21 
 
 		 300 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.668295 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2567  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  25 
 
 		 307 aa  42.7  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03232  hypothetical protein  17.9 
 
 		 501 aa  42.7  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0285  hypothetical protein  18.89 
 
 		 505 aa  42.7  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  25 
 
 		 558 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  23.02 
 
 		 272 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  23.02 
 
 		 272 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 		 268 aa  42.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>